G1134714


Basic Information

Item Value
gene id G1134714
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048576.1
NCBI id CM023230.2
chromosome length 102853256
location 102458230 ~ 102461000 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1292322
gtaccaggtagttgaggtaataatgagactataaggagtaccagtactgagtcaatgtgcagggtaccaggtagttgaggtaataatgaggctataaggagaaccagtactgagtcaatgtgcagggtaccaggtagttgaggtaataatgagactataaggagtaccagtactgagtcaatgtccaggggtaccaggtagttgaggtaataatgagactataattgagataatacagtgccttgcgaaagtattcggcccccttgaactttgcgaccttttgccacatttcaggcttcaaacataaagatataaaactgtatttttttgtgaagaatcaacaacaagtgggacacaatcatgaagtggaacgacatttattggatatttaaaacttttttaacaaatcaacgTGCAAAATTAATACATCAATAATATATGTCTTGTGCTTTTGGCAATGATTTATGTAAAATAATTATGTATAAAAAGTGATACCATGTGTGTCTCTAAAGCGTTTTGTCTTCATTTTGGCAGATTAACTCATGCTTATTCCCCAAGATTAACTCAGGTTTTCACCCAGTGGTTAAGGAGTTGGACCTGTGGCCTAAAGGTGGCTGGTTTGAATCCCGGTTGAAATGTGCTATTTGGTAACCACTAGGGTTGCATGATGTAATTTATTGACGGCTGGAAGTCGCACTCTGTCTTTTCTATTCCGAGATGGTTTACTCGCAATATCAGatattaacatgattttttataATGAATGTATACTGAGGTTGAGGTTCTGACTAGTGATTATTTACCCGGGATTCAATACCTGCTATAGtcactttttttttctctcccaaaagcaacacagcccaaATACGAGATATATAGCTAACTAAAGTAATGAGTAACCACATTAGAAAATCATGGTACATATACTCTGTGGTTGCATTCTATTTTAtgtccatcatattgctgcttgtagccTATGACTGATGCTTCATGGTCTTATGCTGCCGTCTATTGGACATTTTGcaatgaaaagttattaattcaTGTACAGACGTTGGAGGGGCAGCTGAGAAATAAAGTGTATTTTTCTGGTTAATTCCTTAGATCTCAAACCTGCCCCACCTTTCCCATGACAATTGCTGGACTTTCACATAGAGGTTACTAGGTCACCCAGTTCAAACCacatatgaaaaataaaacagatGTGGCTTGTTGATCAAGTGTTCTGCCTTGCAATAATAAAGGGTTAATGTAGTATAGTACTAACATAATATTTTTACTAAAACAGTTTCTAAAATAATTCAGGTTAATGTTAATGCTAACAAGGTCATACGTAGGGTTagatgctgatgtaaaaaggactttataaatacatttgattgattgtgaGGTTTAGGGATTTTAAGGCAAAAAACAGTATTGGGTTAACAGCTCTCTTGCTCCTCCCTGTGGCCTTATGCGGGTACTACATAACTCATTCACGACACCTGCTAGGCTCATAATCTGAGGTAGCAACTGCGTCAGATCTAGAAATCAATGCGCTAGACCTGTCCATTTGTATTCTAACTCAGTGAAACTGCGCAGCTTTCGCTCAATCTGATGTCTACAAACGGACATTTCGATGCATATCAAATTACCCAGCAGCCATTTAGAAACAACAAGTCgtcaaaaaaaaatgttatttcgTAATTAAAAAATGTCTTCTGGCTGTTTAAATCTGCCACATCTTGAAAAAGAGGACAGGGATATTCATTTTGGTTAGGTGGTATACTGTATcctcagacacttcctaacctcctataaagggttctatatatattctatatatactgtatactcagacacttcctaacctcctataaagggttctatatatattctatatatactgt
>TU1292323
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>TU1292325
gtactgagtcaatgtgcagggtaccaggtagttgaggtaataatgaggctataaggagtaccagtactgagtcaatgtccaggggtaccaggtagttgaggtaataatgagactataaggagtaccagtactgagtcaatgtgcagggtaccaggtagttgaggtaataatgaggctataaggagaaccagtactgagtcaatgtgcagggtaccaggtagttgaggtaataatgaggctataaggagtaccagtactgagtcaatgtgcaggggtaccaggtagttgaggtaataatgagactataaggagtaccagtac

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1292322 False 1892 lncRNA 0.37 2 102458230 102460341
TU1292323 False 1917 lncRNA 0.37 2 102458230 102461000
TU1292325 True 321 lncRNA 0.44 2 102460105 102460615

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118937850 NA coding downstream 13571 102429122 ~ 102444659 (-)
LOC118937612 LOC106593326 coding downstream 226152 102116605 ~ 102232078 (-)
LOC118937870 NA coding downstream 358788 102028055 ~ 102099442 (-)
LOC118937864 LOC106603827 coding downstream 371112 102080928 ~ 102087118 (-)
LOC110512533 LOC106603753 coding downstream 606054 101820763 ~ 101852176 (-)
LOC118937613 LOC106603753 coding upstream 23769 102484769 ~ 102536330 (-)
LOC118937849 LOC106593326 coding upstream 182709 102643709 ~ 102646059 (-)
LOC118937851 NA coding upstream 266116 102727116 ~ 102730779 (-)
LOC118937857 NA coding upstream 351601 102812601 ~ 102819699 (-)
G1134689 NA non-coding downstream 80305 102377386 ~ 102377925 (-)
G1134687 NA non-coding downstream 85587 102372035 ~ 102372643 (-)
G1134683 NA non-coding downstream 111042 102339661 ~ 102347188 (-)
G1134682 NA non-coding downstream 119352 102318097 ~ 102338878 (-)
G1134680 NA non-coding downstream 123945 102294538 ~ 102334285 (-)
G1134715 NA non-coding upstream 99 102461099 ~ 102463487 (-)
G1134725 NA non-coding upstream 42922 102503922 ~ 102530909 (-)
G1134738 NA non-coding upstream 109326 102570326 ~ 102571144 (-)
G1134745 NA non-coding upstream 124885 102585885 ~ 102587194 (-)
G1134754 NA non-coding upstream 153978 102614978 ~ 102615759 (-)
G1134697 NA other downstream 68878 102388776 ~ 102389352 (-)
G1134329 NA other downstream 83088 102367099 ~ 102375142 (-)
G1134299 LOC106581592 other downstream 91695 102364135 ~ 102366535 (-)
LOC118937843 LOC106601187 other downstream 95191 102236650 ~ 102545195 (-)
G1134301 NA other downstream 221709 102235089 ~ 102236521 (-)
G1134756 NA other upstream 165065 102621230 ~ 102627820 (-)

Expression


Co-expression Network