LOC118938356


Basic Information

Item Value
gene id LOC118938356
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048577.1
NCBI id CM023231.2
chromosome length 73332040
location 64951543 ~ 64954224 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036941958.1 False 2432 mRNA 0.43 2 64951543 64954224
XM_036941959.1 False 2180 mRNA 0.43 3 64951543 64954224
XM_036941960.1 False 1979 mRNA 0.43 3 64951543 64954224
XM_036941961.1 False 1895 mRNA 0.43 3 64951543 64954224
XM_036941962.1 True 1163 mRNA 0.43 2 64951543 64954224

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110487480 LOC106606286 coding downstream 5892 64798656 ~ 64945651 (-)
LOC110486630 LOC106601477 coding downstream 276510 64667592 ~ 64675033 (-)
LOC110510722 LOC106606296 coding downstream 289502 64641877 ~ 64662041 (-)
LOC110511879 LOC106606293 coding downstream 296056 64653378 ~ 64655487 (-)
LOC110513424 LOC106606290 coding downstream 311498 64627174 ~ 64640045 (-)
LOC118936529 LOC105012854 coding upstream 14952 64969176 ~ 65045461 (-)
LOC118938357 LOC106595583 coding upstream 533724 65487948 ~ 65503404 (-)
LOC118938101 LOC106603827 coding upstream 1265841 66220065 ~ 66267701 (-)
LOC118938102 LOC106603753 coding upstream 1270926 66225150 ~ 66385923 (-)
LOC118938480 NA coding upstream 1469373 66423597 ~ 66424229 (-)
G1196206 NA non-coding downstream 4966 64945835 ~ 64946577 (-)
G1196157 NA non-coding downstream 20068 64931175 ~ 64931475 (-)
G1196150 NA non-coding downstream 37148 64914019 ~ 64914395 (-)
G1196149 NA non-coding downstream 39104 64909661 ~ 64912439 (-)
G1196147 NA non-coding downstream 42857 64905631 ~ 64908686 (-)
G1196208 NA non-coding upstream 3054 64957278 ~ 64961176 (-)
G1196209 NA non-coding upstream 5865 64960089 ~ 64961357 (-)
G1196210 NA non-coding upstream 12427 64966651 ~ 64966949 (-)
G1196214 NA non-coding upstream 13662 64967886 ~ 64968303 (-)
G1196113 NA other downstream 156472 64794648 ~ 64795071 (-)
G1195997 NA other downstream 474171 64476970 ~ 64477372 (-)
LOC110487482 LOC106606373 other downstream 604136 64334669 ~ 64362841 (-)
G1195624 NA other downstream 1005779 63945076 ~ 63945764 (-)
LOC110485277 LOC106602060 other downstream 1446019 63495359 ~ 63509387 (-)
G1196409 NA other upstream 299055 65253279 ~ 65254078 (-)
G1196536 emp2 other upstream 515223 65446633 ~ 65472652 (-)
G1196797 NA other upstream 836499 65790723 ~ 65795435 (-)

Expression

LOC118938356 Expression in all Baseline Samples

Bar chart with 20 bars.
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying values. Range: 0 to 25.
End of interactive chart.

LOC118938356 Expression in each Bioproject

Bar chart with 21 bars.
LOC118938356 Expression in each Sample
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying Expression. Range: 0 to 600.
End of interactive chart.

Co-expression Network