G1026583


Basic Information

Item Value
gene id G1026583
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048575.1
NCBI id CM023229.2
chromosome length 86280908
location 85179466 ~ 85183417 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1168435
atgttgtagagggtagtatcctgtatatatcctgttgacatagtgaaggttatgttgtggagggtggtatcctgtatatgtcctggtgacatagtgaaggttatgttgtagaggatagtatcctgtatatgtcctggtgacatagtaaaggttatgttgtggagggtggtatcctgtatatgtcctggtgacatagtgttgtggagggtattaTCCTGtttatgtcctggtgacatagtgaagctTATGTTGTAGTggatagtatcctgtatatgtcctggtgacatagtgttgttgagggtagtatcctgtatatgtcatggtgacatagtgttgtggatgtagtatcctgtatatgccctggtgacatagtgttgtggatgtagtatcctgtatatgtcctggtgacatagtgaaggttatgttgtagaggatagtatcctgtatatgtcctggtgacatagtgttctggagtgtagtatcctgtatatgtcctggtgacatagtgttgtggagggtagtatcctgtatatgtcctggtgacatagtgaaggttatgtcgGAGAggatagtatcctgtatatgtcctggtgacatagtgttctggagtgtagtatcctgtatatgtcctggtgacatagtgttgtggagggtagtatcctgtatatgtcatggtgacatagtgttgtggatgtagtatcctgtatatgtcctggtgacatagtgttgtagagggtagtatcctgtatatgtcctggtgacatagtgaaggttatgttgtagagggtagtatcctgtatatgtcctggtgacataatgaaggttatgttgtggagggtggtatcctgtatatgtcctggtgacatagtgttgtggatggTATTATCCTGTATAtttcctggtgacatagtgaaagttatgttgtggagggtggtATCCTGTgaatgtcctggtgacatagtgtaggctatgttgtggagggtaataATCTGTATATTTC
>TU1168438
atgttgtagagggtagtatcctgtatatatcctgttgacatagtgaaggttatgttgtggagggtggtatcctgtatatgtcctggtgacatagtgaaggttatgttgtagaggatagtatcctgtatatgtcctggtgacatagtaaaggttatgttgtggagggtggtatcctgtatatgtcctggtgacatagtgttgtggagggtattaTCCTGtttatgtcctggtgacatagtgaagctTATGTTGTAGTggatagtatcctgtatatgtcctggtgacatagtgttgttgagggtagtatcctgtatatgtcatggtgacatagtgttgtggatgtagtatcctgtatatgccctggtgacatagtgttgtggatgtagtatcctgtatatgtcctggtgacatagtgaaggttatgttgtagaggatagtatcctgtatatgtcctggtgacatagtgttctggagtgtagtatcctgtatatgtcctggtgacatagtgttgtggagggtagtatcctgtatatgtcctggtgacatagtgaaggttatgtcgGAGAggatagtatcctgtatatgtcctggtgacatagtgttctggagtgtagtatcctgtatatgtcctggtgacatagtgttgtggagggtagtatcctgtatatgtcatggtgacatagtgttgtggatgtagtatcctgtatatgtcctggtgacatagtgttgtagagggtagtatcctgtatatgtcctggtgacatagtgaaggttatgttgtagagggtagtatcctgtatatgtcctggtgacataatgaaggttatgttgtggagggtggtatcctgtatatgtcctggtgacatagtgttgtggatggTATTATCCTGTATAtttcctggtgacatagtgaaagttatgttgtggagggtggtATCCTGTgaatgtcctggtgacatagtgtaggctatgttgtggagggtaataATCTGTATATTTC

Function

NR:

description
PREDICTED: histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-36 and H4 lysine-20 specific-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1168435 False 1000 lncRNA 0.42 2 85179466 85183417
TU1168438 True 1000 lncRNA 0.42 2 85179466 85181792

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118937429 dmrt3 coding downstream 57094 85046114 ~ 85122372 (-)
dmrt2a LOC106570979 coding downstream 213699 84961291 ~ 84965767 (-)
smarca2 NA coding downstream 459660 84501885 ~ 84719806 (-)
adamts3 LOC107719190 coding downstream 753314 84235293 ~ 84426152 (-)
grsf1 grsf1 coding downstream 1095266 84045512 ~ 84084200 (-)
kank1a kank1 coding upstream 56192 85239609 ~ 85392002 (-)
dapk1 dapk1 coding upstream 268768 85452185 ~ 85658741 (-)
LOC118937430 NA coding upstream 337162 85520579 ~ 85522516 (-)
tmem8b tmem8b coding upstream 858325 86041742 ~ 86232638 (-)
G1026574 NA non-coding downstream 3167 85176045 ~ 85176299 (-)
G1026569 NA non-coding downstream 10596 85168551 ~ 85168870 (-)
G1026562 NA non-coding downstream 15689 85163569 ~ 85163777 (-)
G1026558 NA non-coding downstream 17573 85161692 ~ 85161893 (-)
G1026552 NA non-coding downstream 19627 85159631 ~ 85159839 (-)
G1026584 NA non-coding upstream 1250 85184667 ~ 85198303 (-)
G1026586 NA non-coding upstream 3909 85187326 ~ 85197500 (-)
G1026750 NA non-coding upstream 85864 85269281 ~ 85271181 (-)
G1026754 NA non-coding upstream 111866 85295283 ~ 85295674 (-)
ypel1 ypel1 other downstream 1276427 83873900 ~ 83903039 (-)
G1025498 NA other downstream 1460858 83683265 ~ 83718776 (-)
G1025467 NA other downstream 1552676 83544297 ~ 83626790 (-)
G1025481 NA other downstream 1613892 83562302 ~ 83565574 (-)
LOC110536484 LOC106570928 other downstream 2920501 82257489 ~ 82522382 (-)
G1026978 NA other upstream 429935 85613352 ~ 85614375 (-)

Expression


Co-expression Network