XLOC_031642 (abhd10a)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_031642
gene name abhd10a
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007116.7
NCBI id CM002889.2
chromosome length 72500376
location 67884087 ~ 67895855 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00061284
GGCTAATCAAACACCATGGAGGTTTCACTAGCATTGTAACATAAAGCTCATGCGTTGATGTAATTTGTCGTTTTTTAGTTAGAAATTTAAGCTTAAACTCTGAATAGAGAGAAAATAGTAACAAAAAGAGGAAAATACAATAACCTGCAGTAATATTAGGAATAACCTGCAATGGATATGGCTGACACACCAGAGGAGAAATCGTTTGTTTTGGATCTCTTATCTAAACGACATCAGCTACAACTGTCagGTGTTCGGCACAAGACCACAATTCAGTATGCAACACGAGCCGATCTGCCAAAGCTGGCCTACAGAAAGCTGAAAGGGAAGAGTCCTGGTGTGGTTTTCTTGCCCGGTTTCGCCTCACACATGGGTGGACAGAAAGCAGAAGCATTAGAGGAGTTCTGCAAGTCTTTAGGGCACTCGTGCCTGAGGTTTGACTATTCTGGCTGTGGATCATCTGAGGGCGAATTGACGAACTACACTATTGGAGCCTGGAAGAAGGATGTGCTCTATGTGCTGGATGAGCTAGTAGAAGGCCCACAGATTCTGGTGGGCTCCAGCATGGGTGGGTGGTTGATGCTGCTGGCTGCTCTTGCACGTcctgagaaaacagctgctttagtgGGCATCTCAACAGCTGCGGATCACTTCGTCACAGCCTTCAACGCACTACCTATAGAGACAAAGAAGGAGATAGAGGAACAGGGCTTCTGGAAGTTCCCCACTAAGCACAATGAAGAAGGTTTCTACACCCTGAGCCTGGACTTTCTGAAGGAGGCGGAAAACCATTGCATCCTCCACAGCCCTATCCCCGTCTCCTGTCCTGTACGGCTGGTTCACGGCCTCAAAGACTCAGATGTGCCCTGGCATGTGTCCATGCAGGTGGCAGAACGGGTACTCAGCAATGATGTGGATGTCGTTCTGCGCAAACATGGCCAGCATCGCATGTCTGAGAAAGAAGACATCAAGCTCATGGTGTACACTATTGATGACCTTATCGATAAATTGACTACACTGGGCTGAGAGCGGTATAACAGACACACCGTGATTAAGAGAGAACAGCATATACAGGTATCGGGTTTCTGGGAAATATGGTTTGGAGGTAGGTGGTGAAGTGAAAGAAGCCAAATCAGTTGACAGGGAAATCAACCAAAAGTGAAACCTTTTTTATTTCATCCTAGAGccatattattatttgttgttttgttatggaACACTAGTTCAGTGACCAGATGCTGACATTTTCCAGAAGTTTATTTGACTTGTCAACTATTCCTTACATAGTCTTTTCAAGCCATATGAAAACTTTgtatactgtaaaaagtgattagttgactaatttaaaaaagtgagcaaactgttgcttttaaagtgattagttgacttaagtgagtaaactgcttgcttttaatttaaaagctacaggtttactcacttaagtcaactaatcactttaaaagcaaagggtttactcactttagtaAAGTtgactaattgctttaaaagcagcaggttttaCTTTACTAAAGTGAGTACTTtacttttagttgactttacccaagtgagtaaacctgttgcttttaaagtgattagtttacttaaCTTAAAACGTGAGCtagcctgttgcttttaaagcgattagttgactttacttaagtgagtaaacctgttgcttttaaagtgattagttgactttacttaagtgagtaaacctgttgctttaaaagtgattagttgacttaacttaagtgagtaaacctgttgcttttaaagcgattagttgactttacttaagtgagtaaacctgttgcttttaaagcgattagttgactttacttaagtgagaaaacctgttgcttttaaagcgattagttgactttacttaagtgagtaaacctgttgcttttaaagcgattagttgactttacttaagtgagtaaacctgttgctttaaaagtgattagttgactttacttaagtgagtaaacctgttgctttaaaagtgattagttgactttacttaagtgagtaaacctgttgctttaaaagtgattagttgactttacttaagtgagtaaacctgttgcttttaaagcgattggttgacttgacttaaaataagtgagtaaacctgttgcttttaaagcgattagttgacttaagtgagtaaacctgttgcttttaaagcgatttgttgactttacctaagtaagtaaacctgttgcttttaaagcgatttgttgactttacctaagtgagtaaacctgttgcttttaaagcgattagttgacttaagggagtaaacctgttgcttttaaagcgattagttgactttacttaagtgagtaaacctgttgcttttaaagcaattagttgacttaacttaaaacaTGAGTtagcctgttgcttttaaagcgattagatTACTTAACCTAAAACGTGAGTtagcctgttgcttttaaagcgattagatTACTTAACCTAAAACGTGAGTTAgcctgttgtttttaaagtgattagttgacttaacttaaaacgTGAGTTAgcctgttgtttttaaagtgattagttgactagtTGTTTTCAAGGCAGCAGGTTTCCTCGCTATTTTTAACTAAAGTAACTTATCGCTTTTTACACTGTATAAGGGACAGGCCAAAATTGTAATCGCTGTTCCCTAAAATCCTTCTCTGTCACCAAGCAGCCAACACTTCATAACCTGATGCAATGTGCCAAGTCAGAACATGCACAAGCACTGAGGAGCTTTGACGGGCCAAGAACTGACGATTATAAATACACTTCAGGAGCACTTTACTATAAGGTCTCAATTGCTAATGCtaattaatgcattagttaattaaaaaaaatacaacagatACAACTTTCAGTCTTACAAATCTATCAGTAAAAGTGCAgattaaagggccagttcaccctaaaatgaaactTTACAGTTAATTTACTGACATAGATGATCGATTCTGTTTCATAAGTGTATAGCCAAAGGGATTGATTTCTACTTGcttgtatatgtttatttttcattttaaaaaccgGGCAACTATAGACTTAATAAGAATCACCACAGATTCATCTAAAAACCTTCTTTAATGTTCCAGTGAGCCAAATACTATCCGTCTAACTTAATTGCGGTAGATGTATTGGTCATGTTAACTAATGCTAGCAAACGggaccttattgtgaagtgttgctctaaaatttcaaaataaaagttataaacCTTTGTTATGCATCCAAACTATGCATGTCTTGCATTGATTCTTAGCACTGGCTCCTATTATGCAATGATCATTCTTAATATTCAATTACATGTAGGGCCTTATTTTGTCCCCAAAGTTTTGTACTTAGTCTTATTTTCCATTGATTGAGGGTTTGACTGTGTTAAACAGTAGTTTTTTAGTGTCTCTATATTATTTAATCCCTTCCAGGAGAAACTTACCTCTGATTTTATTTATCACTGATTTCTAGTCTTTTTAACGATGGTAGGAGTTTAAAAAGTATGTATATTCCCTAATATGTGGATTACTCTTCACATTTGAGCTCTCCATGTTGGgcagattttatatttattatttcgtTAATTGTCCCCTggtgtgttttctttttgttttagcaCCTGGTTTCTCCTCTTGACACATagataaatactatatatatattttttgatctcTGTTTGAGTGTTTTTATACCACCAACTGtgcttttatatttgtttgttgtcAGTATCCACCCACTGACGGTGATTTATGTCGTGACAAAAGTTGTCTTCCGCATAATTTGTAAGTTATTCCCACAGGGTGATTACAGCATGCATTGTTACACTTTTATTCTCTTGTCAGcggtatgtatgtttatatattatttatatcatttatcaTGCACATGTTGCTGTGCACCACATTTATGTTAGTTCATAATagacatttaaatatgtaaaaaatatataaacgtatGGTCTGTTTGTCAGATATGTATAAATCTATGTAATAAAGaactttttgtttattaaagtggaCAGTAGG
>TCONS_00061285
ACTGGAGGCTTGTGTGTCAACGTTAGCGTCTCCGCAGACAGCGGGACAGTATGGCATCAGTGGTGTTCAGACATTGCTCAAATGTTCTTAAAATAAGCCTCCGGAAATCCACAGCTCTCCCGCACATTTTAACGGGTGTTCGGCACAAGACCACAATTCAGTATGCAACACGAGCCGATCTGCCAAAGCTGGCCTACAGAAAGCTGAAAGGGAAGAGTCCTGGTGTGGTTTTCTTGCCCGGTTTCGCCTCACACATGGGTGGACAGAAAGCAGAAGCATTAGAGGAGTTCTGCAAGTCTTTAGGGCACTCGTGCCTGAGGTTTGACTATTCTGGCTGTGGATCATCTGAGGGCGAATTGACGAACTACACTATTGGAGCCTGGAAGAAGGATGTGCTCTATGTGCTGGATGAGCTAGTAGAAGGCCCACAGATTCTGGTGGGCTCCAGCATGGGTGGGTGGTTGATGCTGCTGGCTGCTCTTGCACGTcctgagaaaacagctgctttagtgGGCATCTCAACAGCTGCGGATCACTTCGTCACAGCCTTCAACGCACTACCTATAGAGGTACGAAAGCCTTCAAAGTCAGATCAAATGATTAAAGCAAGTCCGTTTGTTGGGGTTTTAATACAAACTGTGTATATTGTAAGTATAACAAATTACTCTTACTGTCGCTCATACTTTTACACTtgtggaatttacatgagaactAGAAAACAATGTTTGAGGCTCATGACA
>TCONS_00061286
GGGACAGTATGGCATCAGTGGTGTTCAGACATTGCTCAAATGTTCTTAAAATAAGCCTCCGGAAATCCACAGCTCTCCCGCACATTTTAACGGGTGTTCGGCACAAGACCACAATTCAGTATGCAACACGAGCCGATCTGCCAAAGCTGGCCTACAGAAAGCTGAAAGGGAAGAGTCCTGGTGTGGTTTTCTTGCCCGGTTTCGCCTCACACATGGGTGGACAGAAAGCAGAAGCATTAGAGGAGTTCTGCAAGTCTTTAGGGCACTCGTGCCTGAGGTAATCACTAGAGGCGCTAAAAGCCTTGTAGTTCTTTTAACTTTGTGCACAAAGTCTTTTTCCAGTACTTTCAGTCTCTCTGTTCCTATATGGTGAAATGATCTGCCAACCTCCAGCTGAACTGCTGAGACCACCACATCTTTTACAAAGCAAATCCAAGAAGAAGCGCCACTTCCACAAGCATTTAatgggattgttcacccaaaaattacaattttcctcatcatttgtttttcctcatgtggtttctttcttctgttaaacacaaaagaagatttttggaAACATGCTGCTTGCTggcatccattgacttccatcgttTGGAAAAAAGTTTATGTGATAGTCAGTAGCTATGAtttcatccaaagatgcaaattagattTGAATACTAGCATatctgtttttattaaattaattgtaaGATGTTTCCGGCCTTACCCGCATTCATCTTGTCTCAGGCATTAGGTTCCATGGGTCTctagcaatgactgtaaaaaatatggacgacgcgacagcc

Function

symbol description
abhd10a Predicted to enable hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds and palmitoyl-(protein) hydrolase activity. Predicted to be involved in protein depalmitoylation. Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be active in mitochondrion. Orthologous to human ABHD10 (abhydrolase domain containing 10, depalmitoylase).

GO:

id name namespace
GO:0016020 membrane cellular_component
GO:0016021 integral component of membrane cellular_component

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-060526-144 Predicted to enable hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds and palmitoyl-(protein) hydrolase activity. Predicted to be involved in protein depalmitoylation. Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be active in mitochondrion. Orthologous to human ABHD10 (abhydrolase domain containing 10, depalmitoylase).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000076435

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00061284 False 4046 mRNA 0.37 5 67884087 67895656
TCONS_00061285 False 740 processed_transcript 0.47 4 67888846 67895855
TCONS_00061286 True 794 lncRNA 0.42 2 67892185 67895813

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_031641 tagln3a coding downstream 6023 67869785 ~ 67878064 (-)
XLOC_031640 eif4e1b coding downstream 84266 67785991 ~ 67799821 (-)
XLOC_031639 casr coding downstream 100494 67768162 ~ 67783593 (-)
XLOC_031638 b4galt4 coding downstream 121653 67736822 ~ 67762434 (-)
XLOC_031637 arhgap31 coding downstream 162719 67671207 ~ 67721368 (-)
XLOC_031643 gsx1 coding upstream 13789 67909644 ~ 67911111 (-)
XLOC_031644 NA coding upstream 68652 67964507 ~ 67972342 (-)
XLOC_031645 gtf3aa coding upstream 84332 67980187 ~ 67993086 (-)
XLOC_031646 wasf3a coding upstream 111317 68007172 ~ 68022631 (-)
XLOC_031647 rnf167 coding upstream 141774 68037629 ~ 68058168 (-)
XLOC_031627 BX897741.1 non-coding downstream 719668 67161442 ~ 67164419 (-)
XLOC_031620 CU929288.1 non-coding downstream 1346753 66537217 ~ 66537334 (-)
XLOC_031616 NA non-coding downstream 1639955 66239915 ~ 66244132 (-)
XLOC_031612 NA non-coding downstream 1859143 66022664 ~ 66024944 (-)
XLOC_031608 NA non-coding downstream 2209452 65670605 ~ 65674635 (-)
XLOC_031650 CABZ01083943.1 non-coding upstream 310097 68205952 ~ 68214334 (-)
XLOC_031655 LO017735.1 non-coding upstream 722103 68617958 ~ 68618089 (-)
XLOC_031656 NA non-coding upstream 726243 68622098 ~ 68668542 (-)
XLOC_031659 NA non-coding upstream 918068 68813923 ~ 68816110 (-)

Expression


Co-expression Network