LOC110537753 (LOC106567505)



Basic Information


Item Value
gene id LOC110537753
gene name LOC106567505
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048576.1
NCBI id CM023230.2
chromosome length 102853256
location 52087532 ~ 52124400 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>XM_021624115.2
GTTCAGTCGTGGAGTGCAGGCAATAGCAGCATAATATTTGGCTGTAAACACAGGCGGTCCTGTTGTCTCGATGCGAATCCTGGACTTTTAGGGTACAGTGAGTGAGTGTTTCAAGGTGATTTCGGTGTGGCTCGTCTCATCAAATCTATCGGTGACCGACCATTCTCCAACCATGGGTGGACGGACAGGAACggtcatactgtgtgtgtgggccTGTTTGCTGATGGCCAATGTGCTTTGTGGGAAAAGCTCTGGACAGAATGGCCAGACGGATGAGCAgaaagacaacactacagtgtTCACCCGGATCCTAGACCGTCTCCTGGATGGCTATGACAATCGTCTCAGACCAGGGTTGGGAGAGCGTGTAACTGAAGTCAAGACTGACATTTTCGTGACGAGTATTGGGCCCGTCTCGGACCATGACATGGAATACACCATCGACGTGTTCTTTCGTCAAAGCTGGAAGGACGAGCGGCTAAAATTTAAAGGTCCAATGTCTGTTCTCCGTTTGAACAACCTAATGGCCAGTAAAATCTGGACCCCTGACACATTCTTTCACAATGGCAAGAAGTCTGTGGCCCACAACATGACTATGCCCAACAAACTCCTACGAATCACCGAGGAGGGAACTCTGCTCTACACTATGAGaCTGACAGTAAGGGCGGAGTGTCCCATGCACCTGGAGGACTTCCCCATGGACGCCCATGCTTGTCCACTGAAGTTTGGCAGCTATGCTTACACCAGAGCTGAGGTTGTGTACGTGTGGACGAGAGGGGCAGCCCAGTCTGTCGTGGTGGCTGAAGATGGCTCTCGGCTCAACCAGTATGATCTGATGGGGCAAAGTGTGGACTCTGGGGTTGTCCAGTCCAGCACAGGAGAGTATGTTGTCATGACGACACACTTCCATCTGAAGAGGAAGATTGGTTATTTTGTCATCCAGACGTACCTGCCCTGCATCATGACAGTAATCCTATCCCAGGTGTCGTTCTGGCTCAACAGAGAGTCCGTCCCAGCCAGGACTGTGTTCGGAGTGACAACTGTGCTGACCATGACCACCCTCAGTATCAGCGCTAGGAACTCTCTCCCAAAAGTGGCCTACGCCACAGCCATGGACTGGTTCATTGCAGTCTGCTATGCTTTTGTCTTCTCTGCCCTCATTGAGTTTGCTACAGTGAACTATTTCACAAAGAGGGGCTATGCCTGGGACGGAAAAAGTGTGGTGCCAGAGaagCAAAAGAAGAAGAAGGAGTCCCTCCTGAAGAAGAACAACACCACCGCCTACACCGCCGCCACTGCCACAGCCTTCGCTCCAAACATTGCCAGGGACCCTGGTTTGGCCACCATTGCCAAAagtgccccccctccccccaccgaGCCCAAGGAGGAACCCAAGCCCAAGCCACCAGAGGCCAAGAAGACCTTCAACAGCGTCAGCAAGATCGACAGGATCGCCAGAATAGCCTTCCCGTTACTCTTCGGAACCTTTAACCTGGTCTACTGGGCAACTTACTTGAATAAAAAGCCCAAGTTACAGGGGATGACCCCGGGATCCCACTAATCCCAATCCCCCCCCTTCTCTTTTTTTCCGaatgtttattttcagaaaacatgGTGTCCAAAGCCGGTTGAGTTCCCAGTCGCCACATTGCTTCAATGTCAAATACTGTACCTTCCAAAATGTAAAAAAGAGAAAAGGTTTTAGGATCAGAGCAATGTGATGACTATAATGGGAATTGTTTTGGGAGGGAGAGATTATGCTACTAAAGAAAATATGCTATAAATAATACATGATATACGCAAGAGAATGCTATTCTACAAATTCACATAGCCCAACAATTTATAAAGATctattctttgttttagttttcTGATATATGTTTAGTTGTTGTTTTGCATTAGATCATTGCCACTGTAAaagaaaattgtgtttttttgcatGGACTGGGAATTTCTCTTCTCAAAGACCAATCAACATTTGACTGATGGCCTAGTTTGTTTGAAATCAGTGACAAAATGCTACCTGCAATCTCTGTCAAATATTCTTCCATTCTCTGTCGTTGATGTTTTGGGGTTGTTCATTTCCTTTGTTGAAAGAATCAAGATAGGGGTTCAGCAATAGCAATAAAACATGTCTCAGTGGAAACAATGTCATTCATTCATGGGTTTTAAGAAGAGGATAGAAACGATTCAATCATGTATGTGCAACATTATGAATACAATTTATTtcgattttttttttgtaaatagtATCAAGTGTTAGAGATGTCAATATTACGTTTAAGCTTTTGCAAAAGTGTAACTAAAGGGTATTAATATTCAACATGTGGCAGagaacattttctttttttttttacgaaaCATTTAAGAAAAAGTTTGTATGAAGAGAGTATTCACTGGTTCACTCCTAAGTGACAGTTCCTTACCAAGTCAGTGTTCCACCGATGGCTGGTCAACATTGCCAGTGGTTATAATTGAAATATAAGTTCCTATCTATTCAACTAAATCCCATAGCTATGTACACACTAACAACAACAATGTGTCAAAGTCTGGGGCGGGTTACTAAATGAGTAAGAATGTAAAACTGTCAAATCTAAATGTCGGAATGCATTTTATATTTAGAATAAAACAAAACACTATTATTATTTACTTTGGTTTCTGGTTTCTATGGCATAGAAGAATTTCTACAGGGCCCAGAGGACTGTCAGCAGCATTGTTTAGTTTCTAAGAGGGCTGCCAGCAGTAAGCATTGCAACGGGCGGGCGGTGGCAAATGCATTGAGAGTGAAGAGCAGTGCCTTTTACATTTTCAGGGTTTAACTAGGGATTGGCTACTCCCTTGATTCATGGCACTAAGTTTTACATCCTGCTCTATTTCCGTGACCCTGTGAAGGCGCCGTGGTTCCCATCTTCTGTTGACGATGTTTTAGACAACACTCAGAAAGTACCAGCTACACTGCCTTCAGTCTCACATGCCGTTAGGGGAATGTTCATTTTTGACTGCATTTGTTGCTGCTTGATGTTGATGGGAGAGAACACAGAGGCATCAAACGTGATGGGCTAGTGCTGTGTCCTACACACAGGAAATGTCTTGTAGTTCTATGATAGTATCGAATACCTATATTTTTGTAGCATGATATCAATCCCTCCTCCGAGAGACCCAACAGGTACTAAACCGAACATGTTAAAACAAATATTGTTGGTTTCtttttattgattttattttttcaCATTCAAACATACACAAAGAGATGTTTTCTCAGATGTGGAAAGTTGAAGTTAATTGTCCTCAAATTATGTTAATGTAGCAATATCGATTAGCAAgggctttttaaaaaaaaaacagcattcTCCGGGGTGATATCCATAGCTTTATGTTGACCTCTCAGAAATCATAGTTCCATGTGCAGCGTCGCTATCCAAAAACTCTTTGGAATAACGGTCACGGGCttcatgtctttattgttttCAAGCCGTCAGCACCCAATTTGCTTTCAGAAAACCATGATCCAAATTGAGAGTGGGGGCATTGTATGGCATGGGTTGTGGTGTTTTTACAATAAATGGGTATTGTAGTACTGGACATTGTGCAGTGGTGACGATATCTCTGGACTGTGTAGACTGACTAGTGTGTATTGTAGATCAGTGCACAGGGGTGAGAAGGGTAGAGCATCCcagagggagaaggagtgagTCGGTTGCATTATGACCGATTGAGAGGATCTGTTGCTGGAGATAGAAGGCTTTTCAGTATGCAAGTGCACACAAGTCCTGTGTGAAatgtataaatataaatatttagaTATTTCAATTTAAACCTATTGTATGGATGTTTACTATCATGACGAAAAAAAGGATAAATAATATACATAATGCATATATGACTATTTAATAGAAAAATACTACCCAAGATAATAAATATTGTTTGTACCAACCTATTGTTAGGCATTTTTTCACATTAGAAGCGTCCTTTACATTCACGTAGTCCGCTTTGTGCTATCCAAGGACCGCTTTGAAACACGTTAATTAGCCTCTTTCCCTGACCCCTGTGTTTTCAAATGAACAAGCTCTTGTAAAAAGCTTAACTCTTTAATCAACCATGCATCCTTAGACTTTTAACCATATTTCTGCTGGGTAATCGTGAATTACTCTTCTTTATTTTTGATGAACAGGTCGATCTATTGATGGGGAGATGGCTTTGATGGCTTTTTTTTTTATGGCAATAAATGGAGTCAATGGAAAAACCAGAAAAGTACTGTATATTAAGTTCACGTGAATAATTCTATTTGAGGATTTGCTAATAATCAGTGATGATAAATTGCTAAGTGGGTAGATAAATGTTTTTCCTTTTTCATTTAGCTTTAAAGATAGCAAAATCAAAGAAGAGTTTCTATATATTGTTTGCTAATTAAAACCTCAGCTAAAATACACTTCCTGCCATTCAGAGTGGAAAGTGGACCTCCACCAGTGTTGTTATTTTTTTCATACTCATTTAGGAAGGCATCGTATCTGTTCCAGAGCACTGGCTGTGGAATCTGTGGCACATTTGCAAACATGAGCTTCCAACCCCTTCTCCTTTCACATACAGCAGCTGTAACATGTATATAAATGCATCGCAAACCGATCCCCTATGTTGGAGACCAAGTAATCCCCCATTTAGAACTGTTGTTCTGGACAGTACTTGCTTTTCAAAGTTGGGTCTTTGATCAATGTTAGGTACTTGTGGGAGTTTTTTGTTTTcttgtgtttttatttatcaggcataaaaaaaaaaaaacgattaatTTAGAAATAAAACCTCATTTTTTTAAAGCACAAATGTTGAAGATATATAATGGGTGAGGGGTAAAACACATCCACACTCACTGTTGTGTTTGTGGTATATAATGTATGATACAAGCCAAACGATGATGGAGATGGGGTAGTATTCTGTTGGATTGGGTGGAAAGGTATACCTTCTGTAAATGTTTGGTTTTGTTATGATATGGCCCTCTGTAGAATCTGATTCTCTGCATAAGTCTTTAAATAAAAGAGAGGAAAAAAGTCATGTTGACATTTTTATCAATGTGTAATAAATTGAATTATAAAAATGCCAACACATCA
>XM_021624113.2
CAGCCTATTTCACATCCGGTTTACCCAGGGACATATTACTATTGTCCTGGTAAAGTAAAGCTTTATTTGGCTGCAATATCAGTATTTACAGTCGATTTTGTAGTTAGATAACCAATTTGTTGGGGACTGAGAAGAGTTTAACCCCCCACACCAATGAATAGTGCGCGAGACCTGCGCATACTCAGCATCGTCAGCAGCCGTTTCTCCAGCCTCAAGCTCAAATTCGGCAGTAGATCTGAGATCTTTGAGGATTTTTCTCATTGAATCCGTGTAAAAAAAAAGATGTACATAAAAGTTTGAGGACACGACAGCCTCGAATATTTCTGGTATATCGCTTGACCGACCATTCTCCAACCATGGGTGGACGGACAGGAACggtcatactgtgtgtgtgggccTGTTTGCTGATGGCCAATGTGCTTTGTGGGAAAAGCTCTGGACAGAATGGCCAGACGGATGAGCAgaaagacaacactacagtgtTCACCCGGATCCTAGACCGTCTCCTGGATGGCTATGACAATCGTCTCAGACCAGGGTTGGGAGAGCGTGTAACTGAAGTCAAGACTGACATTTTCGTGACGAGTATTGGGCCCGTCTCGGACCATGACATGGAATACACCATCGACGTGTTCTTTCGTCAAAGCTGGAAGGACGAGCGGCTAAAATTTAAAGGTCCAATGTCTGTTCTCCGTTTGAACAACCTAATGGCCAGTAAAATCTGGACCCCTGACACATTCTTTCACAATGGCAAGAAGTCTGTGGCCCACAACATGACTATGCCCAACAAACTCCTACGAATCACCGAGGAGGGAACTCTGCTCTACACTATGAGaCTGACAGTAAGGGCGGAGTGTCCCATGCACCTGGAGGACTTCCCCATGGACGCCCATGCTTGTCCACTGAAGTTTGGCAGCTATGCTTACACCAGAGCTGAGGTTGTGTACGTGTGGACGAGAGGGGCAGCCCAGTCTGTCGTGGTGGCTGAAGATGGCTCTCGGCTCAACCAGTATGATCTGATGGGGCAAAGTGTGGACTCTGGGGTTGTCCAGTCCAGCACAGGAGAGTATGTTGTCATGACGACACACTTCCATCTGAAGAGGAAGATTGGTTATTTTGTCATCCAGACGTACCTGCCCTGCATCATGACAGTAATCCTATCCCAGGTGTCGTTCTGGCTCAACAGAGAGTCCGTCCCAGCCAGGACTGTGTTCGGAGTGACAACTGTGCTGACCATGACCACCCTCAGTATCAGCGCTAGGAACTCTCTCCCAAAAGTGGCCTACGCCACAGCCATGGACTGGTTCATTGCAGTCTGCTATGCTTTTGTCTTCTCTGCCCTCATTGAGTTTGCTACAGTGAACTATTTCACAAAGAGGGGCTATGCCTGGGACGGAAAAAGTGTGGTGCCAGAGaagCAAAAGAAGAAGAAGGAGTCCCTCCTGAAGAAGAACAACACCACCGCCTACACCGCCGCCACTGCCACAGCCTTCGCTCCAAACATTGCCAGGGACCCTGGTTTGGCCACCATTGCCAAAagtgccccccctccccccaccgaGCCCAAGGAGGAACCCAAGCCCAAGCCACCAGAGGCCAAGAAGACCTTCAACAGCGTCAGCAAGATCGACAGGATCGCCAGAATAGCCTTCCCGTTACTCTTCGGAACCTTTAACCTGGTCTACTGGGCAACTTACTTGAATAAAAAGCCCAAGTTACAGGGGATGACCCCGGGATCCCACTAATCCCAATCCCCCCCCTTCTCTTTTTTTCCGaatgtttattttcagaaaacatgGTGTCCAAAGCCGGTTGAGTTCCCAGTCGCCACATTGCTTCAATGTCAAATACTGTACCTTCCAAAATGTAAAAAAGAGAAAAGGTTTTAGGATCAGAGCAATGTGATGACTATAATGGGAATTGTTTTGGGAGGGAGAGATTATGCTACTAAAGAAAATATGCTATAAATAATACATGATATACGCAAGAGAATGCTATTCTACAAATTCACATAGCCCAACAATTTATAAAGATctattctttgttttagttttcTGATATATGTTTAGTTGTTGTTTTGCATTAGATCATTGCCACTGTAAaagaaaattgtgtttttttgcatGGACTGGGAATTTCTCTTCTCAAAGACCAATCAACATTTGACTGATGGCCTAGTTTGTTTGAAATCAGTGACAAAATGCTACCTGCAATCTCTGTCAAATATTCTTCCATTCTCTGTCGTTGATGTTTTGGGGTTGTTCATTTCCTTTGTTGAAAGAATCAAGATAGGGGTTCAGCAATAGCAATAAAACATGTCTCAGTGGAAACAATGTCATTCATTCATGGGTTTTAAGAAGAGGATAGAAACGATTCAATCATGTATGTGCAACATTATGAATACAATTTATTtcgattttttttttgtaaatagtATCAAGTGTTAGAGATGTCAATATTACGTTTAAGCTTTTGCAAAAGTGTAACTAAAGGGTATTAATATTCAACATGTGGCAGagaacattttctttttttttttacgaaaCATTTAAGAAAAAGTTTGTATGAAGAGAGTATTCACTGGTTCACTCCTAAGTGACAGTTCCTTACCAAGTCAGTGTTCCACCGATGGCTGGTCAACATTGCCAGTGGTTATAATTGAAATATAAGTTCCTATCTATTCAACTAAATCCCATAGCTATGTACACACTAACAACAACAATGTGTCAAAGTCTGGGGCGGGTTACTAAATGAGTAAGAATGTAAAACTGTCAAATCTAAATGTCGGAATGCATTTTATATTTAGAATAAAACAAAACACTATTATTATTTACTTTGGTTTCTGGTTTCTATGGCATAGAAGAATTTCTACAGGGCCCAGAGGACTGTCAGCAGCATTGTTTAGTTTCTAAGAGGGCTGCCAGCAGTAAGCATTGCAACGGGCGGGCGGTGGCAAATGCATTGAGAGTGAAGAGCAGTGCCTTTTACATTTTCAGGGTTTAACTAGGGATTGGCTACTCCCTTGATTCATGGCACTAAGTTTTACATCCTGCTCTATTTCCGTGACCCTGTGAAGGCGCCGTGGTTCCCATCTTCTGTTGACGATGTTTTAGACAACACTCAGAAAGTACCAGCTACACTGCCTTCAGTCTCACATGCCGTTAGGGGAATGTTCATTTTTGACTGCATTTGTTGCTGCTTGATGTTGATGGGAGAGAACACAGAGGCATCAAACGTGATGGGCTAGTGCTGTGTCCTACACACAGGAAATGTCTTGTAGTTCTATGATAGTATCGAATACCTATATTTTTGTAGCATGATATCAATCCCTCCTCCGAGAGACCCAACAGGTACTAAACCGAACATGTTAAAACAAATATTGTTGGTTTCtttttattgattttattttttcaCATTCAAACATACACAAAGAGATGTTTTCTCAGATGTGGAAAGTTGAAGTTAATTGTCCTCAAATTATGTTAATGTAGCAATATCGATTAGCAAgggctttttaaaaaaaaaacagcattcTCCGGGGTGATATCCATAGCTTTATGTTGACCTCTCAGAAATCATAGTTCCATGTGCAGCGTCGCTATCCAAAAACTCTTTGGAATAACGGTCACGGGCttcatgtctttattgttttCAAGCCGTCAGCACCCAATTTGCTTTCAGAAAACCATGATCCAAATTGAGAGTGGGGGCATTGTATGGCATGGGTTGTGGTGTTTTTACAATAAATGGGTATTGTAGTACTGGACATTGTGCAGTGGTGACGATATCTCTGGACTGTGTAGACTGACTAGTGTGTATTGTAGATCAGTGCACAGGGGTGAGAAGGGTAGAGCATCCcagagggagaaggagtgagTCGGTTGCATTATGACCGATTGAGAGGATCTGTTGCTGGAGATAGAAGGCTTTTCAGTATGCAAGTGCACACAAGTCCTGTGTGAAatgtataaatataaatatttagaTATTTCAATTTAAACCTATTGTATGGATGTTTACTATCATGACGAAAAAAAGGATAAATAATATACATAATGCATATATGACTATTTAATAGAAAAATACTACCCAAGATAATAAATATTGTTTGTACCAACCTATTGTTAGGCATTTTTTCACATTAGAAGCGTCCTTTACATTCACGTAGTCCGCTTTGTGCTATCCAAGGACCGCTTTGAAACACGTTAATTAGCCTCTTTCCCTGACCCCTGTGTTTTCAAATGAACAAGCTCTTGTAAAAAGCTTAACTCTTTAATCAACCATGCATCCTTAGACTTTTAACCATATTTCTGCTGGGTAATCGTGAATTACTCTTCTTTATTTTTGATGAACAGGTCGATCTATTGATGGGGAGATGGCTTTGATGGCTTTTTTTTTTATGGCAATAAATGGAGTCAATGGAAAAACCAGAAAAGTACTGTATATTAAGTTCACGTGAATAATTCTATTTGAGGATTTGCTAATAATCAGTGATGATAAATTGCTAAGTGGGTAGATAAATGTTTTTCCTTTTTCATTTAGCTTTAAAGATAGCAAAATCAAAGAAGAGTTTCTATATATTGTTTGCTAATTAAAACCTCAGCTAAAATACACTTCCTGCCATTCAGAGTGGAAAGTGGACCTCCACCAGTGTTGTTATTTTTTTCATACTCATTTAGGAAGGCATCGTATCTGTTCCAGAGCACTGGCTGTGGAATCTGTGGCACATTTGCAAACATGAGCTTCCAACCCCTTCTCCTTTCACATACAGCAGCTGTAACATGTATATAAATGCATCGCAAACCGATCCCCTATGTTGGAGACCAAGTAATCCCCCATTTAGAACTGTTGTTCTGGACAGTACTTGCTTTTCAAAGTTGGGTCTTTGATCAATGTTAGGTACTTGTGGGAGTTTTTTGTTTTcttgtgtttttatttatcaggcataaaaaaaaaaaaacgattaatTTAGAAATAAAACCTCATTTTTTTAAAGCACAAATGTTGAAGATATATAATGGGTGAGGGGTAAAACACATCCACACTCACTGTTGTGTTTGTGGTATATAATGTATGATACAAGCCAAACGATGATGGAGATGGGGTAGTATTCTGTTGGATTGGGTGGAAAGGTATACCTTCTGTAAATGTTTGGTTTTGTTATGATATGGCCCTCTGTAGAATCTGATTCTCTGCATAAGTCTTTAAATAAAAGAGAGGAAAAAAGTCATGTTGACATTTTTATCAATGTGTAATAAATTGAATTATAAAAATGCCAACACATCA
>XM_021624114.2
GCGTTTAGAACTGCAGTGAGTTGTGTTCAGCCTAACAGAGCAGAATGGTAGAGGAGTTGCAACGATCGGGGAGTGGAGGACGTGGAGTTTGCTATTGAAAATTAAGACTATTTAAGAGGGCATCTGCTGTGTGACCGACCATTCTCCAACCATGGGTGGACGGACAGGAACggtcatactgtgtgtgtgggccTGTTTGCTGATGGCCAATGTGCTTTGTGGGAAAAGCTCTGGACAGAATGGCCAGACGGATGAGCAgaaagacaacactacagtgtTCACCCGGATCCTAGACCGTCTCCTGGATGGCTATGACAATCGTCTCAGACCAGGGTTGGGAGAGCGTGTAACTGAAGTCAAGACTGACATTTTCGTGACGAGTATTGGGCCCGTCTCGGACCATGACATGGAATACACCATCGACGTGTTCTTTCGTCAAAGCTGGAAGGACGAGCGGCTAAAATTTAAAGGTCCAATGTCTGTTCTCCGTTTGAACAACCTAATGGCCAGTAAAATCTGGACCCCTGACACATTCTTTCACAATGGCAAGAAGTCTGTGGCCCACAACATGACTATGCCCAACAAACTCCTACGAATCACCGAGGAGGGAACTCTGCTCTACACTATGAGaCTGACAGTAAGGGCGGAGTGTCCCATGCACCTGGAGGACTTCCCCATGGACGCCCATGCTTGTCCACTGAAGTTTGGCAGCTATGCTTACACCAGAGCTGAGGTTGTGTACGTGTGGACGAGAGGGGCAGCCCAGTCTGTCGTGGTGGCTGAAGATGGCTCTCGGCTCAACCAGTATGATCTGATGGGGCAAAGTGTGGACTCTGGGGTTGTCCAGTCCAGCACAGGAGAGTATGTTGTCATGACGACACACTTCCATCTGAAGAGGAAGATTGGTTATTTTGTCATCCAGACGTACCTGCCCTGCATCATGACAGTAATCCTATCCCAGGTGTCGTTCTGGCTCAACAGAGAGTCCGTCCCAGCCAGGACTGTGTTCGGAGTGACAACTGTGCTGACCATGACCACCCTCAGTATCAGCGCTAGGAACTCTCTCCCAAAAGTGGCCTACGCCACAGCCATGGACTGGTTCATTGCAGTCTGCTATGCTTTTGTCTTCTCTGCCCTCATTGAGTTTGCTACAGTGAACTATTTCACAAAGAGGGGCTATGCCTGGGACGGAAAAAGTGTGGTGCCAGAGaagCAAAAGAAGAAGAAGGAGTCCCTCCTGAAGAAGAACAACACCACCGCCTACACCGCCGCCACTGCCACAGCCTTCGCTCCAAACATTGCCAGGGACCCTGGTTTGGCCACCATTGCCAAAagtgccccccctccccccaccgaGCCCAAGGAGGAACCCAAGCCCAAGCCACCAGAGGCCAAGAAGACCTTCAACAGCGTCAGCAAGATCGACAGGATCGCCAGAATAGCCTTCCCGTTACTCTTCGGAACCTTTAACCTGGTCTACTGGGCAACTTACTTGAATAAAAAGCCCAAGTTACAGGGGATGACCCCGGGATCCCACTAATCCCAATCCCCCCCCTTCTCTTTTTTTCCGaatgtttattttcagaaaacatgGTGTCCAAAGCCGGTTGAGTTCCCAGTCGCCACATTGCTTCAATGTCAAATACTGTACCTTCCAAAATGTAAAAAAGAGAAAAGGTTTTAGGATCAGAGCAATGTGATGACTATAATGGGAATTGTTTTGGGAGGGAGAGATTATGCTACTAAAGAAAATATGCTATAAATAATACATGATATACGCAAGAGAATGCTATTCTACAAATTCACATAGCCCAACAATTTATAAAGATctattctttgttttagttttcTGATATATGTTTAGTTGTTGTTTTGCATTAGATCATTGCCACTGTAAaagaaaattgtgtttttttgcatGGACTGGGAATTTCTCTTCTCAAAGACCAATCAACATTTGACTGATGGCCTAGTTTGTTTGAAATCAGTGACAAAATGCTACCTGCAATCTCTGTCAAATATTCTTCCATTCTCTGTCGTTGATGTTTTGGGGTTGTTCATTTCCTTTGTTGAAAGAATCAAGATAGGGGTTCAGCAATAGCAATAAAACATGTCTCAGTGGAAACAATGTCATTCATTCATGGGTTTTAAGAAGAGGATAGAAACGATTCAATCATGTATGTGCAACATTATGAATACAATTTATTtcgattttttttttgtaaatagtATCAAGTGTTAGAGATGTCAATATTACGTTTAAGCTTTTGCAAAAGTGTAACTAAAGGGTATTAATATTCAACATGTGGCAGagaacattttctttttttttttacgaaaCATTTAAGAAAAAGTTTGTATGAAGAGAGTATTCACTGGTTCACTCCTAAGTGACAGTTCCTTACCAAGTCAGTGTTCCACCGATGGCTGGTCAACATTGCCAGTGGTTATAATTGAAATATAAGTTCCTATCTATTCAACTAAATCCCATAGCTATGTACACACTAACAACAACAATGTGTCAAAGTCTGGGGCGGGTTACTAAATGAGTAAGAATGTAAAACTGTCAAATCTAAATGTCGGAATGCATTTTATATTTAGAATAAAACAAAACACTATTATTATTTACTTTGGTTTCTGGTTTCTATGGCATAGAAGAATTTCTACAGGGCCCAGAGGACTGTCAGCAGCATTGTTTAGTTTCTAAGAGGGCTGCCAGCAGTAAGCATTGCAACGGGCGGGCGGTGGCAAATGCATTGAGAGTGAAGAGCAGTGCCTTTTACATTTTCAGGGTTTAACTAGGGATTGGCTACTCCCTTGATTCATGGCACTAAGTTTTACATCCTGCTCTATTTCCGTGACCCTGTGAAGGCGCCGTGGTTCCCATCTTCTGTTGACGATGTTTTAGACAACACTCAGAAAGTACCAGCTACACTGCCTTCAGTCTCACATGCCGTTAGGGGAATGTTCATTTTTGACTGCATTTGTTGCTGCTTGATGTTGATGGGAGAGAACACAGAGGCATCAAACGTGATGGGCTAGTGCTGTGTCCTACACACAGGAAATGTCTTGTAGTTCTATGATAGTATCGAATACCTATATTTTTGTAGCATGATATCAATCCCTCCTCCGAGAGACCCAACAGGTACTAAACCGAACATGTTAAAACAAATATTGTTGGTTTCtttttattgattttattttttcaCATTCAAACATACACAAAGAGATGTTTTCTCAGATGTGGAAAGTTGAAGTTAATTGTCCTCAAATTATGTTAATGTAGCAATATCGATTAGCAAgggctttttaaaaaaaaaacagcattcTCCGGGGTGATATCCATAGCTTTATGTTGACCTCTCAGAAATCATAGTTCCATGTGCAGCGTCGCTATCCAAAAACTCTTTGGAATAACGGTCACGGGCttcatgtctttattgttttCAAGCCGTCAGCACCCAATTTGCTTTCAGAAAACCATGATCCAAATTGAGAGTGGGGGCATTGTATGGCATGGGTTGTGGTGTTTTTACAATAAATGGGTATTGTAGTACTGGACATTGTGCAGTGGTGACGATATCTCTGGACTGTGTAGACTGACTAGTGTGTATTGTAGATCAGTGCACAGGGGTGAGAAGGGTAGAGCATCCcagagggagaaggagtgagTCGGTTGCATTATGACCGATTGAGAGGATCTGTTGCTGGAGATAGAAGGCTTTTCAGTATGCAAGTGCACACAAGTCCTGTGTGAAatgtataaatataaatatttagaTATTTCAATTTAAACCTATTGTATGGATGTTTACTATCATGACGAAAAAAAGGATAAATAATATACATAATGCATATATGACTATTTAATAGAAAAATACTACCCAAGATAATAAATATTGTTTGTACCAACCTATTGTTAGGCATTTTTTCACATTAGAAGCGTCCTTTACATTCACGTAGTCCGCTTTGTGCTATCCAAGGACCGCTTTGAAACACGTTAATTAGCCTCTTTCCCTGACCCCTGTGTTTTCAAATGAACAAGCTCTTGTAAAAAGCTTAACTCTTTAATCAACCATGCATCCTTAGACTTTTAACCATATTTCTGCTGGGTAATCGTGAATTACTCTTCTTTATTTTTGATGAACAGGTCGATCTATTGATGGGGAGATGGCTTTGATGGCTTTTTTTTTTATGGCAATAAATGGAGTCAATGGAAAAACCAGAAAAGTACTGTATATTAAGTTCACGTGAATAATTCTATTTGAGGATTTGCTAATAATCAGTGATGATAAATTGCTAAGTGGGTAGATAAATGTTTTTCCTTTTTCATTTAGCTTTAAAGATAGCAAAATCAAAGAAGAGTTTCTATATATTGTTTGCTAATTAAAACCTCAGCTAAAATACACTTCCTGCCATTCAGAGTGGAAAGTGGACCTCCACCAGTGTTGTTATTTTTTTCATACTCATTTAGGAAGGCATCGTATCTGTTCCAGAGCACTGGCTGTGGAATCTGTGGCACATTTGCAAACATGAGCTTCCAACCCCTTCTCCTTTCACATACAGCAGCTGTAACATGTATATAAATGCATCGCAAACCGATCCCCTATGTTGGAGACCAAGTAATCCCCCATTTAGAACTGTTGTTCTGGACAGTACTTGCTTTTCAAAGTTGGGTCTTTGATCAATGTTAGGTACTTGTGGGAGTTTTTTGTTTTcttgtgtttttatttatcaggcataaaaaaaaaaaaacgattaatTTAGAAATAAAACCTCATTTTTTTAAAGCACAAATGTTGAAGATATATAATGGGTGAGGGGTAAAACACATCCACACTCACTGTTGTGTTTGTGGTATATAATGTATGATACAAGCCAAACGATGATGGAGATGGGGTAGTATTCTGTTGGATTGGGTGGAAAGGTATACCTTCTGTAAATGTTTGGTTTTGTTATGATATGGCCCTCTGTAGAATCTGATTCTCTGCATAAGTCTTTAAATAAAAGAGAGGAAAAAAGTCATGTTGACATTTTTATCAATGTGTAATAAATTGAATTATAAAAATGCCAACACATCA
>XM_036937770.1
ACAGGCGCAGTTTTTCTACTGACCGACCATTCTCCAACCATGGGTGGACGGACAGGAACggtcatactgtgtgtgtgggccTGTTTGCTGATGGCCAATGTGCTTTGTGGGAAAAGCTCTGGACAGAATGGCCAGACGGATGAGCAgaaagacaacactacagtgtTCACCCGGATCCTAGACCGTCTCCTGGATGGCTATGACAATCGTCTCAGACCAGGGTTGGGAGAGCGTGTAACTGAAGTCAAGACTGACATTTTCGTGACGAGTATTGGGCCCGTCTCGGACCATGACATGGAATACACCATCGACGTGTTCTTTCGTCAAAGCTGGAAGGACGAGCGGCTAAAATTTAAAGGTCCAATGTCTGTTCTCCGTTTGAACAACCTAATGGCCAGTAAAATCTGGACCCCTGACACATTCTTTCACAATGGCAAGAAGTCTGTGGCCCACAACATGACTATGCCCAACAAACTCCTACGAATCACCGAGGAGGGAACTCTGCTCTACACTATGAGaCTGACAGTAAGGGCGGAGTGTCCCATGCACCTGGAGGACTTCCCCATGGACGCCCATGCTTGTCCACTGAAGTTTGGCAGCTATGCTTACACCAGAGCTGAGGTTGTGTACGTGTGGACGAGAGGGGCAGCCCAGTCTGTCGTGGTGGCTGAAGATGGCTCTCGGCTCAACCAGTATGATCTGATGGGGCAAAGTGTGGACTCTGGGGTTGTCCAGTCCAGCACAGGAGAGTATGTTGTCATGACGACACACTTCCATCTGAAGAGGAAGATTGGTTATTTTGTCATCCAGACGTACCTGCCCTGCATCATGACAGTAATCCTATCCCAGGTGTCGTTCTGGCTCAACAGAGAGTCCGTCCCAGCCAGGACTGTGTTCGGAGTGACAACTGTGCTGACCATGACCACCCTCAGTATCAGCGCTAGGAACTCTCTCCCAAAAGTGGCCTACGCCACAGCCATGGACTGGTTCATTGCAGTCTGCTATGCTTTTGTCTTCTCTGCCCTCATTGAGTTTGCTACAGTGAACTATTTCACAAAGAGGGGCTATGCCTGGGACGGAAAAAGTGTGGTGCCAGAGaagCAAAAGAAGAAGAAGGAGTCCCTCCTGAAGAAGAACAACACCACCGCCTACACCGCCGCCACTGCCACAGCCTTCGCTCCAAACATTGCCAGGGACCCTGGTTTGGCCACCATTGCCAAAagtgccccccctccccccaccgaGCCCAAGGAGGAACCCAAGCCCAAGCCACCAGAGGCCAAGAAGACCTTCAACAGCGTCAGCAAGATCGACAGGATCGCCAGAATAGCCTTCCCGTTACTCTTCGGAACCTTTAACCTGGTCTACTGGGCAACTTACTTGAATAAAAAGCCCAAGTTACAGGGGATGACCCCGGGATCCCACTAATCCCAATCCCCCCCCTTCTCTTTTTTTCCGaatgtttattttcagaaaacatgGTGTCCAAAGCCGGTTGAGTTCCCAGTCGCCACATTGCTTCAATGTCAAATACTGTACCTTCCAAAATGTAAAAAAGAGAAAAGGTTTTAGGATCAGAGCAATGTGATGACTATAATGGGAATTGTTTTGGGAGGGAGAGATTATGCTACTAAAGAAAATATGCTATAAATAATACATGATATACGCAAGAGAATGCTATTCTACAAATTCACATAGCCCAACAATTTATAAAGATctattctttgttttagttttcTGATATATGTTTAGTTGTTGTTTTGCATTAGATCATTGCCACTGTAAaagaaaattgtgtttttttgcatGGACTGGGAATTTCTCTTCTCAAAGACCAATCAACATTTGACTGATGGCCTAGTTTGTTTGAAATCAGTGACAAAATGCTACCTGCAATCTCTGTCAAATATTCTTCCATTCTCTGTCGTTGATGTTTTGGGGTTGTTCATTTCCTTTGTTGAAAGAATCAAGATAGGGGTTCAGCAATAGCAATAAAACATGTCTCAGTGGAAACAATGTCATTCATTCATGGGTTTTAAGAAGAGGATAGAAACGATTCAATCATGTATGTGCAACATTATGAATACAATTTATTtcgattttttttttgtaaatagtATCAAGTGTTAGAGATGTCAATATTACGTTTAAGCTTTTGCAAAAGTGTAACTAAAGGGTATTAATATTCAACATGTGGCAGagaacattttctttttttttttacgaaaCATTTAAGAAAAAGTTTGTATGAAGAGAGTATTCACTGGTTCACTCCTAAGTGACAGTTCCTTACCAAGTCAGTGTTCCACCGATGGCTGGTCAACATTGCCAGTGGTTATAATTGAAATATAAGTTCCTATCTATTCAACTAAATCCCATAGCTATGTACACACTAACAACAACAATGTGTCAAAGTCTGGGGCGGGTTACTAAATGAGTAAGAATGTAAAACTGTCAAATCTAAATGTCGGAATGCATTTTATATTTAGAATAAAACAAAACACTATTATTATTTACTTTGGTTTCTGGTTTCTATGGCATAGAAGAATTTCTACAGGGCCCAGAGGACTGTCAGCAGCATTGTTTAGTTTCTAAGAGGGCTGCCAGCAGTAAGCATTGCAACGGGCGGGCGGTGGCAAATGCATTGAGAGTGAAGAGCAGTGCCTTTTACATTTTCAGGGTTTAACTAGGGATTGGCTACTCCCTTGATTCATGGCACTAAGTTTTACATCCTGCTCTATTTCCGTGACCCTGTGAAGGCGCCGTGGTTCCCATCTTCTGTTGACGATGTTTTAGACAACACTCAGAAAGTACCAGCTACACTGCCTTCAGTCTCACATGCCGTTAGGGGAATGTTCATTTTTGACTGCATTTGTTGCTGCTTGATGTTGATGGGAGAGAACACAGAGGCATCAAACGTGATGGGCTAGTGCTGTGTCCTACACACAGGAAATGTCTTGTAGTTCTATGATAGTATCGAATACCTATATTTTTGTAGCATGATATCAATCCCTCCTCCGAGAGACCCAACAGGTACTAAACCGAACATGTTAAAACAAATATTGTTGGTTTCtttttattgattttattttttcaCATTCAAACATACACAAAGAGATGTTTTCTCAGATGTGGAAAGTTGAAGTTAATTGTCCTCAAATTATGTTAATGTAGCAATATCGATTAGCAAgggctttttaaaaaaaaaacagcattcTCCGGGGTGATATCCATAGCTTTATGTTGACCTCTCAGAAATCATAGTTCCATGTGCAGCGTCGCTATCCAAAAACTCTTTGGAATAACGGTCACGGGCttcatgtctttattgttttCAAGCCGTCAGCACCCAATTTGCTTTCAGAAAACCATGATCCAAATTGAGAGTGGGGGCATTGTATGGCATGGGTTGTGGTGTTTTTACAATAAATGGGTATTGTAGTACTGGACATTGTGCAGTGGTGACGATATCTCTGGACTGTGTAGACTGACTAGTGTGTATTGTAGATCAGTGCACAGGGGTGAGAAGGGTAGAGCATCCcagagggagaaggagtgagTCGGTTGCATTATGACCGATTGAGAGGATCTGTTGCTGGAGATAGAAGGCTTTTCAGTATGCAAGTGCACACAAGTCCTGTGTGAAatgtataaatataaatatttagaTATTTCAATTTAAACCTATTGTATGGATGTTTACTATCATGACGAAAAAAAGGATAAATAATATACATAATGCATATATGACTATTTAATAGAAAAATACTACCCAAGATAATAAATATTGTTTGTACCAACCTATTGTTAGGCATTTTTTCACATTAGAAGCGTCCTTTACATTCACGTAGTCCGCTTTGTGCTATCCAAGGACCGCTTTGAAACACGTTAATTAGCCTCTTTCCCTGACCCCTGTGTTTTCAAATGAACAAGCTCTTGTAAAAAGCTTAACTCTTTAATCAACCATGCATCCTTAGACTTTTAACCATATTTCTGCTGGGTAATCGTGAATTACTCTTCTTTATTTTTGATGAACAGGTCGATCTATTGATGGGGAGATGGCTTTGATGGCTTTTTTTTTTATGGCAATAAATGGAGTCAATGGAAAAACCAGAAAAGTACTGTATATTAAGTTCACGTGAATAATTCTATTTGAGGATTTGCTAATAATCAGTGATGATAAATTGCTAAGTGGGTAGATAAATGTTTTTCCTTTTTCATTTAGCTTTAAAGATAGCAAAATCAAAGAAGAGTTTCTATATATTGTTTGCTAATTAAAACCTCAGCTAAAATACACTTCCTGCCATTCAGAGTGGAAAGTGGACCTCCACCAGTGTTGTTATTTTTTTCATACTCATTTAGGAAGGCATCGTATCTGTTCCAGAGCACTGGCTGTGGAATCTGTGGCACATTTGCAAACATGAGCTTCCAACCCCTTCTCCTTTCACATACAGCAGCTGTAACATGTATATAAATGCATCGCAAACCGATCCCCTATGTTGGAGACCAAGTAATCCCCCATTTAGAACTGTTGTTCTGGACAGTACTTGCTTTTCAAAGTTGGGTCTTTGATCAATGTTAGGTACTTGTGGGAGTTTTTTGTTTTcttgtgtttttatttatcaggcataaaaaaaaaaaaacgattaatTTAGAAATAAAACCTCATTTTTTTAAAGCACAAATGTTGAAGATATATAATGGGTGAGGGGTAAAACACATCCACACTCACTGTTGTGTTTGTGGTATATAATGTATGATACAAGCCAAACGATGATGGAGATGGGGTAGTATTCTGTTGGATTGGGTGGAAAGGTATACCTTCTGTAAATGTTTGGTTTTGTTATGATATGGCCCTCTGTAGAATCTGATTCTCTGCATAAGTCTTTAAATAAAAGAGAGGAAAAAAGTCATGTTGACATTTTTATCAATGTGTAATAAATTGAATTATAAAAATGCCAACACATCA

Function


NR:

description
PREDICTED: gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1-like isoform X1

GO:

id name namespace
GO:0034220 ion transmembrane transport biological_process
GO:0007165 signal transduction biological_process
GO:0045202 synapse cellular_component
GO:0005886 plasma membrane cellular_component
GO:0030054 cell junction cellular_component
GO:0016021 integral component of membrane cellular_component
GO:0004890 GABA-A receptor activity molecular_function
GO:0005230 extracellular ligand-gated ion channel activity molecular_function

KEGG:

id description
K05175 GABRA; gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021624115.2 False 5102 mRNA 0.41 10 52087532 52124400
XM_021624113.2 False 5286 mRNA 0.41 10 52088127 52124400
XM_021624114.2 False 5081 mRNA 0.41 10 52088534 52124400
XM_036937770.1 True 4969 mRNA 0.41 10 52089040 52124400

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
LOC110537754 LOC106603847 coding upstream 22360 52026941 ~ 52065243 (+)
LOC110537746 LOC106567511 coding upstream 499641 51547730 ~ 51587891 (+)
LOC110537744 LOC106567513 coding upstream 636724 51414096 ~ 51450808 (+)
LOC110537742 LOC106567514 coding upstream 684350 51363089 ~ 51403182 (+)
LOC110538907 NA coding upstream 788846 51290606 ~ 51298686 (+)
LOC110537755 LOC106567504 coding downstream 39671 52164071 ~ 52232228 (+)
LOC110537762 LOC106567497 coding downstream 679827 52804227 ~ 52821797 (+)
LOC110537763 rnf14 coding downstream 712278 52836678 ~ 52842725 (+)
endou2 LOC106567496 coding downstream 718719 52843119 ~ 52851325 (+)
LOC110537765 LOC106567495 coding downstream 727251 52851651 ~ 52861272 (+)
G1085339 NA non-coding upstream 14208 52072892 ~ 52073324 (+)
G1085336 NA non-coding upstream 18052 52069257 ~ 52069480 (+)
G1085332 NA non-coding upstream 31854 52054284 ~ 52055678 (+)
G1085311 NA non-coding upstream 69597 52017672 ~ 52017935 (+)
G1085422 NA non-coding downstream 86768 52211168 ~ 52211375 (+)
G1085441 NA non-coding downstream 132120 52256520 ~ 52256783 (+)
G1085744 NA non-coding downstream 140596 52264996 ~ 52265234 (+)
G1085768 NA non-coding downstream 156394 52280794 ~ 52280993 (+)
G1085780 NA non-coding downstream 166138 52290538 ~ 52290793 (+)
G1082266 NA other upstream 2406728 49679023 ~ 49680804 (+)
LOC110537713 LOC106567542 other upstream 2787185 49262142 ~ 49300347 (+)
G1081353 NA other upstream 3340033 48746955 ~ 48747499 (+)
G1077322 NA other upstream 6078923 46004151 ~ 46008609 (+)
nrgna NA other upstream 6167271 45900621 ~ 45920265 (+)
G1086237 LOC106567502 other downstream 525204 52649604 ~ 52657495 (+)
G1087914 NA other downstream 1985290 54109690 ~ 54148962 (+)
LOC110538908 LOC106603872 other downstream 2149906 54253719 ~ 54283905 (+)
G1091217 NA other downstream 4601207 56725607 ~ 56726003 (+)
G1091235 NA other downstream 4628018 56752418 ~ 56752947 (+)

Expression


LOC110537753(LOC106567505) Expression in all Baseline Samples

Bar chart with 20 bars.
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying values. Range: 0 to 125.
End of interactive chart.

LOC110537753(LOC106567505) Expression in each Bioproject

Bar chart with 18 bars.
LOC110537753(LOC106567505) Expression in each Sample
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying Expression. Range: 0 to 6000.
End of interactive chart.

Co-expression Network