G1132342


Basic Information

Item Value
gene id G1132342
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048576.1
NCBI id CM023230.2
chromosome length 102853256
location 99046418 ~ 99047786 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1288931
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>TU1288934
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>TU1288936
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>TU1288939
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>TU1288942
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>TU1288943
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1288931 False 1001 lncRNA 0.42 2 99046418 99047786
TU1288932 False 679 lncRNA 0.39 3 99046418 99047786
TU1288933 False 679 lncRNA 0.39 2 99046418 99047786
TU1288934 False 633 lncRNA 0.38 3 99046418 99047786
TU1288936 False 1093 lncRNA 0.43 3 99046418 99047786
TU1288937 False 633 lncRNA 0.38 2 99046418 99047786
TU1288938 False 909 lncRNA 0.42 4 99046418 99047786
TU1288939 False 679 lncRNA 0.39 3 99046418 99047786
TU1288942 False 955 lncRNA 0.42 2 99046418 99047786
TU1288943 True 679 lncRNA 0.39 3 99046418 99047786

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110538834 LOC106601838 coding downstream 798 99042019 ~ 99045620 (-)
btr02 LOC106606318 coding downstream 5584 99028168 ~ 99040834 (-)
LOC110538838 LOC105029615 coding downstream 21030 99021958 ~ 99027957 (-)
LOC110539185 hgs coding downstream 26785 98981732 ~ 99019633 (-)
LOC110514497 LOC106602019 coding downstream 139975 98766105 ~ 98906443 (-)
LOC118937838 LOC106606233 coding upstream 5498 99052890 ~ 99059256 (-)
LOC110538840 LOC106601903 coding upstream 42835 99090621 ~ 99092245 (-)
LOC110538845 LOC106606260 coding upstream 130300 99178086 ~ 99183106 (-)
LOC110517411 LOC106602071 coding upstream 170828 99218614 ~ 99231888 (-)
LOC110538879 metrnl coding upstream 303743 99351529 ~ 99380971 (-)
G1132339 NA non-coding downstream 12880 99033293 ~ 99033538 (-)
G1132330 NA non-coding downstream 33502 99011586 ~ 99012916 (-)
G1132319 NA non-coding downstream 52536 98993358 ~ 98993882 (-)
G1132326 NA non-coding downstream 59223 98986216 ~ 98987195 (-)
G1132340 NA non-coding upstream 501 99048287 ~ 99051795 (-)
G1132349 NA non-coding upstream 13936 99061722 ~ 99061936 (-)
G1132350 NA non-coding upstream 15350 99063136 ~ 99063422 (-)
G1132356 NA non-coding upstream 19544 99067330 ~ 99067532 (-)
G1132328 NA other downstream 36306 99006627 ~ 99010112 (-)
G1131863 NA other downstream 662603 98382970 ~ 98383815 (-)
LOC118936513 cog1 other downstream 786731 98230363 ~ 98259687 (-)
LOC110485313 LOC106535622 other downstream 1071698 97959753 ~ 97974748 (-)
G1131666 NA other downstream 1185900 97857599 ~ 97860518 (-)
G1132564 NA other upstream 118162 99165948 ~ 99166607 (-)
G1132569 LOC106606209 other upstream 125879 99173665 ~ 99177478 (-)

Expression


Co-expression Network