XLOC_030235


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_030235
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007116.7
NCBI id CM002889.2
chromosome length 72500376
location 34721137 ~ 34731442 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00061741
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Function

GO:

id name namespace
GO:0005874 microtubule cellular_component
GO:0005737 cytoplasm cellular_component
GO:0015631 tubulin binding molecular_function
GO:0008017 microtubule binding molecular_function

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00061741 True 10306 lncRNA 0.36 1 34721137 34731442

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_030233 enc1 coding upstream 82513 34622320 ~ 34638624 (+)
XLOC_030232 gfm2 coding upstream 120427 34578479 ~ 34600710 (+)
XLOC_030231 aif1l coding upstream 145635 34549365 ~ 34575502 (+)
XLOC_030230 lamc3 coding upstream 178657 34407763 ~ 34542480 (+)
XLOC_030229 NA coding upstream 426064 34293261 ~ 34295073 (+)
XLOC_030236 NA coding downstream 97362 34828804 ~ 34837166 (+)
XLOC_030237 BX530075.1 coding downstream 188953 34920395 ~ 34921911 (+)
XLOC_030238 ankra2 coding downstream 250142 34981584 ~ 34987273 (+)
XLOC_030239 foxd1 coding downstream 266321 34997763 ~ 34999553 (+)
XLOC_030240 CR377210.1 coding downstream 389606 35121048 ~ 35127014 (+)
XLOC_030228 NA non-coding upstream 783717 33935619 ~ 33937420 (+)
XLOC_030221 NA non-coding upstream 1382668 33332449 ~ 33338469 (+)
XLOC_030216 CR855258.1 non-coding upstream 1727246 32993786 ~ 32993891 (+)
XLOC_030213 CR925757.2 non-coding upstream 1834539 32886472 ~ 32886598 (+)
XLOC_030243 NA non-coding downstream 784478 35515920 ~ 35527121 (+)
XLOC_030248 NA non-coding downstream 1272519 36003961 ~ 36177578 (+)

Expression


Co-expression Network