LOC110486047 (tmem63b)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110486047
gene name tmem63b
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048577.1
NCBI id CM023231.2
chromosome length 73332040
location 25220536 ~ 25319211 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021557361.2
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TATGTAAGATCATTTTTCAGATATACAGCACCAATGAATAGCGATGCTTCCATTTATTTTTGTCACATCAGTTTGGGTGCAGTGTGTTTTCATGCACTTAGATGCAAAGTATCATgaagttgtctctgattgaagtGCAATCAGTCAGATGCCCGGTTGAGAACAACATGGCATCATGGGCTGGCCCTTTTGGCTTAGATGTCGGCCATCTTTGTTTTGCACTTTCTGGAACAGAACTGTGGTATTAAGGCCAGAGTCTATTTTGGCCCTCAGCCTCTTTTCTCAGCCTGCATAGCAACTACCCCATTTGGTGTTCAGTTATACTCTGGGAAATTGTGATGACATTTCAAAGCCAGTGTGCACTTTCTTTTCTAAATGAACATCAAGCGCAAAACACATGAAGATACAATCAAATACTTCCATAAAAGGCATTAGGTAGAAATAAATTAATGCACAACTATGTATATAATTTCATATGTCTTAAATTACCACAATTTCATGAATTTGATTTATATAATCCAAAACAGAAAAAAGTGTATAACAGAACAAAAGCGGAAATAAATGTCACTTTCCAAGAGTAATAAATCACTGGGTAAGTATAATCAATATACAGTAGTGATGGCTCATTCGCCCTAGTAGCTCCCTAATACTGTTAAGTGGAGCATTCAAAGTATTGCTTTATAAACCTAGCCAGTCCTTTCAGATATGCGAACACCATAGGGATAGGGCCAAATGGAAGAGACTACGGACCAAAAATTGACCAAGTGTGGCTGCACTGACTAGTCCAACCGATGAGGTGCAGTGATCGTGAAGGTCTGCTAGAGGTCACTGTatagctgtgtttttgtattaCTATAATTAGTCATTCGTTTTTGTATTTCATCTCTGTGCAAAATGATTTGTAACGAAAAAAAGGATGTTTTACCAATTTGCATCAGGAACATACAAGTGCGACAATCAGCAAAGAAATAGAACTAGAGCAGTCTCAGGtgtacttgtttttttttatgtttacatctgtttgtttttttacattgtattAGTTGTTTTCAACTTTGAGCGTTTCGATCTGTTGACGAAGCTAATCTATGAAAGCTATGGCTATTGGTAACATTCCATCAGAGGAAAAATGAAAACATGTACCATGGTTGTCTTGTTATTAGCAGCACATGTTCCTCTGTAGACACACTGAAATGACCATTGTATGGTGGTTTGTCACCTGTTTGAAAACCATTGCTCCATGCTGGATATATTGTCGCTTTTCTGTGTCTACCCTGGTCTGTAACTTCTGTTTCCCTTTAAGTGAGTGTGCACTAACACTATCCAGTGAAAGTACATTTTCCTGACACAATAAGACATATTTTAAGAGACTTGCTTGCTAATAGACAGTCTATTTCTCAATGGAAATGAAGTTATTTTACAGCAACACTATTCTATGGTGACAAAAAAGGCTTTGGGATTCAGGTAAATCGCAAAAGGAACTGTGTTCAGTGACACAGCCTATTCCAGATGTGATACCGATGTATGTATTATATTGATAGCTGTGACAATGCAGTTACATTTATtggtaatttttttatttatcatgATCtgagtttttatttaattttatattTGTTGCTTAGGATTTAAGTTGTGAAAAGAAGAATGTGATCTAAAAAATAAACGTGTCAAATGCTCAGAAGGATTGGGAATGGTTTGCTAAAAGTTTGTTTAGatttcaatatatatatttttgtaaatagCCATCAAAATTCACTATTAAGTTATGGTAGTGTTATAAAGTACATCTACAGTTTCTAATAAAGCATGAATATGGGTAGGGCTACGTAAATACA
>TU1320221
CATTGGAGAAAGAGAAGACTCAAACGGAACATCAAATTGGATTGCCAGGTTCCCAGGAAGATGCGGCTGTGAGCTTGCTCAGAGTGCTGATCCTGTGGGTCTTCACCTGATCGTGACCATGGGGATATGGCCAGGGGGTGTCCGGGCCTGCATTGCAGGCCAGGAGAACTGCTCTGCCAACAATGAATCCAAGGACTACTGTTACTCCGCCCGAATCCGCAGCACCGTGCTTCAGGGCCTACCCTTTGGAGGCGTCCC
>TU1320220
GCCCAGGTCTTACGGGACCCAATCACGGAGGACGCTTGCACAGGTAGTGGGGAGGAAGATCGGGGGTCCTCACAGGATGAGGAGATGATCAACACTGGGAATAGTCTCAATGAAGCCGATTTCCAGTCTGGTGAAGACAGCCTCATAGCCAACGAGGTCCACCAGTAACACTACCAGctgagaagggagaaagagagaaagatggtgAGAGAGGGATTTTGGAGAGGATGAATGCCAGACACAAACAAACCACCAACTTCACTTTGTATTCTAAAACAATCTGCAGTCATTCCTCCCCTATGCTCACCCACTctgtcacttttt

Function

symbol description
tmem63b Predicted to enable calcium activated cation channel activity; mechanosensitive ion channel activity; and osmolarity-sensing cation channel activity. Predicted to be involved in cation transmembrane transport. Located in actin cytoskeleton and plasma membrane.

NR:

description
CSC1-like protein 2 isoform X3

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_021557362.2 False 6904 mRNA 0.44 24 25220536 25319211
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XM_036940690.1 False 6985 mRNA 0.44 25 25220536 25319211
XM_036940691.1 False 6838 mRNA 0.44 23 25220536 25319211
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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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Expression


Co-expression Network