G1059154


Basic Information

Item Value
gene id G1059154
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048576.1
NCBI id CM023230.2
chromosome length 102853256
location 30340029 ~ 30345459 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1206677
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>TU1206679
ttaatgttgttttaatggctacaccttcctctgtcctccaaattacatctgtaaggtccctcagtcaagtattgaatttcaagcacagattcaactacaaagaccagggagccaCATAAAAAGCCTCAAAAAGAAGggcaaatcagacattgaatatctcttttaAGCCTGGTCAAAtgaataattatgctgtggatgacgtattaaaccacccagacacaacaGTTGTCGTTCTGAACTGAGCtggaggacaggaaggaaactgctcagggatgtcaccatgaggccattggtgattttaaaactgCTACAGAGAtaaatggctgtgatgggagaaagcaactaaggatggatcaacaacattctagttactccacaataatgacctaaatgacagagtgaaaagaagtctATAAATATAcagaatattccaaaacatgcatcctgtgtgCAACAAAGCACTAAAGTTATACTGCGAGAAAACACggcaaaggaatacactttttggcctaaTTGCAAAGCCTTATCTTTGGGGTGAATCCAACACAATACATCACTGAGTAaatgcctccttattttcaagcatggcagATCATGGTATGGGTAAGCTTGACATTGGCAAAAACTGGAATTTTTCAGgataaatcctagaggaaaacagtCTTCAGGTTGCTTTCCacaagacactgggagacaaatgcacctttcagcagggtAATAAActacaacacaaagccaaatctatactgaagttgcttaccaagaagaccgttataatgttcctgagtgaccaagtgaaagtttggacttaaatctgcttgaaaatatatggcaagattTCAAAATGGCTTTGTAGCCATGACccccaacaccttgacagagcttgacacattttaaaaagagtaatgggcaaatattgcacaatccaagtGTGAAGcgctcttagagactaacccaagaagattcacagctgtaatcgctgcccaaAAGTGTTTCTAGCATGTATTGAcggggtgaatacttatctaattaaggtactgtatattatttttcATTACATTTTAAGAAATGAAAAAAGTAAAAAATCTCACTTATGCATTTCAGAGTAtgttgtgtagatcgttgacaaaaaatgacaaatccattttaatcccactaaagcaataaaatgtgaagacatCCAAGGTGGTGGAATACTTATGATATccactgtacactgagtgtacaatatTCCTAATGAGTTGgacctccttttgccctcagaacagactcaattggTCGGTGTTAGGACTCTATaaggtgtcaagcgttccacagggatactggcccatgttgactctaatgcttcccacagttgtgtcaaattggctggatgtcctttggggggGTGGACCATTATTTATGCACGCAGGaaattgttgagcgtgaaaaacccagcagcgttgacacactcaaaccagtgcacctggcacctactaccatacctcattCAGAGGCATTTTCATCCACCTGTCAATCCATTATAATCATTCTACAACCCTGAAAAGTACACACGTTCTTGACATACCTCAGGGAAATACAACCCAAGTGTTTTAGATTGAGTACATTCATAGTAAACATGATGTCAAAGACATATTTTGTACAGCAGGCCCAATACTTATCTCTTCCCTAGTCTTGCCAGATCCTGTGAGGTTTCTATAACAGATATATGGGTGCAATTTCTTATTTGTGATAGATACTCTTGACAACTTCTTTTCAACTCTGGATGGACTGCATCATCTGTGTCAGATTGTGGATTGAGATGTGATCATTACAGTTTATGATCAGAGCTTGTTTTCTGTATTTCTTTAAGTTTGTTTTCTGTAAACAGGAAATGATGGGGGTTGATATTGTCAGTGTTGTTAATTGTAATGGCAAAATATTTGTTCTGCTTGTGAGATGTATTCCTATACAGTAGGAAAcctttgaggctatatagtgtggAGGAGTTTATAAACCAAGACAGAAGGTCAATATTTGGGTTGTCTCCCTgaactttattattattatctctCAACAGAGAATTAGTCAAAACACAGTTAAATATGATGCTTGCATGATATTCAACTATATTGCATCACATAGTGCTAAATTGCACCAACTTCCATGCTCCAAAACTCCCCTTTCAATTGCAATTATGTCCCtaactaaaaatatatatatatttgggacACCGCAAgggtctcctctccttttcttcccAGCCTGGCTAAGTGTCTGCTCATCTGGAGCCCAGGTCAAAGAAGAaattgacctctgacctctagccCAGTCTGACCAGTAAGCGCAGACCTGGAATTCATAAAAACTGTCTAGTACATCACCACCTAGACAACTAACAGATAGCATCAACTGGACTAGAGGATAGCATAGCATTGAGGATCTATTCATGCAGCCAGACAACAACGGTGGTGACCAGTGATTAAGTGAGTGTGGCCTGTCTGTTGCCTGGCCCCCCACTGGGAGAGTTTTGAGAGGGAGATTAACTCATATCTGTCTACTGAGGACAAAATGGTGGCTCGTCCTCAGTACCCCAGTTTGGTATTTTCATTGGAACCCTTGTGTGATGAGATTAAAAGAGCTGATTACATGTACTGTGTTTCAAATGCCAACGATCGACAGGCTCCTTCACACGCTTAACCGCTTGGTTGGAATTAAATTGTTTCTCTAATGTCTGATGATCACAGGCAGAATGTGCTTTACCTCTTTTTCCCCTTTTATGTTTTCACAAAGTTAATTTATTCATGGAATATATTTCTGTAGCAATGCTTTGTTCTCTCTCGCTAGGTGATTAACTATGTTGATGTGGCTTTTAAACATAATTTAGTGTGACTTTCAGTGATACGGATGAATTACAGTTAAAATCCTGGGCTAGTGATACCATGTAAATACTCTGTTTGATTAGAATTATTCATTTTCTAATTGTGTTGGTTCTTCACTGAATTACAAGTTGTGTAATGTTGTTTTGGACAGTCAATGTTATCTTTGGAGGCTATTTCTCTATTTCTTTTCACCCAAAATTACCTCTATTTTTGAAGCCAAGAGGAAGCTCTGATCTTGCGTCGTCTTGAAATccaattacaaaaataaaaa
>TU1206680
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1206677 False 5431 lncRNA 0.39 1 30340029 30345459
TU1206679 False 3132 lncRNA 0.39 1 30340029 30343160
TU1206680 True 1705 lncRNA 0.39 1 30340029 30341733
Loading

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110537406 LOC106567890 coding downstream 16885 30307875 ~ 30323144 (-)
LOC110537396 LOC106567888 coding downstream 35787 30270316 ~ 30304242 (-)
LOC110537402 LOC106567887 coding downstream 82326 30237347 ~ 30257703 (-)
LOC110537397 LOC106567884 coding downstream 371073 29966318 ~ 29968956 (-)
LOC110537405 NA coding downstream 379609 29951555 ~ 29960420 (-)
LOC110537410 LOC108431284 coding upstream 1892 30347351 ~ 30369324 (-)
LOC110537411 LOC106567893 coding upstream 24708 30370167 ~ 30380619 (-)
si:ch1073-143l10.2 LOC106567895 coding upstream 72583 30418042 ~ 30422902 (-)
LOC110537417 rnasek coding upstream 101927 30447386 ~ 30452456 (-)
LOC110537415 LOC106567896 coding upstream 111076 30456535 ~ 30460284 (-)
G1059160 NA non-coding downstream 7147 30330970 ~ 30332882 (-)
G1059168 NA non-coding downstream 83725 30256078 ~ 30256304 (-)
G1059166 NA non-coding downstream 85556 30254184 ~ 30254473 (-)
G1059165 NA non-coding downstream 86432 30253329 ~ 30253597 (-)
G1059164 NA non-coding downstream 94097 30245622 ~ 30245932 (-)
G1059185 NA non-coding upstream 4184 30349643 ~ 30349889 (-)
G1059188 NA non-coding upstream 10039 30355498 ~ 30355800 (-)
G1059190 NA non-coding upstream 10487 30355946 ~ 30356240 (-)
G1059194 NA non-coding upstream 14371 30359830 ~ 30360077 (-)
G1059202 NA non-coding upstream 24074 30369533 ~ 30369732 (-)
G1059183 NA other downstream 4773 30334827 ~ 30335256 (-)
G1058320 NA other downstream 536413 29800853 ~ 29803616 (-)
LOC110537376 NA other downstream 917714 29393595 ~ 29436595 (-)
G1057998 NA other downstream 1072038 29267444 ~ 29267991 (-)
LOC110537425 LOC106567906 other upstream 289599 30633836 ~ 30638038 (-)
LOC110537432 NA other upstream 392617 30738076 ~ 30773877 (-)
G1059610 NA other upstream 722126 31067585 ~ 31070860 (-)
G1061331 NA other upstream 1645751 31991210 ~ 31992555 (-)

Expression

G1059154 Expression in all Baseline Samples

Bar chart with 20 bars.
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying values. Range: 0 to 10.
End of interactive chart.

G1059154 Expression in each Bioproject

Bar chart with 21 bars.
G1059154 Expression in each Sample
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying Expression. Range: 0 to 400.
End of interactive chart.

Co-expression Network