nova1 (LOC106567594)


Basic Information

Item Value
gene id nova1
gene name LOC106567594
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048576.1
NCBI id CM023230.2
chromosome length 102853256
location 44479843 ~ 44519222 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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XM_036937630.1 True 9019 mRNA 0.41 4 44479843 44519222

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC110537656 capns1 coding downstream 40565 44430070 ~ 44439278 (-)
LOC110538901 LOC106603699 coding downstream 81875 44391032 ~ 44397968 (-)
LOC110537655 LOC106567623 coding downstream 90989 44377943 ~ 44388854 (-)
LOC110537654 LOC106567624 coding downstream 106646 44332876 ~ 44373197 (-)
LOC118937885 NA coding upstream 45002 44564224 ~ 44569140 (-)
LOC110537661 LOC101073377 coding upstream 76312 44546519 ~ 44601149 (-)
plekhb1 plekhb1 coding upstream 87940 44607162 ~ 44610310 (-)
LOC110537668 LOC106603713 coding upstream 364571 44883793 ~ 44965601 (-)
LOC110537669 LOC106567584 coding upstream 452776 44971998 ~ 45021139 (-)
G1076464 NA non-coding downstream 1684 44477370 ~ 44478159 (-)
G1076465 NA non-coding downstream 2598 44476294 ~ 44477245 (-)
G1076475 NA non-coding downstream 6653 44472842 ~ 44473190 (-)
G1076474 NA non-coding downstream 7808 44471669 ~ 44472035 (-)
G1076458 NA non-coding downstream 27159 44452484 ~ 44452684 (-)
G1076519 NA non-coding upstream 33722 44552944 ~ 44554283 (-)
G1076534 NA non-coding upstream 64168 44583390 ~ 44584542 (-)
G1076549 NA non-coding upstream 83094 44602316 ~ 44603294 (-)
G1076588 NA non-coding upstream 173640 44692862 ~ 44697846 (-)
G1076610 NA non-coding upstream 185007 44704229 ~ 44733447 (-)
G1076460 NA other downstream 24573 44454648 ~ 44455270 (-)
G1075509 NA other downstream 705418 43774064 ~ 43774425 (-)
G1075399 NA other downstream 819006 43660559 ~ 43660837 (-)
G1075335 NA other downstream 915603 43563785 ~ 43564240 (-)
G1074731 NA other downstream 1765920 42704003 ~ 42713923 (-)
gria4b LOC106567580 other upstream 614630 45133844 ~ 45296904 (-)
G1078323 LOC106567565 other upstream 1683382 46202604 ~ 46206088 (-)
G1078783 NA other upstream 2297221 46816443 ~ 46817065 (-)
LOC110537706 LOC106567549 other upstream 3395329 47911648 ~ 47942039 (-)

Expression


Co-expression Network