LOC110486555 (LOC106606986)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110486555
gene name LOC106606986
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048577.1
NCBI id CM023231.2
chromosome length 73332040
location 45730467 ~ 45742507 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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Function

NR:

description
phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1 isoform X2

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_021558254.2 True 3495 mRNA 0.44 11 45730469 45742507

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC118938603 NA coding upstream 50071 45680324 ~ 45680396 (+)
LOC118938601 NA coding upstream 50304 45680092 ~ 45680163 (+)
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LOC110486549 LOC106607014 coding upstream 83618 45632656 ~ 45646849 (+)
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LOC110486560 LOC106606997 coding downstream 169748 45912255 ~ 45931007 (+)
LOC110486562 peca1 coding downstream 388071 46130578 ~ 46138965 (+)
LOC110486563 LOC106606981 coding downstream 422487 46164994 ~ 46167292 (+)
LOC118936304 LOC106601427 coding downstream 431404 46173911 ~ 46176562 (+)
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G1179448 NA non-coding upstream 67345 45662862 ~ 45663122 (+)
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G1179362 NA other upstream 267524 45462588 ~ 45462943 (+)
G1179156 NA other upstream 417434 45312330 ~ 45313033 (+)
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tmem100a LOC106606948 other downstream 1725609 47468012 ~ 47471205 (+)

Expression


Co-expression Network