atpv0e2 (va0e2)


Basic Information

Item Value
gene id atpv0e2
gene name va0e2
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048577.1
NCBI id CM023231.2
chromosome length 73332040
location 8265675 ~ 8269763 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021556681.2
ACAATTTGATATTTATTTATCTTTCAGCCGGTGATCTATTCGGTGTAACGATGGGCTCTTTCGCGCTGCCGATGATCTGTTTCACCACGTTATGGGCGCTCGTTGGTATTGTAGCACCCTTTTTCGTGCCCAAAGGACCAAACCGAGGGGTTGTCATCACTAGTTTGATCTTGACAGCTGTTTGTTGTTGGTTATTctGGCTGATAGCCATCCTAGCCCAGGCCAACCCTCTGTTTGGACCTCAACTGAAGAACGAGACTATCTGGTACCTCCGCTACTTCTGGGAATAACACCAGggTCGGGTTCACTTTGATGCTCCGTTGACCACATATCTTCATTCCCTTCATCCATCCTGGACTGGATTCTTTTACAACTTGACTCCTGAAACCCGTCTATACCCTCCTCTTTACATCCCCGGCTacattcctctatccctccatcccaatGTCTTTCTTACGTCACTGCAACGTTGTCAGAATGTTTTGCATCGCCATCTGAACCTGCAGAAGTCAGATAGGAGAGAATCTGCACTGTACAATTTACAtttgctattacagtgaaagaataccatgctattgtttgaggagagtgcacagttagaAACTTAAAGTTatgaataaaccaattaggcacatttggccagtcttgatacaaaatgttgaacagaatgcaatggttcattggatcagtctaacactttgcacatacactgctgccatctagtggccaatatctaaattgtgcctgggctggaatgATACGttttggcctttctcttgcatttcaaagatgatggtaaaaaaacaatacaaaaaaacacattgGTTATTTTCTTTGTATTCtttttttaccagatctaatgtgttatatactcctacattcatttcacatttccacaaacttcaaagtgtttcctttcaaatggtatcaagaatatgcatatccttgcatcAGGTCCTGAGTTACAAGCAgttcgatttgggtatgtcattttaggtgaacatttttttggggggaaagggtccgatccttaagaggttttaaacaaTCATGTTCTAATGTTGGGATCAAATCTGTGACAACATAGATAAGCGATGTATAATACTCCTTAGACAGAAAAGTATATGACACTATATATGTAAGGATTATATGAAACATATATCTAGGTCATCATGCTGCTGCTGTTCCAACGTGTTGTAGAATGCATGCAGAATTCTATTTATTGGAAAGCAGGTATGAAAGTAATATGGCATATCAAATGatatataattgtatgtgttacATATAATCCTTACAGGTGGGAAATGTTCTATTTTTGAGCAAAACAATGTATTTGTTTGGATAATGCACTGGAAGGCATAGCTCACACTGATAAACCTGATATTACCAGGTCGCATATAGATGTCATTTGCGTCTCTAGCTACAGTTAAAACGTGTAATCGTGGAGGTTTAGTTGacctgttattgttattgtttacaATTCctctacatgttgttgttattattattattattatcatcataagAAAGTCTTAATAGAAGTTTAGTATTTATTTTTACTGACGTCCTGGCTCTTACATAAGTTGACTGTTATGTTATGTGGAGTCAGTGTCTGTATTATGTTACGTTGATGATTATTGTTGAGTCATTCTGTGTGTAAATACTAGTACATTTCCAGGAGTGGTTGGCTGGCCGACGGCCATGAGAAACTACACTCGAGAGCCCCACTCCATTTTAAGCGTCTTTAAAATCTCAACCACTAGGACAACTCCTTACTCTAGCCTCTCTCCTTTCCCATCGTCGCTCTCCAGGATCGTTATGGTCCtcctagggttgcaaaattccagtaactttccccaaattccctggtcagaaatcctggttggaggatacCCAGATTTCGTAAACATTCCCTTCTAATTCCAAGAATATCCCTACTGGGATTTCTGGaaacctgggaatttggggaaattTCCTAGAATTTTTCAACCCTAGGTCCTCCTAGTTACCATGGTGATCATGATCACAATATCAGCCAGTGTTTGTCGTCGACCACAATACAACTAGTCCTGCTGCAGGGACAGGGTTGGAGGACTCAATTCCAATTCAACAATTAACACCCATCAATTCAGGAATTGAATGGAAATGTCCCTATAAAATGAACTGAGAAATCATAATTATGAATTGAAACATTTCCATTCCTAAATAAACTTGAGTTGAACTTGAATTGACTCCAAACGCTGCAAGTGCTTGCTATCAGCCTCTGCCCCCTTCTTGTGTAAACGATGTGTGATGCTTTCTGTAGGAAGGCACCCCAGCTCTAGCCAGCCACAACAACCTTCCctgccctccctccacccccacccagAGAGAAGCCATcttagcctgagtgccagtcttgTTAGTGCCAccatgccaactccttgtcattCGCTGTCATACTAaacatgtttggcttgacaatcgCACCAATGTAGTTGTCAAGATGGCACAaacacatctgggaccaggctagggccTCCTATCTCTGAGACAGCTTGTTCCTCAGCTCAGCCAAAAAGTCAAGAAAGATACATCAATATACAGCTACTTTTGAGAAAGACCAAATGATGTTGTGTTTTCCTTTAAGCCTTGTTGATCGTTGTGGTGGCGGTTTACAGAGGGATCAAAAGTGATAGATCAAGTCCACGTCCCCAATGGCAACCTATTGCCTATACTCTATAGCGCACTCCTTTTAATcagggcccattgggctctgatcaaaagtagtgcactatgtagggaatagggggtaaTTTAGGACGCTCCCCGAAGTAGACATGATTCAGCCCAGGGCTGACATGAATAGATCAGTTTACATGAGAGTCCTCTGTTCTATGTATTCCAGCTATGTAGATATGTGGATATGTGGAAGCCTCGGTCCATTATTACGAACACTAGACCTAGGTTGCAACGGGCACAACAGCTCGTTCATTGTGGTCACCATGGAAACATTGAGCGTAtagatgtgtgtgtttttgacacTGGAAAAAGACTTGTCTGACTCAGGCCTTGTGTAAGTGTGATCTAATGTGTAGGTGTATACAGTGACATTGTCCATGTGAATCCCTTAGTAAAAACCCTATTTCAATGTCTGGTA
>TU1301478
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>TU1301479
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Function

NR:

description
V-type proton ATPase subunit e 2-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021556681.2 False 3139 mRNA 0.41 4 8265675 8269690
TU1301478 False 3212 lncRNA 0.42 4 8265675 8269763
TU1301479 True 3038 lncRNA 0.41 5 8265675 8269763

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110485582 LOC106591223 coding downstream 2735 8225298 ~ 8262940 (-)
LOC110485578 LOC105012087 coding downstream 64655 8180481 ~ 8201020 (-)
LOC110518530 LOC106591329 coding downstream 146532 8098509 ~ 8119143 (-)
LOC110485610 hoga1 coding downstream 185328 8058941 ~ 8080347 (-)
LOC118938183 LOC106591333 coding downstream 259202 7925933 ~ 8006473 (-)
ncf4 p40phox coding upstream 385416 8655106 ~ 8696718 (-)
LOC110515367 LOC106591437 coding upstream 459533 8729223 ~ 8738426 (-)
LOC110515366 pla2g6 coding upstream 469045 8738735 ~ 8787152 (-)
LOC118938524 LOC106590932 coding upstream 600331 8870021 ~ 8872667 (-)
LOC118938192 NA coding upstream 604344 8874034 ~ 8878068 (-)
G1141453 NA non-coding downstream 14055 8251156 ~ 8251620 (-)
G1141439 NA non-coding downstream 76508 8186145 ~ 8189167 (-)
G1140822 NA non-coding downstream 93407 8171003 ~ 8172268 (-)
G1141458 NA non-coding upstream 6432 8276122 ~ 8276431 (-)
G1141461 NA non-coding upstream 6940 8276630 ~ 8301593 (-)
G1141462 NA non-coding upstream 23799 8293489 ~ 8370459 (-)
G1141459 LOC106591407 non-coding upstream 59400 8329090 ~ 8522724 (-)
G1141476 NA non-coding upstream 69245 8338935 ~ 8340345 (-)
G1140367 LOC106601621 other downstream 569929 7409260 ~ 7695746 (-)
G1140368 LOC106591490 other downstream 605354 7659697 ~ 7730493 (-)
LOC110493310 LOC106591489 other downstream 760976 7490185 ~ 7534632 (-)
G1140343 NA other downstream 1019025 7245712 ~ 7246650 (-)
G1141490 NA other upstream 61445 8331135 ~ 8332518 (-)
G1141517 NA other upstream 156923 8426613 ~ 8452319 (-)
G1141579 NA other upstream 321275 8590965 ~ 8592898 (-)

Expression


Co-expression Network