LOC110537223 (LOC106568102)



Basic Information


Item Value
gene id LOC110537223
gene name LOC106568102
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048576.1
NCBI id CM023230.2
chromosome length 102853256
location 22769883 ~ 22779486 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>XM_021623102.2
TTCCTTTTCAATGACGACTACCCAGCAGACGTCATCACGATTGGGAGAGCAGCGCACCGCAGTTGTACCGCGTGGAAGCTCGGCATGAATTCCCCGGTGCAGAACAGAAGGCTACGGATTGTTTCTCACGTAAGCAATAGCTCGTAGATGTAAAGTTATTCGTCTTTAACGGATTGCTTCAAGTATTGACCTAATTTAACATATTTCTTTGCAATAATGGCGCTTTCCATTGCAACTGTATGGACAAGGTGCGTCACCGTTCTCTTTGTATTCAGCGCGATGTGGGGAATTGCTTTGTCCATTAATCGCTACTCTATTCCCGAGGAAATGCAAGAGGGTTCCGTTGTTGCAAACCTGGCTACAGATTTGGGACTTGACCTTCGCACTCTGATAACACGCAAGGCAAAGCTTGACATCATCCACAGAAACAAATATTTGGACATTAACAAAGAAACGGGAGACCTGTTCATACTTGAAAAGATAGATAGGGAATATATATGCTCGAGCAAGACAACGTCTTGTTTTCTGAAAATGGATGTCATATTTGAAAATCCCATTCGAATTTTTAACATTGAGCTTGAAATTATGGACATAAATGACAATGCACCGGTCTTTCGAAGGGAGACAATGCACTTGGATATTTCAGAATCTACCGCTGCAGGAGAGAGATTCTCTTTGACAAATGCTGTGGATGCAGATGTCGGTGCGAATTCTATTAAGACTTACTATTTAAGCGAAAGCAAGTCTTTTATAATTGACATACAGACGGGAAGCGATGGATCTAAATACGTAGATTTGGTTCTCAACAGTAATttagacagagaggaacaggcgGTTCATAATTTAATACTAACCGCTGTAGATGGCGGGGTCCCTGCACGCTCAGGCACAGCCAGTATCATCGTTAGGGTTCTGGATATCAATGACAACGCCCCTTTTTTTAACCAGCCGATATATGCTATTAATGTAACTGAGAACTCCCCAATTGGAACTCTAGTAATGACCTTGAACGCAACAGACTTGGACGAGGGCACTAACGCAGAGATTATATATTCATACACGTTATATACATCCGAGAAGACACAAGAAAAGTTCTCTCTAAATTCGAATACAGGGGAAATAAAGGTTAAGGATGTGATTGATTTTGAGGAGAGCCACAGTTTCGATATATATATTCAAGCCAGAGACCAAGGATCTAATTCGTTATCCGGAGATTGTAAAATAATGGTATTTATTACCGATCTGAATGACAACTATCCCGAGGTTACCATTAAATCTTTTAAAAGCACGCTCAAGGAAGATGTTGCCATAGGAACATTAATAGCAGTGATCAGTATAAGCGACAGGGACTCTGGGGACAACGGTGAAGTTGAGCTCACTTTGAACCAACAAACATCCCTACCTTTCGTTCTTAATAAGTCTTCGGAGGATTACTTTGCTCTGCATGTTTCAGAACCACTGGACCGTGAGACAATTCCAAGATATGAAATCACTTTCATAGTCACAGACAAAGGAACACCTCGCTTATCTGACAATGAGACAATCACCTTGGAGATACTGGATGTCAACGATAACTCGCCAATATTCCCCCAGTCGTTCTACACAATCCATGTTGTGGAGAACAACGTCCCCGGCGCACTGTTGACGTCACTCAGTGCTTTCGACCCGGACCTCCATGAGAACCAGTATCTGGTGTATTTTATCATGGAGAAGGAGATCCTTAACACATCTATGTCGATGCTTTTCTCTATTAATCCAGAGAATGGCAACCTTTATGCTCTGAAGACCTTTGActttgagagggagagggagttccTTTTCCACATAGAGGCCAGAGACTCTGGGGTACCTCCACTGAACAGCAATGTGACAGTTCACATCATCATTCTGGATCAGAATGACAACACCCCACTCATAGTGTCACCTTGGCGTGCGCAGGGCTCGGTTATTGAAGAGGTGATACCGAGGTCCACTGATAAAGGATTCCTAGTTGCCAAAGTAATCGCCATTGACGCAGACTCATTACAGAATTCACGGGTCACATATCAGCTTCTACAGATCAGTGACTCTAGCCTCTTCAGTCTAGATCAATACAATGGGGAGATCCGTACCACAAGAATGTTCAGCTATAGGGACCCCCGTCATCAGAGGCTGGTTGTTGTCGCCAAAGACAATGGAGACCCTGCTCTTTCCGCTACAGTCACCATCAAGATATCAACAGTAGAACACATGGTGACACCATTCTCAGAAACTACTGAGTTGCCTTTGGAATATGACTTGTTCACAGACTTAAATCTGTATTTGGTCATTGGTTTGGGCTCAGTATCCTTTCTGCTATTGATCACCATATTGGTGGTCATCGTGCTGAAGTGTCAGAAACCAAAGCCCTTGAAGATGCCTCCTGCTATGAATATGAATCTGAACAGTCTAAACAGGAACAGTGTGATCAGCAGAAACAGTATCATCAGCCAGAGGAGCTCTACCATAGCCGATTCCACCCTCATCTCCAGTGATGCCTACTGGTACAGCCTGTTTCTAGCAGAAACCAGGAAAGGCAAGGTGGTTGTCAGACAGCCTATAGTACCGAAGGGAGCAGGCTACTTTGTGTCCAGTATACCCAGAAGCACAGGGCCTACAGAGACCAGCGACTCAAGAGCATCCACGCTACAGGATTCCAGGGCCAGCAGTGACCTGCCATGATGTCCTCAATCTAGGGTATTCGGGTGCAGAACGTTCAAAGAAGTTAAGAGTGACCAACACGCCTCCTTCAATCACTGGGATCCAACAGTTACCTCTGGGGGCAGCTCGTCGAACCCTCTGCCCAAACATACCACACCAACCACCTCAGCAACTGTAGACTACCTTTATCATCTTCCATCAAGCATGAATCTGCATGGCTACATCAACAGGTACTTGTATTTAGAAAATATCATAAAGAAGAAAGGAACATCAAACACAAGGTCTTTCAGACAACATTGGACTGATGTTATTATGCATAGCACCCTCCCTGGGACTTTTGACTGTAAATGTGGGACCAGGCACTCAATATCTTCCAAAATCCTACCTTACCTCTCCAAGAAACACATTACACAAAAGGGAATTCTGTTTAGTCCTTGTGAGGATTCCTCATCATTGTGATGTCAATGCATTATTGGGGTATGTGTGAGAGGTCACAATATGGTCAATGCCATAACTCTGTTAGCTAGTGAAATAACTATCTTTGTTCATCTGTGAATGTGTAGTGTGCATAGATAACTTTTGTACATTTTGTTTAGAAATAATACTAAAGTTTTTCATCATTTGACTTTCTAGACCTTACCAATTTTCTTGAATGTGTTGGATTATGTTTTTGACTCTGAACATCAGCCTATGTTATGGGATTATTTATCTCCTGAGACATGGTATGGGATGTGCATGTTGAGTTGGTAACAATATAGATCAAGACCTCATACCTGTCATTCAATGAGCCAGGTAGGAGAGAAGTACCCCATCTTACTCCACTTCACATTGCAGACAGAGATAGCTAATATATTCTCACGGTTGAAATCTTCATGATCACATTTGACACTGACGCTATATTTAGTATATTTTGATGAGAAACATTTCCTGCTCagcatgtgtatatatatataaagcacaGACTATAATCAATTTTTTGTGTGAGAATCATGTCCAAGGAAAAACTCAGGACAGCGAGAAATACACAGATTTAGTTCCTACCTGCCTAAGCAGGACAATATGAGGGTCAAATGTAGCCAACACTGTATGTAGAATATCTGAGGCACTAAAGGGGTTCACTTTACAACAATTTATCATACCTCTGTCTGAGCCTTCTCAACTAAACTCCACAGGCCTCTGCCAGGTTCCAATTACTGTAACACTTACTCCATCCCACACTCCCAGTGTCCCTGTCACTGTGAACAAACCTCAGAGAATCAGCTAAAGGAGAATTCAGTGTTAAACAGGAAGCTTAGAGGAAGAAACCATGTGTACTTTATATGAGAAATGTTACTATATTCACTTAAAAAAATaagactgtttaaaaaaaaaaatgtattgttgtatatttgaaatgtatttatgttGGCATGGTGCAATACAATACTCTGGCCATGTTTTTAAAGTTTACAATGTTTTATGAATTGTCATGTTTTTATTGGATATTTTGAACTAACAATTGTTAACACTGCTTTTTATGTGACTTATTCAAGTACATTGTGTAGCCTACTGTATGACATTTGTATTGCAATACATCATTCAAATATTTTATCTGATACAGTGTACAGACAAACAATCTAAATTATTTTATGAAATGTGAATGTAGCGCTCCCCTGATTAAGAATTTAgccaaaatgttattttaaattTATAGACATATAGAGTATCTCTTCTCCCAGCAATACCCTGAAGTGCAGAGATTTAATGCAAGGAAATTTGGTCTTAGAAATGAGAAACTAGAACAGACAGCAGTATATACACGTCACAATGAAGGGAAAGGGccaaaagaaggagagagagagataaggagaaagAATCTGAAGACGAGTGAGACAGAAAGGGGGTTCCTTTGACGCCAGTGCATGTCATGTATGACCTTATAGGCCCTGCACTCACAATCCATCCAGTCTTCATTTGAAATGAAATACTGAACTTAaataatactgtatatatctcAATCATGTAGGTTTAATGGGAAAAACAATAAGCTATTCCTATTCACAGTGATTTCCACTGAATCCAGATCTGGCTACACCACTCATCTACCACAGGCTGCAGTGCAGTCATAGATTGAAGTTCTAATTAACTCTCCAATTCTCTCTTTATCAGTCTTTTCCTATTTAAAGCCCTGTGTGAATCATGACCTCACCTCCCGTCACAATGTGAGGTCACTGTTTGGGTCTGAGGGCTGATGGTGTTGGACACACAGCTGTCTGATTGCTACACTAATGATGTGGGCGCTGCCTGCTCTGCCTGTGGGGAGAATATGCTGCCTGAGCCTTGTATGAAGACACATTTATTACACATTTAGGCAACAGAAAATATTAAACTAAATTCAGACGTCATGAGCTCTTTATGGGTCTCCTGCATTATACCAGTACATGTGACTTGAGGAGAATGAGATGATGGTTCTTAATCCAGATTCAAGTCATGATTATTGCAAGGGATAAGATGTCATCTCGATTCATTTAGATCCCAGGCATTTGGAGAAAATCTCCCAAGCAGCCAGTGGCTGGGTGATTGGCTGATATGACCTGAGACCTTAAGCTCTACTTTGACAGTGGATGGGGTTTAAAACCTGTATCGGCGTATCTACTTTGTACTTTTTTAAAAATGCAATATACTTTTTATATCTGATGTAATCTCTGCACTTGGCTTGATGGTACAGGAGGGTGTCTGTGGTGCTTGCTTAAGTATCATGCAGATCATGTCTGTCTCTGTTGTGTAGCTACACTGCTTATTCCTGCATTATGATTCTATGGTCTGCCTGTATCTGCCTCCCTTTCTGTAGGGCTTCCTGTGTTATTTATAGGTGGGTGGGGGGCGGGGACACAACCCACAACGCTGATTGGCAGATGCGAGTTaaaaagtgagtgagagagaatggCATTgcttacatttttttattcaaaAACAGTTTGGATGTTGTTTCTGTTGCTTAAATGTCCTGCTTGTAGATGCTGGTGTCAATAAAGCTTTAAGATATGTGGT
>XM_021623103.2
TGTTCCTTTTCAATGACGACTACCCAGCAGACGTCATCACGATTGGGAGAGCAGCGCACCGCAGTTGTACCGCGTGGAAGCTCGGCATGAATTCCCCGGTGCAGAACAGAAGGCTACGGATTGTTTCTCACGTAAGCAATAGCTCGTAGATGTAAAGTTATTCGTCTTTAACGGATTGCTTCAAGTATTGACCTAATTTAACATATTTCTTTGCAATAATGGCGCTTTCCATTGCAACTGTATGGACAAGGTGCGTCACCGTTCTCTTTGTATTCAGCGCGATGTGGGGAATTGCTTTGTCCATTAATCGCTACTCTATTCCCGAGGAAATGCAAGAGGGTTCCGTTGTTGCAAACCTGGCTACAGATTTGGGACTTGACCTTCGCACTCTGATAACACGCAAGGCAAAGCTTGACATCATCCACAGAAACAAATATTTGGACATTAACAAAGAAACGGGAGACCTGTTCATACTTGAAAAGATAGATAGGGAATATATATGCTCGAGCAAGACAACGTCTTGTTTTCTGAAAATGGATGTCATATTTGAAAATCCCATTCGAATTTTTAACATTGAGCTTGAAATTATGGACATAAATGACAATGCACCGGTCTTTCGAAGGGAGACAATGCACTTGGATATTTCAGAATCTACCGCTGCAGGAGAGAGATTCTCTTTGACAAATGCTGTGGATGCAGATGTCGGTGCGAATTCTATTAAGACTTACTATTTAAGCGAAAGCAAGTCTTTTATAATTGACATACAGACGGGAAGCGATGGATCTAAATACGTAGATTTGGTTCTCAACAGTAATttagacagagaggaacaggcgGTTCATAATTTAATACTAACCGCTGTAGATGGCGGGGTCCCTGCACGCTCAGGCACAGCCAGTATCATCGTTAGGGTTCTGGATATCAATGACAACGCCCCTTTTTTTAACCAGCCGATATATGCTATTAATGTAACTGAGAACTCCCCAATTGGAACTCTAGTAATGACCTTGAACGCAACAGACTTGGACGAGGGCACTAACGCAGAGATTATATATTCATACACGTTATATACATCCGAGAAGACACAAGAAAAGTTCTCTCTAAATTCGAATACAGGGGAAATAAAGGTTAAGGATGTGATTGATTTTGAGGAGAGCCACAGTTTCGATATATATATTCAAGCCAGAGACCAAGGATCTAATTCGTTATCCGGAGATTGTAAAATAATGGTATTTATTACCGATCTGAATGACAACTATCCCGAGGTTACCATTAAATCTTTTAAAAGCACGCTCAAGGAAGATGTTGCCATAGGAACATTAATAGCAGTGATCAGTATAAGCGACAGGGACTCTGGGGACAACGGTGAAGTTGAGCTCACTTTGAACCAACAAACATCCCTACCTTTCGTTCTTAATAAGTCTTCGGAGGATTACTTTGCTCTGCATGTTTCAGAACCACTGGACCGTGAGACAATTCCAAGATATGAAATCACTTTCATAGTCACAGACAAAGGAACACCTCGCTTATCTGACAATGAGACAATCACCTTGGAGATACTGGATGTCAACGATAACTCGCCAATATTCCCCCAGTCGTTCTACACAATCCATGTTGTGGAGAACAACGTCCCCGGCGCACTGTTGACGTCACTCAGTGCTTTCGACCCGGACCTCCATGAGAACCAGTATCTGGTGTATTTTATCATGGAGAAGGAGATCCTTAACACATCTATGTCGATGCTTTTCTCTATTAATCCAGAGAATGGCAACCTTTATGCTCTGAAGACCTTTGActttgagagggagagggagttccTTTTCCACATAGAGGCCAGAGACTCTGGGGTACCTCCACTGAACAGCAATGTGACAGTTCACATCATCATTCTGGATCAGAATGACAACACCCCACTCATAGTGTCACCTTGGCGTGCGCAGGGCTCGGTTATTGAAGAGGTGATACCGAGGTCCACTGATAAAGGATTCCTAGTTGCCAAAGTAATCGCCATTGACGCAGACTCATTACAGAATTCACGGGTCACATATCAGCTTCTACAGATCAGTGACTCTAGCCTCTTCAGTCTAGATCAATACAATGGGGAGATCCGTACCACAAGAATGTTCAGCTATAGGGACCCCCGTCATCAGAGGCTGGTTGTTGTCGCCAAAGACAATGGAGACCCTGCTCTTTCCGCTACAGTCACCATCAAGATATCAACAGTAGAACACATGGTGACACCATTCTCAGAAACTACTGAGTTGCCTTTGGAATATGACTTGTTCACAGACTTAAATCTGTATTTGGTCATTGGTTTGGGCTCAGTATCCTTTCTGCTATTGATCACCATATTGGTGGTCATCGTGCTGAAGTGTCAGAAACCAAAGCCCTTGAAGATGCCTCCTGCTATGAATATGAATCTGAACAGTCTAAACAGGAACAGTGTGATCAGCAGAAACAGTATCATCAGCCAGAGGAGCTCTACCATAGCCGATTCCACCCTCATCTCCAGTGATGCCTACTGGTACAGCCTGTTTCTAGCAGAAACCAGGAAAGGCAAGGTGGTTGTCAGACAGCCTATAGTACCGAAGGGAGCAGGCTACTTTGTGTCCAGTATACCCAGAAGCACAGGGCCTACAGAGACCAGCGACTCAAGAGCATCCACGCTACAGTACTCAAAATGAAAGGAAGCCCATTCTACAGCTGGAGGATTCCAGGGCCAGCAGTGACCTGCCATGATGTCCTCAATCTAGGGTATTCGGGTGCAGAACGTTCAAAGAAGTTAAGAGTGACCAACACGCCTCCTTCAATCACTGGGATCCAACAGTTACCTCTGGGGGCAGCTCGTCGAACCCTCTGCCCAAACATACCACACCAACCACCTCAGCAACTGTAGACTACCTTTATCATCTTCCATCAAGCATGAATCTGCATGGCTACATCAACAGGTACTTGTATTTAGAAAATATCATAAAGAAGAAAGGAACATCAAACACAAGGTCTTTCAGACAACATTGGACTGATGTTATTATGCATAGCACCCTCCCTGGGACTTTTGACTGTAAATGTGGGACCAGGCACTCAATATCTTCCAAAATCCTACCTTACCTCTCCAAGAAACACATTACACAAAAGGGAATTCTGTTTAGTCCTTGTGAGGATTCCTCATCATTGTGATGTCAATGCATTATTGGGGTATGTGTGAGAGGTCACAATATGGTCAATGCCATAACTCTGTTAGCTAGTGAAATAACTATCTTTGTTCATCTGTGAATGTGTAGTGTGCATAGATAACTTTTGTACATTTTGTTTAGAAATAATACTAAAGTTTTTCATCATTTGACTTTCTAGACCTTACCAATTTTCTTGAATGTGTTGGATTATGTTTTTGACTCTGAACATCAGCCTATGTTATGGGATTATTTATCTCCTGAGACATGGTATGGGATGTGCATGTTGAGTTGGTAACAATATAGATCAAGACCTCATACCTGTCATTCAATGAGCCAGGTAGGAGAGAAGTACCCCATCTTACTCCACTTCACATTGCAGACAGAGATAGCTAATATATTCTCACGGTTGAAATCTTCATGATCACATTTGACACTGACGCTATATTTAGTATATTTTGATGAGAAACATTTCCTGCTCagcatgtgtatatatatataaagcacaGACTATAATCAATTTTTTGTGTGAGAATCATGTCCAAGGAAAAACTCAGGACAGCGAGAAATACACAGATTTAGTTCCTACCTGCCTAAGCAGGACAATATGAGGGTCAAATGTAGCCAACACTGTATGTAGAATATCTGAGGCACTAAAGGGGTTCACTTTACAACAATTTATCATACCTCTGTCTGAGCCTTCTCAACTAAACTCCACAGGCCTCTGCCAGGTTCCAATTACTGTAACACTTACTCCATCCCACACTCCCAGTGTCCCTGTCACTGTGAACAAACCTCAGAGAATCAGCTAAAGGAGAATTCAGTGTTAAACAGGAAGCTTAGAGGAAGAAACCATGTGTACTTTATATGAGAAATGTTACTATATTCACTTAAAAAAATaagactgtttaaaaaaaaaaatgtattgttgtatatttgaaatgtatttatgttGGCATGGTGCAATACAATACTCTGGCCATGTTTTTAAAGTTTACAATGTTTTATGAATTGTCATGTTTTTATTGGATATTTTGAACTAACAATTGTTAACACTGCTTTTTATGTGACTTATTCAAGTACATTGTGTAGCCTACTGTATGACATTTGTATTGCAATACATCATTCAAATATTTTATCTGATACAGTGTACAGACAAACAATCTAAATTATTTTATGAAATGTGAATGTAGCGCTCCCCTGATTAAGAATTTAgccaaaatgttattttaaattTATAGACATATAGAGTATCTCTTCTCCCAGCAATACCCTGAAGTGCAGAGATTTAATGCAAGGAAATTTGGTCTTAGAAATGAGAAACTAGAACAGACAGCAGTATATACACGTCACAATGAAGGGAAAGGGccaaaagaaggagagagagagataaggagaaagAATCTGAAGACGAGTGAGACAGAAAGGGGGTTCCTTTGACGCCAGTGCATGTCATGTATGACCTTATAGGCCCTGCACTCACAATCCATCCAGTCTTCATTTGAAATGAAATACTGAACTTAaataatactgtatatatctcAATCATGTAGGTTTAATGGGAAAAACAATAAGCTATTCCTATTCACAGTGATTTCCACTGAATCCAGATCTGGCTACACCACTCATCTACCACAGGCTGCAGTGCAGTCATAGATTGAAGTTCTAATTAACTCTCCAATTCTCTCTTTATCAGTCTTTTCCTATTTAAAGCCCTGTGTGAATCATGACCTCACCTCCCGTCACAATGTGAGGTCACTGTTTGGGTCTGAGGGCTGATGGTGTTGGACACACAGCTGTCTGATTGCTACACTAATGATGTGGGCGCTGCCTGCTCTGCCTGTGGGGAGAATATGCTGCCTGAGCCTTGTATGAAGACACATTTATTACACATTTAGGCAACAGAAAATATTAAACTAAATTCAGACGTCATGAGCTCTTTATGGGTCTCCTGCATTATACCAGTACATGTGACTTGAGGAGAATGAGATGATGGTTCTTAATCCAGATTCAAGTCATGATTATTGCAAGGGATAAGATGTCATCTCGATTCATTTAGATCCCAGGCATTTGGAGAAAATCTCCCAAGCAGCCAGTGGCTGGGTGATTGGCTGATATGACCTGAGACCTTAAGCTCTACTTTGACAGTGGATGGGGTTTAAAACCTGTATCGGCGTATCTACTTTGTACTTTTTTAAAAATGCAATATACTTTTTATATCTGATGTAATCTCTGCACTTGGCTTGATGGTACAGGAGGGTGTCTGTGGTGCTTGCTTAAGTATCATGCAGATCATGTCTGTCTCTGTTGTGTAGCTACACTGCTTATTCCTGCATTATGATTCTATGGTCTGCCTGTATCTGCCTCCCTTTCTGTAGGGCTTCCTGTGTTATTTATAGGTGGGTGGGGGGCGGGGACACAACCCACAACGCTGATTGGCAGATGCGAGTTaaaaagtgagtgagagagaatggCATTgcttacatttttttattcaaaAACAGTTTGGATGTTGTTTCTGTTGCTTAAATGTCCTGCTTGTAGATGCTGGTGTCAATAAAGCTTTAAGATATGTGGT
>XR_002475588.2
CTGTTCCTTTTCAATGACGACTACCCAGCAGACGTCATCACGATTGGGAGAGCAGCGCACCGCAGTTGTACCGCGTGGAAGCTCGGCATGAATTCCCCGGTGCAGAACAGAAGGCTACGGATTGTTTCTCACGTAAGCAATAGCTCGTAGATGTAAAGTTATTCGTCTTTAACGGATTGCTTCAAGTATTGACCTAATTTAACATATTTCTTTGCAATAATGGCGCTTTCCATTGCAACTGTATGGACAAGGTGCGTCACCGTTCTCTTTGTATTCAGCGCGATGTGGGGAATTGCTTTGTCCATTAATCGCTACTCTATTCCCGAGGAAATGCAAGAGGGTTCCGTTGTTGCAAACCTGGCTACAGATTTGGGACTTGACCTTCGCACTCTGATAACACGCAAGGCAAAGCTTGACATCATCCACAGAAACAAATATTTGGACATTAACAAAGAAACGGGAGACCTGTTCATACTTGAAAAGATAGATAGGGAATATATATGCTCGAGCAAGACAACGTCTTGTTTTCTGAAAATGGATGTCATATTTGAAAATCCCATTCGAATTTTTAACATTGAGCTTGAAATTATGGACATAAATGACAATGCACCGGTCTTTCGAAGGGAGACAATGCACTTGGATATTTCAGAATCTACCGCTGCAGGAGAGAGATTCTCTTTGACAAATGCTGTGGATGCAGATGTCGGTGCGAATTCTATTAAGACTTACTATTTAAGCGAAAGCAAGTCTTTTATAATTGACATACAGACGGGAAGCGATGGATCTAAATACGTAGATTTGGTTCTCAACAGTAATttagacagagaggaacaggcgGTTCATAATTTAATACTAACCGCTGTAGATGGCGGGGTCCCTGCACGCTCAGGCACAGCCAGTATCATCGTTAGGGTTCTGGATATCAATGACAACGCCCCTTTTTTTAACCAGCCGATATATGCTATTAATGTAACTGAGAACTCCCCAATTGGAACTCTAGTAATGACCTTGAACGCAACAGACTTGGACGAGGGCACTAACGCAGAGATTATATATTCATACACGTTATATACATCCGAGAAGACACAAGAAAAGTTCTCTCTAAATTCGAATACAGGGGAAATAAAGGTTAAGGATGTGATTGATTTTGAGGAGAGCCACAGTTTCGATATATATATTCAAGCCAGAGACCAAGGATCTAATTCGTTATCCGGAGATTGTAAAATAATGGTATTTATTACCGATCTGAATGACAACTATCCCGAGGTTACCATTAAATCTTTTAAAAGCACGCTCAAGGAAGATGTTGCCATAGGAACATTAATAGCAGTGATCAGTATAAGCGACAGGGACTCTGGGGACAACGGTGAAGTTGAGCTCACTTTGAACCAACAAACATCCCTACCTTTCGTTCTTAATAAGTCTTCGGAGGATTACTTTGCTCTGCATGTTTCAGAACCACTGGACCGTGAGACAATTCCAAGATATGAAATCACTTTCATAGTCACAGACAAAGGAACACCTCGCTTATCTGACAATGAGACAATCACCTTGGAGATACTGGATGTCAACGATAACTCGCCAATATTCCCCCAGTCGTTCTACACAATCCATGTTGTGGAGAACAACGTCCCCGGCGCACTGTTGACGTCACTCAGTGCTTTCGACCCGGACCTCCATGAGAACCAGTATCTGGTGTATTTTATCATGGAGAAGGAGATCCTTAACACATCTATGTCGATGCTTTTCTCTATTAATCCAGAGAATGGCAACCTTTATGCTCTGAAGACCTTTGActttgagagggagagggagttccTTTTCCACATAGAGGCCAGAGACTCTGGGGTACCTCCACTGAACAGCAATGTGACAGTTCACATCATCATTCTGGATCAGAATGACAACACCCCACTCATAGTGTCACCTTGGCGTGCGCAGGGCTCGGTTATTGAAGAGGTGATACCGAGGTCCACTGATAAAGGATTCCTAGTTGCCAAAGTAATCGCCATTGACGCAGACTCATTACAGAATTCACGGGTCACATATCAGCTTCTACAGATCAGTGACTCTAGCCTCTTCAGTCTAGATCAATACAATGGGGAGATCCGTACCACAAGAATGTTCAGCTATAGGGACCCCCGTCATCAGAGGCTGGTTGTTGTCGCCAAAGACAATGGAGACCCTGCTCTTTCCGCTACAGTCACCATCAAGATATCAACAGTAGAACACATGGTGACACCATTCTCAGAAACTACTGAGTTGCCTTTGGAATATGACTTGTTCACAGACTTAAATCTGTATTTGGTCATTGGTTTGGGCTCAGTATCCTTTCTGCTATTGATCACCATATTGGTGGTCATCGTGCTGAAGTGTCAGAAACCAAAGCCCTTGAAGATGCCTCCTGCTATGAATATGAATCTGAACAGTCTAAACAGGAACAGTGTGATCAGCAGAAACAGTATCATCAGCCAGAGGAGCTCTACCATAGCCGATTCCACCCTCATCTCCAGTGATGCCTACTGGTACAGCCTGTTTCTAGCAGAAACCAGGAAAGGCAAGGTGGTTGTCAGACAGCCTATAGTACCGAAGGGAGCAGGCTACTTTGTGTCCAGTATACCCAGAAGCACAGGGCCTACAGAGACCAGCGACTCAAGAGCATCCACGCTACAGTACTCAAAATGAAAGGAAGCCCATTCTACAGCTGGAGGTATGCTGGTTGCTGGTAACATGATGATTCCAGGGCCAGCAGTGACCTGCCATGATGTCCTCAATCTAGGGTATTCGGGTGCAGAACGTTCAAAGAAGTTAAGAGTGACCAACACGCCTCCTTCAATCACTGGGATCCAACAGTTACCTCTGGGGGCAGCTCGTCGAACCCTCTGCCCAAACATACCACACCAACCACCTCAGCAACTGTAGACTACCTTTATCATCTTCCATCAAGCATGAATCTGCATGGCTACATCAACAGGTACTTGTATTTAGAAAATATCATAAAGAAGAAAGGAACATCAAACACAAGGTCTTTCAGACAACATTGGACTGATGTTATTATGCATAGCACCCTCCCTGGGACTTTTGACTGTAAATGTGGGACCAGGCACTCAATATCTTCCAAAATCCTACCTTACCTCTCCAAGAAACACATTACACAAAAGGGAATTCTGTTTAGTCCTTGTGAGGATTCCTCATCATTGTGATGTCAATGCATTATTGGGGTATGTGTGAGAGGTCACAATATGGTCAATGCCATAACTCTGTTAGCTAGTGAAATAACTATCTTTGTTCATCTGTGAATGTGTAGTGTGCATAGATAACTTTTGTACATTTTGTTTAGAAATAATACTAAAGTTTTTCATCATTTGACTTTCTAGACCTTACCAATTTTCTTGAATGTGTTGGATTATGTTTTTGACTCTGAACATCAGCCTATGTTATGGGATTATTTATCTCCTGAGACATGGTATGGGATGTGCATGTTGAGTTGGTAACAATATAGATCAAGACCTCATACCTGTCATTCAATGAGCCAGGTAGGAGAGAAGTACCCCATCTTACTCCACTTCACATTGCAGACAGAGATAGCTAATATATTCTCACGGTTGAAATCTTCATGATCACATTTGACACTGACGCTATATTTAGTATATTTTGATGAGAAACATTTCCTGCTCagcatgtgtatatatatataaagcacaGACTATAATCAATTTTTTGTGTGAGAATCATGTCCAAGGAAAAACTCAGGACAGCGAGAAATACACAGATTTAGTTCCTACCTGCCTAAGCAGGACAATATGAGGGTCAAATGTAGCCAACACTGTATGTAGAATATCTGAGGCACTAAAGGGGTTCACTTTACAACAATTTATCATACCTCTGTCTGAGCCTTCTCAACTAAACTCCACAGGCCTCTGCCAGGTTCCAATTACTGTAACACTTACTCCATCCCACACTCCCAGTGTCCCTGTCACTGTGAACAAACCTCAGAGAATCAGCTAAAGGAGAATTCAGTGTTAAACAGGAAGCTTAGAGGAAGAAACCATGTGTACTTTATATGAGAAATGTTACTATATTCACTTAAAAAAATaagactgtttaaaaaaaaaaatgtattgttgtatatttgaaatgtatttatgttGGCATGGTGCAATACAATACTCTGGCCATGTTTTTAAAGTTTACAATGTTTTATGAATTGTCATGTTTTTATTGGATATTTTGAACTAACAATTGTTAACACTGCTTTTTATGTGACTTATTCAAGTACATTGTGTAGCCTACTGTATGACATTTGTATTGCAATACATCATTCAAATATTTTATCTGATACAGTGTACAGACAAACAATCTAAATTATTTTATGAAATGTGAATGTAGCGCTCCCCTGATTAAGAATTTAgccaaaatgttattttaaattTATAGACATATAGAGTATCTCTTCTCCCAGCAATACCCTGAAGTGCAGAGATTTAATGCAAGGAAATTTGGTCTTAGAAATGAGAAACTAGAACAGACAGCAGTATATACACGTCACAATGAAGGGAAAGGGccaaaagaaggagagagagagataaggagaaagAATCTGAAGACGAGTGAGACAGAAAGGGGGTTCCTTTGACGCCAGTGCATGTCATGTATGACCTTATAGGCCCTGCACTCACAATCCATCCAGTCTTCATTTGAAATGAAATACTGAACTTAaataatactgtatatatctcAATCATGTAGGTTTAATGGGAAAAACAATAAGCTATTCCTATTCACAGTGATTTCCACTGAATCCAGATCTGGCTACACCACTCATCTACCACAGGCTGCAGTGCAGTCATAGATTGAAGTTCTAATTAACTCTCCAATTCTCTCTTTATCAGTCTTTTCCTATTTAAAGCCCTGTGTGAATCATGACCTCACCTCCCGTCACAATGTGAGGTCACTGTTTGGGTCTGAGGGCTGATGGTGTTGGACACACAGCTGTCTGATTGCTACACTAATGATGTGGGCGCTGCCTGCTCTGCCTGTGGGGAGAATATGCTGCCTGAGCCTTGTATGAAGACACATTTATTACACATTTAGGCAACAGAAAATATTAAACTAAATTCAGACGTCATGAGCTCTTTATGGGTCTCCTGCATTATACCAGTACATGTGACTTGAGGAGAATGAGATGATGGTTCTTAATCCAGATTCAAGTCATGATTATTGCAAGGGATAAGATGTCATCTCGATTCATTTAGATCCCAGGCATTTGGAGAAAATCTCCCAAGCAGCCAGTGGCTGGGTGATTGGCTGATATGACCTGAGACCTTAAGCTCTACTTTGACAGTGGATGGGGTTTAAAACCTGTATCGGCGTATCTACTTTGTACTTTTTTAAAAATGCAATATACTTTTTATATCTGATGTAATCTCTGCACTTGGCTTGATGGTACAGGAGGGTGTCTGTGGTGCTTGCTTAAGTATCATGCAGATCATGTCTGTCTCTGTTGTGTAGCTACACTGCTTATTCCTGCATTATGATTCTATGGTCTGCCTGTATCTGCCTCCCTTTCTGTAGGGCTTCCTGTGTTATTTATAGGTGGGTGGGGGGCGGGGACACAACCCACAACGCTGATTGGCAGATGCGAGTTaaaaagtgagtgagagagaatggCATTgcttacatttttttattcaaaAACAGTTTGGATGTTGTTTCTGTTGCTTAAATGTCCTGCTTGTAGATGCTGGTGTCAATAAAGCTTTAAGATATGTGGT

Function


NR:

description
protocadherin alpha-C2-like isoform X2

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021623102.2 False 5709 mRNA 0.41 2 22769883 22779483
XM_021623103.2 False 5748 mRNA 0.41 3 22769883 22779485
XR_002475588.2 True 5774 mRNA 0.41 3 22769883 22779486

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
LOC110537220 NA coding downstream 12901 22693699 ~ 22756982 (-)
LOC110537219 LOC106603252 coding downstream 99205 22665662 ~ 22670678 (-)
LOC118937647 NA coding downstream 104265 22663283 ~ 22665618 (-)
LOC118937813 LOC106604822 coding downstream 106903 22659615 ~ 22662980 (-)
LOC118937649 LOC106603247 coding downstream 128664 22638989 ~ 22641219 (-)
LOC118937814 NA coding upstream 12622 22792108 ~ 22796733 (-)
LOC110537224 LOC106568099 coding upstream 44402 22823888 ~ 22859633 (-)
LOC110537225 LOC106568098 coding upstream 82776 22862262 ~ 22869968 (-)
LOC110537227 LOC106568097 coding upstream 99699 22879185 ~ 22881924 (-)
LOC118937815 LOC106568112 coding upstream 658232 23437718 ~ 23438711 (-)
G1049753 NA non-coding downstream 9490 22760152 ~ 22760393 (-)
G1049726 NA non-coding downstream 68911 22700598 ~ 22700972 (-)
G1049723 NA non-coding downstream 79889 22689756 ~ 22689994 (-)
G1049713 NA non-coding downstream 93703 22675442 ~ 22676180 (-)
G1049711 NA non-coding downstream 96821 22672764 ~ 22673062 (-)
G1050155 NA non-coding upstream 41555 22821041 ~ 22821486 (-)
G1050156 NA non-coding upstream 42030 22821516 ~ 22821718 (-)
G1050157 NA non-coding upstream 42730 22822216 ~ 22822439 (-)
G1050165 NA non-coding upstream 48759 22828245 ~ 22829107 (-)
G1050227 NA non-coding upstream 211524 22991010 ~ 22992778 (-)
G1049722 NA other downstream 80286 22689161 ~ 22689597 (-)
LOC110536820 LOC106603249 other downstream 128284 22607858 ~ 22654480 (-)
LOC110537218 LOC106568105 other downstream 223226 22540032 ~ 22546807 (-)
G1049389 NA other downstream 429374 22337086 ~ 22340509 (-)
G1049089 NA other downstream 644979 22113948 ~ 22178642 (-)
G1050429 NA other upstream 464151 23243637 ~ 23244270 (-)
G1052040 acaca other upstream 1775211 24554697 ~ 24555000 (-)
LOC118936414 NA other upstream 1824794 24600309 ~ 24607820 (-)
G1054211 NA other upstream 2844393 25623879 ~ 25624637 (-)
G1054232 NA other upstream 2877783 25657269 ~ 25659005 (-)

Expression



Co-expression Network