G1138554


Basic Information

Item Value
gene id G1138554
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048577.1
NCBI id CM023231.2
chromosome length 73332040
location 5026006 ~ 5027766 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1297655
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Function

GO: NA

KEGG:

id description

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1297655 False 1625 lncRNA 0.42 2 5026006 5027766
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TU1297659 False 1689 lncRNA 0.42 2 5026006 5027766
TU1297660 False 1653 lncRNA 0.42 2 5026006 5027766
TU1297661 False 1464 lncRNA 0.42 3 5026006 5027766
TU1297662 True 1625 lncRNA 0.42 2 5026006 5027766

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
gcgrb LOC106591591 coding downstream 25215 4943129 ~ 5000791 (-)
LOC110510582 LOC106592158 coding downstream 187998 4814745 ~ 4838008 (-)
LOC110493400 as1la coding downstream 218383 4797759 ~ 4807623 (-)
LOC118936519 LOC106564260 coding downstream 229452 4770679 ~ 4796554 (-)
LOC118938155 LOC106564258 coding downstream 258746 4755078 ~ 4767260 (-)
LOC110513279 LOC105029740 coding upstream 312 5028078 ~ 5055105 (-)
LOC110513280 LOC106564244 coding upstream 30685 5058451 ~ 5061519 (-)
LOC110485437 NA coding upstream 64849 5092615 ~ 5094443 (-)
LOC118938158 LOC106592452 coding upstream 85065 5112831 ~ 5115196 (-)
LOC110485443 LOC106592430 coding upstream 100458 5128224 ~ 5141579 (-)
G1138558 NA non-coding downstream 3076 5022616 ~ 5022930 (-)
G1138595 NA non-coding downstream 5656 5020146 ~ 5020350 (-)
G1138593 NA non-coding downstream 8963 5016821 ~ 5017043 (-)
G1138579 NA non-coding downstream 12619 4983797 ~ 5013387 (-)
G1138591 NA non-coding downstream 15193 5009968 ~ 5010813 (-)
G1138598 NA non-coding upstream 13755 5041521 ~ 5044925 (-)
G1138599 NA non-coding upstream 14165 5041931 ~ 5042499 (-)
G1138607 NA non-coding upstream 36795 5064561 ~ 5065005 (-)
G1138601 NA non-coding upstream 38105 5065871 ~ 5071930 (-)
G1138609 NA non-coding upstream 45685 5073451 ~ 5073730 (-)
G1138232 NA other downstream 406142 4619495 ~ 4620179 (-)
G1138151 LOC106606801 other downstream 604746 4394745 ~ 4421260 (-)
G1137672 LOC106595836 other downstream 1260190 3765282 ~ 3765816 (-)
G1137666 NA other downstream 1292706 3731621 ~ 3733300 (-)
LOC110487308 LOC106595461 other downstream 1493882 3521685 ~ 3532141 (-)
G1138568 NA other upstream 130399 5158165 ~ 5162954 (-)
G1138553 LOC106592646 other upstream 173289 5201055 ~ 5262513 (-)
LOC118936520 NA other upstream 189925 5216411 ~ 5244441 (-)
LOC118938515 LOC106592948 other upstream 643694 5671437 ~ 5678473 (-)
LOC110512654 LOC106592307 other upstream 1017091 6044857 ~ 6058622 (-)

Expression


Co-expression Network