LOC110537800 (LOC106567427)



Basic Information


Item Value
gene id LOC110537800
gene name LOC106567427
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048576.1
NCBI id CM023230.2
chromosome length 102853256
location 55376021 ~ 55398512 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


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>XM_021624194.2
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>TU1238977
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>TU1238978
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Function


NR:

description
protein FAM53C-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA


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TU1238978 True 2351 lncRNA 0.48 5 55376264 55398473

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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LOC110537794 afap1l1 coding upstream 128162 55209730 ~ 55247859 (+)
LOC110537795 ablim3 coding upstream 166389 55065121 ~ 55209632 (+)
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LOC110537801 LOC106603903 coding downstream 463 55398975 ~ 55413298 (+)
LOC110537802 LOC106603906 coding downstream 53082 55451594 ~ 55455336 (+)
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ttc1 LOC106567425 coding downstream 226849 55625361 ~ 55643340 (+)
LOC110537810 LOC106567475 coding downstream 268161 55666673 ~ 55668162 (+)
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G1089013 NA non-coding upstream 348133 55027664 ~ 55027888 (+)
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G1089209 NA non-coding downstream 22359 55420871 ~ 55425203 (+)
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G1089281 LOC106567478 non-coding downstream 121062 55519574 ~ 55521811 (+)
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LOC110538908 LOC106603872 other upstream 1095300 54253719 ~ 54283905 (+)
G1087914 NA other upstream 1227059 54109690 ~ 54148962 (+)
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LOC118937686 NA other downstream 2817643 58216142 ~ 58222215 (+)

Expression



Co-expression Network