LOC110499870


Basic Information

Item Value
gene id LOC110499870
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048579.1
NCBI id CM023233.2
chromosome length 81569517
location 64544135 ~ 64552715 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036944955.1
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>XM_021576930.2
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ACAGCACCAGAGCTTTAGAATGGTGATACACTTGGTATTCAGTCTAGCACAGCACCAGAGCTTTAGAATAGTGATACACTTGGTATTCAGTCTAGCA

Function

NR:

description
pyrin-like

GO:

id name namespace
GO:0008270 zinc ion binding molecular_function

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036944955.1 False 3544 mRNA 0.43 2 64544135 64552715
XM_021576930.2 True 5097 mRNA 0.42 2 64547353 64552715

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118938929 LOC106576509 coding upstream 133772 64408913 ~ 64410363 (+)
pax4 LOC106576509 coding upstream 136071 64406007 ~ 64408064 (+)
LOC110490817 LOC106576481 coding upstream 316304 64222084 ~ 64227831 (+)
LOC110490585 LOC106609575 coding upstream 1136451 63383215 ~ 63407684 (+)
LOC110490586 LOC106609575 coding upstream 1158387 63383366 ~ 63385748 (+)
LOC110510792 wnt5b coding downstream 150066 64702781 ~ 64824029 (+)
LOC110517608 LOC101268929 coding downstream 286436 64839151 ~ 64929593 (+)
LOC110514055 LOC106575063 coding downstream 539881 65092596 ~ 65150082 (+)
LOC110518394 LOC107732972 coding downstream 751986 65291802 ~ 65866042 (+)
LOC110518243 NA coding downstream 1315598 65868313 ~ 65875835 (+)
G1317738 NA non-coding upstream 34273 64509550 ~ 64509862 (+)
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G1317733 NA non-coding upstream 40207 64501197 ~ 64503928 (+)
G1317730 NA non-coding upstream 53740 64489832 ~ 64490395 (+)
G1317795 NA non-coding downstream 85215 64637930 ~ 64692794 (+)
G1317799 NA non-coding downstream 106871 64659586 ~ 64716169 (+)
G1317811 NA non-coding downstream 146474 64699189 ~ 64700981 (+)
G1317848 NA non-coding downstream 236398 64789113 ~ 64789716 (+)
G1317854 NA non-coding downstream 246577 64799292 ~ 64800016 (+)
G1317686 LOC106576509 other upstream 134101 64407009 ~ 64410034 (+)
G1317674 LOC106613263 other upstream 154038 64389606 ~ 64390097 (+)
G1317320 NA other upstream 729766 63813840 ~ 63814369 (+)
G1316007 LOC100301653 other upstream 1611613 62921704 ~ 62932522 (+)
G1317968 NA other downstream 607261 65159976 ~ 65179127 (+)
G1318650 NA other downstream 886703 65439418 ~ 65440249 (+)
G1318642 NA other downstream 923261 65475976 ~ 65486232 (+)
G1318681 NA other downstream 964987 65517702 ~ 65519728 (+)

Expression


Co-expression Network