LOC118938382


Basic Information

Item Value
gene id LOC118938382
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048577.1
NCBI id CM023231.2
chromosome length 73332040
location 72940912 ~ 72948496 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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>TU1372652
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>TU1372646
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>TU1372648
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>TU1372649
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>TU1372651
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>TU1372650
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU1372650 True 340 lncRNA 0.41 1 72947863 72948202

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110512991 LOC106592621 coding downstream 10295 72907046 ~ 72934615 (-)
LOC110517414 tmem114 coding downstream 148880 72746744 ~ 72796030 (-)
LOC118938108 NA coding downstream 738928 72201402 ~ 72205982 (-)
LOC118938378 sept12 coding downstream 781483 71981149 ~ 72163427 (-)
LOC118938107 NA coding downstream 963636 71978726 ~ 71981274 (-)
LOC118938383 natu coding upstream 2229 72950725 ~ 72971489 (-)
LOC110487136 LOC106596253 coding upstream 52407 73000903 ~ 73014178 (-)
LOC110487137 LOC106606270 coding upstream 69259 73017755 ~ 73030221 (-)
LOC118938384 LOC106591175 coding upstream 167442 73115937 ~ 73135850 (-)
LOC118938388 NA coding upstream 324100 73272596 ~ 73273245 (-)
G1201675 NA non-coding downstream 9639 72934974 ~ 72935271 (-)
G1201665 NA non-coding downstream 36816 72907529 ~ 72908094 (-)
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G1201723 NA non-coding upstream 25976 72974472 ~ 72974908 (-)
G1201587 NA other downstream 272983 72670163 ~ 72671927 (-)
G1201088 NA other downstream 792410 72152114 ~ 72152500 (-)
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G1200790 NA other downstream 1210326 71733297 ~ 71734584 (-)
LOC110494397 LOC106596483 other downstream 1216815 71690864 ~ 71728139 (-)
G1201668 NA other upstream 85 72948581 ~ 72949745 (-)
G1201724 NA other upstream 28807 72977303 ~ 72977759 (-)
G1201655 NA non-coding downstream 90215 72849343 ~ 72850697 (-)

Expression

LOC118938382 Expression in all Baseline Samples

Bar chart with 20 bars.
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying values. Range: 0 to 15.
End of interactive chart.

LOC118938382 Expression in each Bioproject

Bar chart with 21 bars.
LOC118938382 Expression in each Sample
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying Expression. Range: 0 to 400.
End of interactive chart.

Co-expression Network