LOC110489698 (LOC106590406)



Basic Information


Item Value
gene id LOC110489698
gene name LOC106590406
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048579.1
NCBI id CM023233.2
chromosome length 81569517
location 16129002 ~ 16144964 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


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Function


NR:

description
alanine aminotransferase 2-like isoform X1

GO: NA

KEGG:

id description
K00814 GPT, ALT; alanine transaminase

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_021562468.2 True 2480 mRNA 0.48 12 16129002 16144964

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
LOC110489700 LOC106590414 coding downstream 300 16125368 ~ 16128702 (-)
LOC110490931 cpa6 coding downstream 49407 16038626 ~ 16079595 (-)
LOC110490929 LOC106590401 coding downstream 93719 15938237 ~ 16035283 (-)
LOC110489696 cops5 coding downstream 205197 15918395 ~ 15923805 (-)
LOC110489694 LOC106590412 coding downstream 224660 15900480 ~ 15904342 (-)
LOC110489701 LOC106590404 coding upstream 16390 16161354 ~ 16177141 (-)
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LOC110489704 LOC106590419 coding upstream 173935 16318899 ~ 16324594 (-)
LOC110489705 LOC106590420 coding upstream 183981 16328945 ~ 16439917 (-)
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G1265456 LOC106590371 other upstream 2431575 18576539 ~ 18580163 (-)

Expression



Co-expression Network