G1067821


Basic Information

Item Value
gene id G1067821
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048576.1
NCBI id CM023230.2
chromosome length 102853256
location 37586289 ~ 37589330 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1216174
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>TU1216175
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>TU1216177
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>TU1216178
GTTGAGTAACCCCTCATCTGCAATTGATCTCTCATGCAGTTTGTGttcaataaaacaaaaacacaggaTGTTCGTTATTCAGTCATTTGACAAGTATTTCCATATGTAGGTTACAAAAACGTGTTACAAAACGTGTTCCAGTTCAAGAAACCAAACAATATTTTAATTTGTTCATGTCATATTAGTACaaaaaatgaattaaaaaaaaagacattcCCAACAAATTCCCACTGCATTCTGGGACAATACAAAACACTCAGACACAAGGAGAGCATGAACACTCAAAAACATCTAATCACCTTTCTAGTGCCTTCCCTCagccagcccacacacacacacacacacacacacacacacctcaaacctGGGCAGTGTACACACACCTCAAATCTAGGCAGTAACAGAAATgtgcagtgtacacacacacctcaaacctGGGCAGTAACAGAAATgtgcagtgtacacacacacctcaaacctGGGCAGTAACAGAAATgtgcagtgtacacacacctcaaaccTGGGCAGTAACAGAAATgtgcagtgtacacacacacacaaaacacagaaatcgATATAGACACAATAAGACCATATCAGGATGAGTCTCGAGCTGTATATACAAACACCCTTTCAAGGGCACAAGAGGTTTTACGCATATTTCCACACTCTGCCTATTCAACCCTATTAAAGCCATGTGATTCTAGGCACACGATGGAACATTAGGAAGATGTGCAGCTGTGGGTTTAGCGTCAGGCATCCTATAGCTGACATAGGAAGATATTAACAGCGTTAACCACTCAGCTCTCCACTCAGGCATTTAGAACATATTTCCTTATTAGTCAATGCACATTAGTATACTTTGAGACATCTTACATACCTCCCTTTCAAGGGATAGAAATGTTTACAGATTCGGTTTGGGTCACCACATTATTCAAAGAACGACTGTCAGTGTTCATTGTTCTCCAAAAAGCAACTACAGTTTCTATTATGATGTCCATGTGGACGCTAGTGTGGCCTTTAGATTCATTTTAAGGGTTGAAAGCAATAAAATGGCACTGTGTAAAGAAAAATGGTCCACGGTCACAGAGCAAAGCTAAACTTTTAAGGCAGAAATGGCACCCTCTGATGGGCAAAAAGGAAACAATTCTAAAAGGTAATTCTAAAAGGTAATTTACACGCTTTAAAGAAAAATATTCACATCATTGTTGGGGAGTCTTTGTACAGAACAAACTATTATTTACACACGTCTCAGTCAAACACATTTTTGCTAATAATTAACTcagacaaataaaaatgtatctaGACCCAAGAAGATGGAGTGTAACATTTGAATCCATTTAAGACCATGTTTGAACAGGGAAAGGAATCCACTGAGTTGCATCTGCTTCATAGAAGTCAAAACTGGTGAATTTGTATGGACCCATTTTTCTAAGTCAAGCAGAAAAGCTGAACTGGGAGGAGTTGCTCACACAGCACAGGGAAAGAGCGAAGATGGAAATTACAGTGTGGACACAAATGCTATCAGGGAAGAAAATGCAAAACAACACCTACACATGTGCCTATGTTACAGAGCTCATCTTGACAAGGGCTGCAGAAAACACTTCTTCATGAAAGAAAGAACCCTGTATGTACGAATAATGTATGTCAGCTTTGATGTGCAATGAAGAGACAAGGTCAACGAGCACTTGAAGCCCAGACCGTCAATCAAGAATGGTTAATAATCAATTCAGTCAGAATCCACCCAATACTGTGAGCAAGAGTCATTTCCCTACTAAGAATTCACTCAATACCAATTCAAAATGTAGCCATCTTTTACAGAGGCCAGAGGAGGACGTACCATTGATCCACATTTCAATGTTTGTCTACACAGCAGCAAAACTGGTTCTTGTTCTGAATGATTTACTGGGGGGAAAGCAACTCCAATCTAACGGGAGAAGTTGATGAAGTACAGTAGTTTACATTGACAAGATTTACACAGAGGGGACTTTGGGCCATTTTTCCTTGTGTTTCATCCCCGCCTTTCCTTCAGTTAACGTAAAGGGTTCCTAACACGTTTTTATGCCATGTTGATACAGGAATTAAGGTTGTAAATGTGTCCACTTCATTTCAAGGCATTTGTTTAGACTTAACCAGAATTGAGTGTTCATTACAGCACTGTGTGATACCTGCTTGACTGTGCTCCTCCACACAAATACATCAATAGCACCTCATTGAATCAGAAAGGCAGAGAGCTTTTGATGTTCTCTTTCTGTTGTGAAGCAGGTGCCCCCTGCTTctttctaaaaattcaccttagCTCATAATGCCCAGACCAAAGCCCAATCTGAGTATGTAGACATTGCAAAAGTCAACCATGACCTCATTAGTTACATATTATAGCTTCCTATTTTATTTCACACCGACAGGAATATATGTCTCTCGCAAATATATTGTTCATCGCCCCATAAACTCATATTTcataaaatgtacatttaaatGAAAAGATGAATGAATGTGACCAAATATATTGTGACACATTTTGCAGTTAGTCGTCATCATCAAGGTGCTTATTTACTGAGTTGTAGTATTCTCGTAGTATTTGGGTTGTCAGTGACTAGAATGAGTGCATGCAAGTGTCTACACAAATGCTCATGTGCATTAAAGTTATATACACTACGATCCAGTTCCCACATGGCGATTGCCACTGTCTAGACTGGATGTGGTGTCCAAATTGGAGGGGAATCACCTCTCTGTGGTCTCTACTGTGGTGAAGCTTAGGTCATCAGAGATCA
>TU1216179
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU1216178 False 2774 lncRNA 0.40 2 37586289 37589138
TU1216179 True 2986 lncRNA 0.40 2 37586289 37589330

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110537540 LOC106567738 coding downstream 79051 37505206 ~ 37507238 (-)
LOC110537538 NA coding downstream 137339 37445886 ~ 37448950 (-)
LOC100136717 LOC106568026 coding downstream 448218 37131785 ~ 37138071 (-)
LOC110537534 LOC106568022 coding downstream 546359 37019987 ~ 37039930 (-)
trnal-caa-105 NA coding downstream 649959 36936220 ~ 36936330 (-)
LOC110537546 ppm1e coding upstream 13828 37603158 ~ 37667366 (-)
LOC110539142 NA coding upstream 85331 37672182 ~ 37706371 (-)
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LOC110539143 LOC106567739 coding upstream 188657 37777987 ~ 37790177 (-)
LOC110537549 LOC100380745 coding upstream 213266 37802596 ~ 37886734 (-)
G1067791 NA non-coding downstream 26813 37558571 ~ 37559476 (-)
G1067792 NA non-coding downstream 27896 37557760 ~ 37558393 (-)
G1067749 NA non-coding downstream 32376 37466614 ~ 37553913 (-)
G1067783 LOC106603469 non-coding downstream 49433 37519795 ~ 37536856 (-)
G1067679 NA non-coding downstream 141974 37443813 ~ 37444315 (-)
G1067828 NA non-coding upstream 7166 37596496 ~ 37597009 (-)
G1067832 NA non-coding upstream 20028 37609358 ~ 37609590 (-)
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G1067872 NA non-coding upstream 169624 37758954 ~ 37760121 (-)
G1067426 NA other downstream 648310 36937319 ~ 36937979 (-)
G1067390 LOC106568016 other downstream 673532 36909431 ~ 36912757 (-)
G1066163 NA other downstream 1486815 36099030 ~ 36099474 (-)
LOC110537579 LOC106603438 other upstream 1452190 39041272 ~ 39072520 (-)
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fkbp6 LOC106567715 other upstream 1746774 39336054 ~ 39343006 (-)

Expression


Co-expression Network