G1189279 (LOC106601786)


Basic Information

Item Value
gene id G1189279
gene name LOC106601786
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048577.1
NCBI id CM023231.2
chromosome length 73332040
location 55912224 ~ 55915885 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1356467
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>TU1356465
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>TU1356466
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>TU1356468
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Function

NR:

description
PREDICTED: extracellular serine/threonine protein kinase FAM20C-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU1356468 False 3366 TUCP 0.43 2 55912247 55915885
TU1356469 True 3444 TUCP 0.43 3 55912247 55915885

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC110485238 LOC106601829 coding downstream 402306 55434816 ~ 55509918 (-)
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pvalb1 pvalb1 coding downstream 587914 55321599 ~ 55324310 (-)
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LOC110515093 LOC106606674 coding upstream 311158 56226179 ~ 56250925 (-)
LOC110486859 srebf1 coding upstream 995480 56911365 ~ 56957646 (-)
G1189238 NA non-coding downstream 85070 55826382 ~ 55827154 (-)
G1189200 NA non-coding downstream 153195 55758169 ~ 55759029 (-)
G1188840 NA non-coding downstream 277628 55634306 ~ 55634596 (-)
G1188834 NA non-coding downstream 287163 55624859 ~ 55625061 (-)
G1188831 NA non-coding downstream 292168 55619657 ~ 55620056 (-)
G1189291 NA non-coding upstream 28770 55944655 ~ 55954153 (-)
G1189292 NA non-coding upstream 67086 55982971 ~ 56063191 (-)
G1189293 NA non-coding upstream 84119 56000004 ~ 56004128 (-)
G1189290 NA non-coding upstream 103183 56019068 ~ 56021552 (-)
LOC110516592 LOC106601772 other downstream 699509 55209614 ~ 55242150 (-)
LOC110486836 LOC106606701 other downstream 885776 55022619 ~ 55026465 (-)
LOC110485228 LOC106606689 other downstream 1080902 54813122 ~ 54831352 (-)
LOC110486825 LOC106606691 other downstream 1163566 54741479 ~ 54748709 (-)
G1189660 LOC106601786 other upstream 754408 56670293 ~ 56674238 (-)
LOC110486894 LOC106601810 other upstream 1164932 57054453 ~ 57085521 (-)
G1190199 LOC106601813 other upstream 1173286 57089171 ~ 57089915 (-)
G1190405 NA other upstream 1580103 57495988 ~ 57499155 (-)

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