LOC110489866 (tmem241)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110489866
gene name tmem241
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048579.1
NCBI id CM023233.2
chromosome length 81569517
location 24869606 ~ 24876724 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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>TU1453789
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>TU1453794
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Function

symbol description
tmem241 Predicted to enable antiporter activity. Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be active in Golgi apparatus.

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_036944132.1 False 1238 mRNA 0.44 13 24869606 24876724
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XM_036944130.1 False 1235 mRNA 0.45 13 24870065 24876724
TU1453789 False 2638 lncRNA 0.41 6 24871852 24876716
TU1453791 False 2730 TUCP 0.41 6 24871852 24876716
TU1453794 True 2370 lncRNA 0.42 7 24871852 24876716
Loading

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110489863 sdcbp coding upstream 28643 24836607 ~ 24840963 (+)
LOC110489862 fam110b coding upstream 39671 24826608 ~ 24829935 (+)
chchd7 chch7 coding upstream 106643 24759852 ~ 24762965 (+)
LOC110489855 arhgap21 coding upstream 138113 24625469 ~ 24731493 (+)
prtfdc1a LOC106590221 coding upstream 251416 24604502 ~ 24618190 (+)
rbis cssa29h8orf59 coding downstream 91580 24968304 ~ 24976522 (+)
zgc:111976 LOC106590202 coding downstream 776014 25652738 ~ 25662668 (+)
LOC110489875 LOC106590201 coding downstream 788999 25665723 ~ 25703391 (+)
LOC118938912 NA coding downstream 929950 25806674 ~ 25820021 (+)
LOC118938913 NA coding downstream 975096 25851820 ~ 25853297 (+)
G1272656 NA non-coding upstream 3039 24866261 ~ 24866567 (+)
G1272642 NA non-coding upstream 33436 24835668 ~ 24836170 (+)
G1272573 NA non-coding upstream 81710 24741879 ~ 24787896 (+)
G1272502 NA non-coding upstream 278424 24590898 ~ 24591182 (+)
G1272317 NA non-coding upstream 321635 24547742 ~ 24547971 (+)
G1272686 NA non-coding downstream 23994 24900718 ~ 24901029 (+)
G1272688 NA non-coding downstream 25984 24902708 ~ 24902992 (+)
G1272694 NA non-coding downstream 34125 24910849 ~ 24911088 (+)
G1272698 NA non-coding downstream 40305 24917029 ~ 24917297 (+)
G1272701 NA non-coding downstream 42458 24919182 ~ 24919401 (+)
G1272220 LOC106590226 other upstream 465945 24388412 ~ 24403661 (+)
G1271852 LOC106584099 other upstream 619323 24246423 ~ 24250283 (+)
LOC110489839 LOC106590236 other upstream 1174425 23666471 ~ 23836438 (+)
G1272672 LOC106590208 other downstream 83208 24959932 ~ 25027501 (+)
G1274765 NA other downstream 1487554 26364278 ~ 26365146 (+)
G1274830 NA other downstream 1563287 26440011 ~ 26442387 (+)
kif9 kif9 other downstream 2084067 26960749 ~ 26974049 (+)

Expression

LOC110489866(tmem241) Expression in all Baseline Samples

Bar chart with 20 bars.
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying values. Range: 0 to 25.
End of interactive chart.

LOC110489866(tmem241) Expression in each Bioproject

Bar chart with 21 bars.
LOC110489866(tmem241) Expression in each Sample
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying Expression. Range: 0 to 300.
End of interactive chart.

Co-expression Network