XLOC_003140


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_003140
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 2308209 ~ 2320355 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00008513
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>TCONS_00008514
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>TCONS_00008380
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Function

GO:

id name namespace
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KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TCONS_00008380 True 512 lncRNA 0.42 3 2308218 2314786

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_003139 NA coding upstream 102411 2198530 ~ 2205798 (+)
XLOC_003138 mir196c coding upstream 117479 2190621 ~ 2190730 (+)
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XLOC_003260 BX324177.2 misc downstream 9097678 11418033 ~ 11418323 (+)
XLOC_003262 BX324177.15 misc downstream 9109038 11429393 ~ 11429689 (+)
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XLOC_003164 NA non-coding downstream 1010758 3331113 ~ 3333714 (+)

Expression


Co-expression Network