G1025498



Basic Information


Item Value
gene id G1025498
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048575.1
NCBI id CM023229.2
chromosome length 86280908
location 83683265 ~ 83718776 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>TU1167108
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>TU1167109
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>TU1167107
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>TU1167111
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>TU1167114
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Function


NR:

description
iron-sulfur cluster assembly 1 homolog, mitochondrial

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1167108 False 1749 lncRNA 0.42 2 83683265 83718776
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TU1167107 False 1753 lncRNA 0.45 2 83716077 83717887
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TU1167113 False 1745 TUCP 0.45 3 83716077 83717887
TU1167114 False 1749 lncRNA 0.45 3 83716077 83717887
TU1167117 True 1683 lncRNA 0.45 4 83716077 83717887

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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LOC110536507 LOC105014547 coding downstream 394316 83064063 ~ 83288949 (-)
LOC100136308 LOC106570939 coding downstream 721234 82873779 ~ 82962031 (-)
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LOC118937424 NA coding downstream 812245 82868101 ~ 82871020 (-)
ypel1 ypel1 coding upstream 157158 83873900 ~ 83903039 (-)
LOC110536511 NA coding upstream 196037 83914813 ~ 83921303 (-)
LOC110535142 mapk1 coding upstream 203832 83922608 ~ 83982640 (-)
grsf1 grsf1 coding upstream 326736 84045512 ~ 84084200 (-)
adamts3 LOC107719190 coding upstream 516517 84235293 ~ 84426152 (-)
G1025514 NA non-coding downstream 14271 83668256 ~ 83668994 (-)
G1025497 LOC100380868 non-coding downstream 15106 83666345 ~ 83668159 (-)
G1025520 LOC100380868 non-coding downstream 38863 83636995 ~ 83644402 (-)
G1025533 NA non-coding downstream 39743 83643223 ~ 83643522 (-)
G1025521 NA non-coding downstream 50978 83631312 ~ 83632287 (-)
G1025557 NA non-coding upstream 3850 83722626 ~ 83722852 (-)
G1025558 NA non-coding upstream 5972 83724748 ~ 83725297 (-)
G1025559 NA non-coding upstream 6791 83725567 ~ 83726081 (-)
G1025560 NA non-coding upstream 9033 83727809 ~ 83728203 (-)
G1025563 LOC106600668 non-coding upstream 18492 83737268 ~ 83737630 (-)
G1025467 NA other downstream 56475 83544297 ~ 83626790 (-)
G1025481 NA other downstream 117691 83562302 ~ 83565574 (-)
LOC110536484 LOC106570928 other downstream 1424300 82257489 ~ 82522382 (-)
G1023858 NA other downstream 1768898 81912957 ~ 81914367 (-)
G1023618 NA other downstream 2066036 81615253 ~ 81617939 (-)
G1026586 NA other upstream 1468550 85187326 ~ 85197500 (-)
G1026978 NA other upstream 1894576 85613352 ~ 85614375 (-)
LOC118937426 LOC100380868 coding downstream 19077 83692703 ~ 83698034 (-)

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