sema4d (sema4d)


Basic Information

Item Value
gene id sema4d
gene name sema4d
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048576.1
NCBI id CM023230.2
chromosome length 102853256
location 9901109 ~ 9983793 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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Function

symbol description
sema4d Acts upstream of or within axon regeneration; brain development; and response to mechanical stimulus. Is expressed in several structures, including central nervous system; intermediate cell mass of mesoderm; musculature system; pleuroperitoneal region; and spinal cord neural tube. Orthologous to human SEMA4D (semaphorin 4D).

NR:

description
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RNA

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Neighbor

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rad1 rad1 coding downstream 1488 9897028 ~ 9899621 (-)
bxdc2 brix1 coding downstream 4237 9891603 ~ 9896872 (-)
dnajc21 dnajc21 coding downstream 13726 9876530 ~ 9887383 (-)
nedd4l nedd4l coding downstream 97573 9695082 ~ 9803536 (-)
LOC110536932 NA coding downstream 212054 9684834 ~ 9696461 (-)
zgc:86839 cks2 coding upstream 5461 9989254 ~ 9995515 (-)
LOC110536942 s1pr3 coding upstream 100139 10083932 ~ 10090132 (-)
LOC110536943 LOC106568492 coding upstream 152225 10136018 ~ 10169675 (-)
smad7 LOC106568470 coding upstream 593011 10576804 ~ 10623185 (-)
dym LOC106568469 coding upstream 652827 10636620 ~ 10848489 (-)
G1036674 agxt2 non-coding downstream 24824 9869880 ~ 9876285 (-)
G1036670 NA non-coding downstream 36372 9864274 ~ 9864737 (-)
G1036664 NA non-coding downstream 46082 9846631 ~ 9855027 (-)
G1036657 prlr non-coding downstream 63333 9835310 ~ 9837776 (-)
G1036655 NA non-coding downstream 66831 9833650 ~ 9834278 (-)
G1036735 NA non-coding upstream 53968 10037761 ~ 10040455 (-)
G1036739 NA non-coding upstream 61035 10044828 ~ 10045288 (-)
G1036753 NA non-coding upstream 93215 10077008 ~ 10080380 (-)
G1036754 NA non-coding upstream 98394 10082187 ~ 10083031 (-)
G1035717 NA other downstream 352974 9533500 ~ 9548135 (-)
hcn1 hcn1 other downstream 858429 9018507 ~ 9206417 (-)
G1035160 NA other downstream 1062275 8836256 ~ 8838834 (-)
G1034667 NA other downstream 1621243 8279339 ~ 8279866 (-)
LOC110536951 cr032 other upstream 866409 10850171 ~ 10860150 (-)
G1037216 NA other upstream 1119291 11103084 ~ 11103448 (-)
G1037217 NA other upstream 1122142 11105935 ~ 11106320 (-)
LOC110536956 LOC106568459 other upstream 1230158 11212672 ~ 11231102 (-)
G1038258 NA other upstream 1622558 11606351 ~ 11615943 (-)

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