LOC118938864 (LOC106576660)


Basic Information

Item Value
gene id LOC118938864
gene name LOC106576660
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048579.1
NCBI id CM023233.2
chromosome length 81569517
location 78148973 ~ 78157083 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036945435.1
TTCCCGGAAGTATCGCGATattgcgcctctgggtttagaaactctgtgctaAAAGCATATATCACTACCAAACCAGGGAagaaaaagaagagaggagagaaaggaaagcGAACGCGCAAATACATGCATACAATGATAGCAGAAATTGGTGCCGCCGACAATCCCAAGGCCAGCTCCAGCTATCCCCATCCCCAAGCAGCTGTGATCTGCCCGGACTCACCGGTTTCATTCGCCCCGGACTACGGAGTCGGACAGCTGTTCATACGTAGCGCCTCGTCCAGGAGGGACACACAGACGTCCGCGGGGAGTATCAACCCAGACGAGAGCTCCATCAAGCCGCTGGTATCCGGAGTATCCTCCGCTATTACAGACGCCTATATCATGACCTCTGAGGAATTCATGCAGACCGCTCCCTTGTTCGGCCAGAGGTCCAAGAGGAACGTTCTCTACAAGATCCTGTGTTTCCTCATTCTGATATTCCAAGGAGGCATTCTAGATTTCTACCTCATTATCTTCACGGATCTGTACTGGTGTTCGTGGATCGCCACGGATCTGGTGGTGATCTCTGGCTGGGGGATCTTCTTCATGAAGAACGCCAGGAGCAAGAGAGAGCGGGCGTGTGGGTTCCACCAAAAGAACTCTATATTCGGCTGTAACCTCGGCGAGTTTACCTACGCCTACCTGGCCTGGTTAATCTACGTGATCGCCTGCACCCCTAAAATAGTCCTCATTCTAGAGACTTCGATATTAGATCTCATCGCGCTCAAAGTTCCGTTCGGTGTAACCGGATTTAAGATTATCACGTTGCTCTCGGTCCCGTTACTCTACTGTCTCGTCAATTCTATCACCGAGGACCAGAACGGAGCTACGCGCCACCGGTCCCAAAGCTGCTTCATAACCACCTGTCTGGACCTCGCAGACTGTTTTACCCTGGTGGAGTTGTTTCTGAAGAACGAGATACCGACGGTCTATTTAAAATACACGGTCATCTCGGTGTATTTCATCGCCCTGGGCGTCCCAGTGGTGTGGTTATACGAGTTGACAGCCTCCGAGATGCGCTGTCGCTGGGTCTGGGCTAGGTTCCTGGTCGGTGTGTTGGTCAACGCCCCACTTCTGGTGGTGCGGTGTTTCCAGGTGTATGTTCACGAGATGCCCGTCTCAGTGTTCATGTTCAAGAATATGTTCTTCCTGGCCTGTAAGTGTCTGGAGCTGATAGAACAGTGTTTCACAGTGCGGGGTGTCAGGAGGTTCGGTGAGGGAAGCAACCCGGCGCAGTTCTCTCACTGTGTCTCAGAGAACGATATGTGTCCCCATGGATATGTCAACACCCTGGCGGTTACCACGCAGTCATAGGCCCGGCTTGGATCTCACCCTGGCCGTCACTACCTAGACCTAAAACGGCCTGGATTTTATTTTATCCCCCTGGAGGGTGGAAGGCACATGAGTGATGCTGAAGGAAGAATTTTGAGGGACAGGGTTACGCCCTTAAacggcaccctatgccctatatagtgcacctacttttgaccagggctaatAGGGTTCTGATCAAagggagtgcactatatagggaatagggtgccaatgaGGATGCATCAACGACAGCCTTATTGACGATTTTGTAATTTATTCAGATGTGAACATTTGATAACAACAGGTGCTACAGAATCATTATGCATCAACTACACCTGCTTAAGATCTGGTCAACCTGGCAGACCTGGCAGACCTGGCCAACCTGGCAGACCTGGCAGACCTGGCCACTGGCCAACGATTGTCGTTTTGAAATGGGAGTCTTGGATATGGTGTCAATGTCGATGTAAAGTCATGTTTTACGTTGGTAGAGTCTTGTCTCTCAATCTGTGAAACTTCCAAATAGCATTTCCTAATCAATGAATAGATGGAAACCTTGTGGTAATATAGATACCTGATTAGTGTGTAATTGCGGTATACGTAATGATTCTAATGTGTAATCATGTCCTCTCATATCCTAAACTATTTTTGGGGGAATATTTCATGTTATCAATATAAATCAATTGATATTTCTTAAAGAATTTGACATCACTATGTGTATTTTACTGTATGCTTTGAAGTAGCACGACAATGTGTCATGATGATATGAGATAGAGCAGGCAGCTATAGAGCAACCTCTTTATtatactgtgtctctgtctgtctgtctgtctgttaacatGTGTACTGACAGTCTGTCTATCTGTCAACATGTGTACTGacagtctgtctgtttgtctatcTGTCAAAATGTGTACTGACAGTCTTGACTGATGGAATTTATACAGGGTCAGCCTTGCCAATTTGTCACCCAGAAATGAACGGAGCTTCAAAAAAGTGAATATAAATGTGATATCGTTTAGATCAAACATGATGAGACAATCTACTCCAAGGTGCTATGAAGGAATGTGCAGCTGTGGAATCAGATGTGAGTGGCGTTGATATGCGTAATCAGATGGGTGTGGCGTTGATATGCGGAATCAGATGTGTGTGGCGTTGATATGCGTAATCAGATGTGAGTGGCGTTGATATGCGTAATCAGATGGGTGTGGCGTTGATATGCGGAATCAGATGTGTGTGGCGTTGATATGCGTAATCAGATGGGTGTGGCGTTGATATGCGTAATCAGATGGGTGTGGCGTTGATATGCGTAATCAGATGGGTGTGGCGTTGATATGCGTAATCAGATGGGTGTGGCGTTGATATGCGTAATCAGATGGGTGTGGCGTTGATATGCGTAATCAGATGGGTGTGGCGTTGATATGCGTAATCAGATGGGTGTGGCGTTGATATGCGTAATCAGATGGGTTTGGCGTTGATATGCGAGGTGTTTGACATCCTATTGCCGGAACTCTggataaaaatttaaaaaacactgCTATTATTACCTAACAGAAGACCCTTATGTGGATGAGAGAAATATAGGTCACTGTGCAACCAATAGAACAGGGTTGAGAGAATGCAGGAATTACAGACAGATCGGAGAATAAATCACGATCGTAAACACTTGTCATCTCAAAATGTAGGTCTCTGTTTCTCCTCATGGATCTTCTCATACagtgaaaaacaccaaaatgatGTTTGATAAAAAAAGTACCCAAATACATATTGGTAATGACCGCAGTCTGCAGAGAAGACACTATTGTACAGTACGTAACATCAGCCGCCATCTCGCATTTACTGTGTTACAAAAAGGAGTCCCTTTAGTTTCCAGTACCTAAGCCTCTAGTCATTAAAAAAAGATCTTGGATGTGATATAATTCATTCAACCTAATGGTGATCTGTGACATTTCCTGTTCCTGTTTGTCCTTCACTTTCTTTTTTCctgatggggggaaaaaaaaaaagagtgagCTGAATATAGCCTGAGTTCCGGTCTGTATGTGCCATCACGCCAGCTCCTTGTTACTCAGCCTCAGTGCACGCCAAACTGTTTGTGTTGTATGGAGTATGGCTAGAACACCaactgatctgagaccaggctatgaGTGTTGTATGGAGTATGGCTAGAACACCaactgatctgagaccaggctatgaGTGTTGTATGGAGTATGGCTAGAACACCaactgatctgagaccaggctatgaGTGTTGTATGGAGTATGGCTAGAACACCaactgatctgagaccaggctatgaGTGTTGTATGGAGTATGGCTAGAACACCaactgatctgagaccaggctatgaGTGTTGTATGGAGTATGGCTAGAACACCaactgatctgagaccaggctatgaGTGTTGTATGGAGTATGGCTAGAACACCaactgatctgagaccaggctatgaTGAAGATGCAGGTAGGTGATGAATAGGAATGAAAAAAACACTTAAGAAAAAAAAATGGTGCCTTTTTGAGTGCAGTGTGAAGTGAACAGGATTGTTGATGGGTTCCTTCATGAAGTGTTGTGGAATAAAAGGACATTATATTTTAGCATataaagtcaaattaggatattTATATTGAGGGATTTAAAATGAGGAGTCCTTCTACCTAGCCTTATGTTGGCTGATGGGACTGAGGTGTCCTTCCACCTAGCCTTATGTTGGCTGATGGGACTGAGGTGTCCTTCCACCTAGCCTTATGTTGGCTGATGGGACTGAGGTGTCCTTCTACCTAGCCTTCTGTTGGCTGATGGGACTGAGGTGTCCTTCTACCTAGCCTTATGTTGGCTGATTGAACTGAGGTGTCCTTCTACCTAGCCTTATGTTGGCTGATTGAACTGAGGTGTCCTTCTACCTAGCCTTATGTTGGCTGATTGGACTGAGGTGTCCTTCTATCTAGCCTTATGTTGGCTGATGGGACTGAGGTGTCCTTCTATCTAGCCTTATGTTGGCTGATGGGACTGAGGTGTCCTTCTACCTAGCCTTATGTTGGCTGATTGGACTGAGGTGTCCTTCTATCTAGCCTTATGTTGGCTGATGGGACTGAGGTGTCCTTCCACCTAGCCTTATGTTGGCTGATGGGACTGAGGTGTCCTTCTACCTAGCCTTATGTTGGCTGATTGAACTGAGGTGTCCTTCTACCTAGCCTTATGTTGGCTGATGGGACTGAGGTGTCCTTCTACCTAGCCTTATGTTGGCTGATTTGAACTGAGGTGTCCTTCTATCTAGCCTTATGTTGGCTGATGGGACTGAGGTGTCCTTCTACCTAGCCTTATGTTGGCTGATTTGAACTGAGGTGTCCTTCTACCTAGCCTTATGTTGGCTGATGGGACTGAGGTGTCCTTCTACCTAGCCTTATGTTGGCTGATGGGACTGAGGTGTCCTTCTACCTAGCCTTGTGTTGGTTGATTGAAATGAGGTGTCCTTCTACCTAGCCTTATGTTGGCTGATTGAACTGAGGTGTCCTTCTACCTAGCCTTATGTTGGCTGATTGGACTGAGGTGTCCTTCCACCTAGCCTTATGTTGGCTGATTGAACTGAGGTGTCCTTCTACCTAGCCTTATGTTGGCTGATGGGACTGAGGTGTCCTTCCACCTAGCCTTATGTTGGCTGATGGGACTGAGGTGTCCTTCTACCTAGCCTTATGTTGGCTGATGGGACTGAGGTGTCCTTCTACCTAGTCTTATGTTGGCTGATGGGACTGAGGTGTCCTTCTACCTAGCCTTATGTTGGCTGATTGAACTGAGGTGTCCTTCTACCTAGCCTTATGTTGGCTGATTGAACTGAGGTGTCCTTCTACCTAGCCTTATGTTGGCTGATTGAACTGAGGTGTCCTTCTACCTAGCCTTATGTTGGCTGATTGGACTGAGGTGTCCTTCCACCTAGCCTTATGTTGGCTGATTGAACTGAGGTGTCCTTCTACCTAGCCTTATGTTGGCTGATGGGACTGAGGTGTCCTTCCACCTAGCCTTATGTTGGCTGATGGGACTGAGGTGTCCTTCTACCTAGCCTTATGTTGGCTGATTGAACTGAGGTGTCCTTCTACCTAGCCTTATGTTGGCTGATTGAACTGAGGTGTCCTTCTACCTAGCCTTATGTTGGCTGATTGAACTGAGGTGTCCTTCTACCTAGCCTTATGTTGGCTGATTGGACTGAGGTGTCCTTCCACCTAGCCTTATGTTGGCTGATTGAACTGAGGTGTCCTTCTACCTAGCCTTATGTTGGCTGATGGGACTGAGGTGTCCTTCCACCTAGCCTTATGTTGGCTGATGGGACTGAGGTGTCCTTCTACCTAGCCTTATGTTGGCTGATGGGACTGAGGTGTCCTTCTACCTAGCCTTATGTTGGCTGATGGGACTGAGGTGTCCTTCTACCTAGCCTTATGTTGGCTGATTGAACTGAGGTGTCCTTCTACCTAGCCTTATGTTGGCTGATTGAACTGAGGTGTCCTTCTACCTAGCCTTATGTTGGCTGATTGAACTGAGGTGTCCTTCTACCTAGCCTTATGTTGGCTGATTTGACCTCAAATAAAACTGGAATGGCCCTTTCTTGCTTCTGTTTGTTCCTAATCAATCAAGCCAACGTATTTACAGTGTTTTTATACTTTTCACATATTATTTACGTGCCGATGACACTGCTGCATATTGAGATATTGAAAAGGTTACAATTTGTGACTTGGGGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCTGGCCCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCTGGCCCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCTGGGCCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATACCCTGGCCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATACCCTGGCCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCTGGGCCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCTGGGCCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCTGGGCCCCTGGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCTGGGCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCTGGGCCCCTGGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATACCCTGGGCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATACCCTGGGCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCTGGGCCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCGGGCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCTGGGCCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCTGGGCCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCTGGCACCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCTGGGCCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCTGGGCCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCTGGGCCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCGGGCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCTGGGCCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCTGGGCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCTGGGCCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCTGGGCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCTGGGCCCCTGGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATACCCTGGGCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATACCCTGGGCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCGGGCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCTGGGCCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCTGGGCCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCTGGGCCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCTGGGCCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCTGGGCCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCTGGGCCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCGGGCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCTGGGCCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCTGGGCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCTGGGCCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCTGGCCCCCAGATCGGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCTGGGCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCTGGGCCCCCAGATCTGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCTGGGCCCCCAGATCGGTTTAGAGATGATACAAGATAGCCTGGGCCCCcaggatctgtttgtgctctcaCCAACTCCATTTCTCATTGTCATGAGTTGTCATAACAACACAAtcagacaggtacccaggctagaTAAAAGACAGGTTGTAACAATGTATGtactgacaacaacaaaaatatatattttgtgtcCAGCAATAGGCCAATAGAAGAAGCACTGAACCACCAAGGGCTTTCTTTCTTGGATCTAGAATACTTGTTAAAAGAGACCAAGACTAACTCTGACTGACtccattttgatttgttaaaatgggatttacagtgccttgcgaaagtattcggcccccttgaactttgcgaccttttgccacatttcaggcttcaa

Function

NR:

description
cat eye syndrome critical region protein 6

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036945435.1 True 8111 mRNA 0.46 1 78148973 78157083

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118938863 NA coding downstream 124043 78024443 ~ 78024930 (-)
LOC110490687 LOC105023115 coding downstream 354107 77675445 ~ 77794866 (-)
LOC110490866 NA coding downstream 475111 77672463 ~ 77673862 (-)
LOC110499734 LOC106609838 coding downstream 542952 77601746 ~ 77606021 (-)
trnak-cuu-19 NA coding downstream 550649 77587377 ~ 77598491 (-)
LOC118938865 mkrn1 coding upstream 2708 78159791 ~ 78194251 (-)
LOC118938867 LOC106576670 coding upstream 142249 78298576 ~ 78452504 (-)
LOC118938869 NA coding upstream 416457 78573540 ~ 78574322 (-)
LOC118938870 LOC106592244 coding upstream 442506 78599589 ~ 78623477 (-)
LOC118938904 LOC106592658 coding upstream 480828 78637911 ~ 78639774 (-)
G1328398 il17r non-coding downstream 64 78146250 ~ 78148909 (-)
G1328396 NA non-coding downstream 7510 78140440 ~ 78141463 (-)
G1328394 NA non-coding downstream 10985 78137501 ~ 78137988 (-)
G1328391 NA non-coding downstream 14461 78133948 ~ 78134512 (-)
G1328366 NA non-coding downstream 21979 78126011 ~ 78126994 (-)
G1328403 NA non-coding upstream 5469 78162552 ~ 78163074 (-)
G1328406 NA non-coding upstream 19070 78176153 ~ 78177704 (-)
G1328411 NA non-coding upstream 29786 78186869 ~ 78190642 (-)
G1328441 NA non-coding upstream 103828 78260911 ~ 78261541 (-)
G1328447 NA non-coding upstream 119631 78276714 ~ 78279232 (-)
G1328123 NA other downstream 274369 77871279 ~ 77874604 (-)
LOC110515635 LOC106576658 other downstream 642199 77418263 ~ 77506802 (-)
G1326996 NA other downstream 2149973 75998506 ~ 75999000 (-)
G1326164 NA other downstream 3095616 75052749 ~ 75053357 (-)
G1326095 NA other downstream 3375020 74772299 ~ 74773953 (-)
G1328815 NA other upstream 606016 78763099 ~ 78766048 (-)
G1328861 NA other upstream 713242 78870325 ~ 78871031 (-)
G1328892 NA other upstream 768831 78925914 ~ 78926137 (-)
G1328987 NA other upstream 872584 79029667 ~ 79030956 (-)

Expression


Co-expression Network