arl8 (LOC106590131)


Basic Information

Item Value
gene id arl8
gene name LOC106590131
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048579.1
NCBI id CM023233.2
chromosome length 81569517
location 28983479 ~ 28996322 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021562987.2
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>XM_021562988.2
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Function

NR:

description
PREDICTED: ADP-ribosylation factor-like protein 5B isoform X2

GO:

id name namespace
GO:0007264 small GTPase mediated signal transduction biological_process
GO:0005622 intracellular anatomical structure cellular_component
GO:0005525 GTP binding molecular_function

KEGG:

id description
K07950 ARL5B; ADP-ribosylation factor-like protein 5B

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021562987.2 False 4764 mRNA 0.42 6 28983479 28996322
XM_021562988.2 True 4668 mRNA 0.42 7 28983479 28996322

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
cacnb2a cacb2 coding upstream 20118 28851161 ~ 28963361 (+)
LOC110489950 LOC106590132 coding upstream 146183 28826580 ~ 28837296 (+)
LOC110489949 mrc1 coding upstream 171417 28795080 ~ 28812062 (+)
LOC110489948 mrc1 coding upstream 206390 28756788 ~ 28777089 (+)
LOC110490831 LOC106590071 coding upstream 242003 28731076 ~ 28741476 (+)
malrd1 malrd1 coding downstream 74032 29070354 ~ 29181202 (+)
plxdc2 LOC106578707 coding downstream 210938 29207260 ~ 29383520 (+)
zfand1 zfand1 coding downstream 408974 29405296 ~ 29415105 (+)
prlh2 crfa coding downstream 426072 29422394 ~ 29426818 (+)
si:dkey-12l12.1 LOC106590121 coding downstream 608333 29604542 ~ 29632819 (+)
G1277212 NA non-coding upstream 17335 28923566 ~ 28966144 (+)
G1277284 NA non-coding upstream 160878 28822367 ~ 28822601 (+)
G1277283 NA non-coding upstream 161218 28821923 ~ 28822261 (+)
G1277281 NA non-coding upstream 164467 28818717 ~ 28819012 (+)
G1277277 NA non-coding upstream 170096 28813183 ~ 28813383 (+)
G1277396 NA non-coding downstream 18981 29015303 ~ 29015534 (+)
G1277397 NA non-coding downstream 19415 29015737 ~ 29015958 (+)
G1277400 NA non-coding downstream 21920 29018242 ~ 29018608 (+)
G1277408 NA non-coding downstream 30754 29027076 ~ 29027307 (+)
G1277726 NA non-coding downstream 43704 29040026 ~ 29040277 (+)
G1277279 NA other upstream 167669 28815366 ~ 28815810 (+)
G1277159 NA other upstream 359261 28574316 ~ 28624218 (+)
G1276733 NA other upstream 727073 28190186 ~ 28256406 (+)
G1276288 NA other upstream 1129466 27853618 ~ 27854013 (+)
G1275572 NA other upstream 1881452 27101309 ~ 27102027 (+)
G1279349 NA other downstream 1306711 30303033 ~ 30303419 (+)
htr5ab htr5a other downstream 1399545 30395817 ~ 30416375 (+)
G1279833 NA other downstream 1947849 30944171 ~ 30947330 (+)
G1281462 NA other downstream 2999845 31996167 ~ 31996513 (+)
G1282302 NA other downstream 3691236 32687558 ~ 32698036 (+)

Expression


Co-expression Network