G1137185


Basic Information

Item Value
gene id G1137185
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048577.1
NCBI id CM023231.2
chromosome length 73332040
location 3183425 ~ 3187091 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1295658
cataccataactactatagactaacaggactactctggttcataccataactactatagactaacaggactactctggttcataccataactactatagactaacaggactaacaggactactctggttcataccataactactatagactaacataactactctggttcatcactactacagactaacaggactactctggttcataccataactactatagactaacaggactactctggttcataccataactactatagactaacaggactactctggttcataccataactactatagactaacaggactaacaggactactctggttcataccatcactactacagactaacataactactctggttcataccatcactactacagactaacaggactactctggttcataccataactactacagactaacaggactactctggttcataccataactactatagactaacaggactactctggttcataccataactactacagactaacaggactactctggttcataccataactactacagactaacaggactactctggttcataccataactactatagactaacaggactaacaggactactctggttcataccataactactatagactaacaggactactctggttcataccataactactacagactaacaggactactctggttcataccataactactatagactaacaggactactctggttcataccataactactacagactaacaggactactctggttcataccataactactgtagactaacaggactactctggttcataccataactactacagactaacaggactaacaggactactctggttcataccataactactatagactaacaggactactctggttcataccataactactacagactaacaggactactctggttcataccataactactatagactaacaggactactctggttcataccataactactatagactaacaggactactctggttcataccataactactatagactaacaggactactctggttcataccataactactacagactaacaggactactctggttcataccataactactatagactaacaggactaacaggactactctggttcataccataactactacagactaacaggactaacaggactactctgattcataccataactactacagactaacaggactactctggttcataccataactaccataactactatagactaacaggactactctggttcataccataactactacagactaacaggactactctggttcataccataactaccataactactatagactaacaggactactctggttcataccataactaccataactactatagactaacaggactactctggttcataccataactactatagactaacaggactactctggttcataccataactactacagactaacaggactactctggttcataccataactactatagactaacaggactactctggttcataccataactactatagactaacaggactaacaggactactctggttcataccataactactatagactaacaggagtaccctggttcataccataactactacagactaacaggactactctggttcataccataactactacagactaacaggactactctggttcataccataactactacagactaacaggactactctggttcataccataactaccataactactatagactaacaggactactctggttcataccataactaccataactactatagactaacaggactactctggttcataccataactactacagactaacaggactactctggttcataccataactactatagactaacaggactactctggttcataccataactactatagactaacaggactactctggttcataccataactactacagactaacaggactactctggttcataccataactactacagactaacaggactactctggttcataccataactactatagactaacaggactactctggttcataccataactactatagactaacaggactactctggttcataccataactactacagactaacaggactactctggttcataccataactactatagactaacaggactaacaggactactctggttcataccataactactatagactaacaggactactctggttcataccatcactactacagactaacaggactactctggttcataccataactactatagactaacaggactaacaggactactctggttcataccataactactacagactaacaggactactctggttcataccataactactacagactaacaggactactctggttcataccataactactacagactaacaggactactctggttcataccataactactgtagactaacaggactactctggttcataccataactactacagactaacaggactactctggttcataccataactactatagactaacaggactactctggttcataccataactactacagactaacaggactactctggttcataccataactactgtagactaacaggactactctggttcataccataactactacagactaacaggactactctggttcataccataactactacagactaacaggactactctggttcataccataactactgtagactaacaggactaacaggactactctggttcataccataactactacagactaacaggactactctggttcataccataactactacagactaacaggactactctggttcataccataactactacagactaacaggactactctggttcataccataactactatagactaacaggactactctggttcataccataactactgtagactaacaggactaacaggactactctggttcataccataactactacagactaacaggactactctggttcataccataactactacagactaacaggactactctggttcataccataactactacagactaacaggactactctggttcataccataactactgtagactaacaggactactctggttcataccataactactacagactaacaggactactctggttcataccataactactatagactaacaggactactctggttcataccataactactacagactaacaggactactctggttcataccataacttctacagactaacaggactactctggttcataccataactactatagactaacaggactactctggttcataccataactactatagactaacaggactactctggttcataccataactactatagactaacaggactactctggttcataccataactactacagactaacaggactactctggttcataccataactactatagactaacaggactaacaggactactctggttcataccataactactatagactaacaggactactctggttcataccataactactacagac

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1295658 True 3609 lncRNA 0.39 2 3183425 3187091

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118938425 NA coding downstream 21110 3161646 ~ 3162575 (-)
LOC110493360 LOC106564102 coding downstream 24587 3133003 ~ 3158838 (-)
LOC110514903 LOC106594799 coding downstream 215638 2941965 ~ 2967787 (-)
LOC110493365 LOC106564074 coding downstream 387123 2789766 ~ 2796302 (-)
LOC110493340 LOC106564070 coding downstream 395896 2782314 ~ 2787529 (-)
LOC110519358 LOC106564100 coding upstream 151937 3337677 ~ 3341727 (-)
LOC118938390 LOC106585183 coding upstream 166075 3353166 ~ 3370727 (-)
LOC118938420 NA coding upstream 195201 3382292 ~ 3385041 (-)
LOC110487344 LOC106594449 coding upstream 200710 3387801 ~ 3406583 (-)
LOC110487174 LOC106594426 coding upstream 226931 3414022 ~ 3420121 (-)
G1137187 NA non-coding downstream 8073 3167704 ~ 3175352 (-)
G1137183 NA non-coding downstream 23361 3159835 ~ 3160064 (-)
G1137177 NA non-coding downstream 34771 3147485 ~ 3148654 (-)
G1137176 NA non-coding downstream 37220 3145555 ~ 3146205 (-)
G1137198 NA non-coding upstream 13352 3200443 ~ 3200674 (-)
G1137376 NA non-coding upstream 38653 3225744 ~ 3226014 (-)
G1137388 NA non-coding upstream 65849 3252940 ~ 3260170 (-)
G1137389 NA non-coding upstream 66484 3253575 ~ 3269026 (-)
G1137394 NA non-coding upstream 71636 3258727 ~ 3282308 (-)
G1137174 NA other downstream 52872 3129613 ~ 3130553 (-)
G1136948 NA other downstream 323384 2859031 ~ 2860041 (-)
G1136568 NA other downstream 661064 2521827 ~ 2522361 (-)
LOC118938509 LOC106564044 other downstream 668507 2507219 ~ 2518648 (-)
G1136455 NA other downstream 938107 2187440 ~ 2245318 (-)
LOC110487308 LOC106595461 other upstream 341348 3521685 ~ 3532141 (-)
G1137666 NA other upstream 544530 3731621 ~ 3733300 (-)
G1137672 LOC106595836 other upstream 578191 3765282 ~ 3765816 (-)
G1138151 LOC106606801 other upstream 1207654 4394745 ~ 4421260 (-)
G1138232 NA other upstream 1432404 4619495 ~ 4620179 (-)

Expression


Co-expression Network