G1207876


Basic Information

Item Value
gene id G1207876
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048578.1
NCBI id CM023232.3
chromosome length 43310081
location 5488749 ~ 5496292 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1379475
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>TU1379479
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>TU1379477
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Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC106590914

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1379475 False 415 lncRNA 0.38 2 5488749 5496292
TU1379479 False 332 lncRNA 0.42 2 5488749 5496209
TU1379477 True 7375 lncRNA 0.38 2 5488819 5496292

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110488605 LOC106604911 coding upstream 85958 5398410 ~ 5402791 (+)
LOC110488602 NA coding upstream 256095 5228027 ~ 5232654 (+)
LOC110488601 NA coding upstream 268709 5216371 ~ 5220040 (+)
phykpl LOC100286425 coding upstream 537398 4937303 ~ 4965435 (+)
LOC110488588 NA coding upstream 749504 4730739 ~ 4739245 (+)
LOC110488611 LOC106604836 coding downstream 503808 6000100 ~ 6003751 (+)
LOC110488614 LOC106604892 coding downstream 649517 6145809 ~ 6150743 (+)
LOC110488618 LOC106604841 coding downstream 670939 6167231 ~ 6175289 (+)
LOC110488619 LOC106604842 coding downstream 701732 6198024 ~ 6291026 (+)
LOC100136156 LOC100136156 coding downstream 797909 6294201 ~ 6298860 (+)
G1207787 NA non-coding upstream 36754 5362121 ~ 5451995 (+)
G1207843 NA non-coding upstream 40952 5444029 ~ 5447797 (+)
G1207774 NA non-coding upstream 100705 5381318 ~ 5388044 (+)
G1207739 NA non-coding upstream 192573 5294673 ~ 5296176 (+)
G1207904 NA non-coding downstream 28400 5524692 ~ 5526754 (+)
G1207918 LOC106601388 non-coding downstream 44784 5541076 ~ 5542543 (+)
G1207957 NA non-coding downstream 105207 5601499 ~ 5603511 (+)
G1207986 NA non-coding downstream 153898 5650190 ~ 5650686 (+)
G1208073 NA non-coding downstream 298331 5794623 ~ 5831042 (+)
G1207553 NA other upstream 566189 4922141 ~ 4922560 (+)
LOC110488581 LOC106611927 other upstream 1094709 4327546 ~ 4477610 (+)
G1205631 LOC106611372 other upstream 2313519 3174502 ~ 3175230 (+)
LOC110488551 LOC106604955 other upstream 2336016 2837214 ~ 3160873 (+)
G1202826 NA other upstream 4547575 940502 ~ 941174 (+)
G1208884 NA other downstream 407629 5903921 ~ 5907769 (+)
G1209615 LOC106604863 other downstream 1247642 6743934 ~ 6744790 (+)
G1209622 NA other downstream 1255060 6751352 ~ 6751714 (+)
G1209572 NA other downstream 1256665 6752864 ~ 6756811 (+)
LOC110488661 diaph1 other downstream 1822728 7251365 ~ 7385487 (+)

Expression


Co-expression Network