LOC118938874


Basic Information

Item Value
gene id LOC118938874
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048579.1
NCBI id CM023233.2
chromosome length 81569517
location 79609180 ~ 79612871 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XR_005036252.1
GTCTGGTTAAACATCTACCAGCTGAACTAGGCTGGTCTGGTTAAACATCTACCAGCTGAACTAGGCTGGTCTAGGCTGGTCTGGTTAAACATCTACCAGCTGAACTAGGCTGGTCTAGGCTGGTCTGGTTACAAATCCACCAAAGCTGCCAAACGGATCATAAATCAAAGCCAGCGAGGTACAAGTTGGGTCAGCCCTATGGTAGGAATCAGGTATTAGTGTCCTGGCTGTGTGTCACCCTCCTGAGTAGGACCCAGTACCTGGCACTCCATACCAGACCTCATGTTCTACCAGATAAATCTCCTATAGTACCAGACCCCATGTTCTACCAGATTAGTCCTGCTTTAGTACCAGACCCCAAGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCAGACCCCATGTTCTAACAGATTAGTCCTCCTATAGTACCAGACCTCATGTTCTACCAGATAAGTCTCCTATAGTACCAGACCCCATGTTCTACCAGATTAGTCCTGCTTTAGTACCAGACCCCACGATCTACCAGATAAGTCCTCCATTAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCAGACCCCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCATGTTATACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCAGACCCCTTGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCAGACCCCATGCTCTACCAGATTAGTCCTCCTTTAGTACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGAACCATGTTCTGCCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCATGTTCTTCCAGATTAGTCCTCCTATAGAACCATGTTTTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCATGTTCTTCCAGATTAGTCCTCCTTTAGTTCCAGACCCCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTAAGTACCATGTTCTGCCAGATTAGTCCTCCTATAGAACCATTTTCTACCAGATTAGTCCTCCTTTAGTTCCAGACCCCATGTTCTACCAGGTTAGTCCTCCTATAGTACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTTTAGTACCCTATTCTACCAGACTAGTCATCCTATCGTACCAGACCCCATGTTCGTCCAGATTAGTCCTCCTGTAGTACCATGTTCCACCAGGTTAGTCCTCCTATAGAACCATGTTCTACCAGGTAGTCCTCCTATAGTACCATGTTCCACCAGATTAGTCCTCCTATAGAACCATTTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCATATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGAACCATCTTCTACCAGATTAGTCCTCCTTTAGTTCCAGACCCCATGTTCTACCAGGTTAGTCCTCCTATAGTACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTTTAGTACCCTGTTCTACCAGACTAGTCCTCCTATCGTACCAGACCCCATGTTCGTCCAGATTAGTCCTCCTGTAGTACCATGTTCTACCAGGTTAGTCCTCCTATAGAACCATGTTCTACCAGGTTAGTCCTCCTATAGAACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCAGACCCCATGTTCTACCAGGTAGTCCTCCTATAGTACCATGTTCCACCAGATTAGTCCTCCTATAGAACCATTTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCATATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGAACCATCTTCTACCAGATTAGTCCTCCTTTAGTTCCAGACCCCATGTTCTACCAGGTTAGTCCTCCTATAGTACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTTTAGTACCCTGTTCTACCAGACTAGTCCTCCTATCATACCAGACCCCATGTTCGTCCAGATTAGTCCTCCTGTAGTACCATGTTCTACCAGGTTAGTCCTCCTATAGAACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTTTAGTTCCAGACCCCATGTTCTACCAGACTAGTCCTCCTATCGTACCAGACCCCATGTTCGTCCAGATTAGTCCTCCTTTAGTACCCTGTTCTACCAGACTAGTCCTCCTATCGTACCAGACCCCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTTTACTACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGAACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGAACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTACTAGGTATTGGATGAAAGAAAAACCATATCTGGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACAGTGGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACAGTGGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACAGTGGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACAGTGGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACAGTGGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACAGTGGATTATCTGGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAATAGTGGATTATCTATGAGTGTGTATGGTGCTGGTATGGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACAGTAGATTAACTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAGACAGTGGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAGACAGTGGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACTGTAAATGATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACTGTGGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACAGTGGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAATAGTGGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACTGTGGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACTGTGGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACTGTGGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACTGTGGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACTGTGGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACAGTGGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAATAGTGGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACTGTGGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACTGTGGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACTGTGGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACTGTGGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACTGTGGATTATCTAGTGTG
>TU1519004
TTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCAGACCCCATGTTCTAACAGATTAGTCCTCCTATAGTACCAGACCTCATGTTCTACCAGATAAGTCTCCTATAGTACCAGACCCCATGTTCTACCAGATTAGTCCTGCTTTAGTACCAGACCCCACGATCTACCAGATAAGTCCTCCATTAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCAGACCCCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCATGTTATACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCAGACCCCTTGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCAGACCCCATGCTCTACCAGATTAGTCCTCCTTTAGTACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGAACCATGTTCTGCCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCATGTTCTTCCAGATTAGTCCTCCTATAGAACCATGTTTTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCATGTTCTTCCAGATTAGTCCTCCTTTAGTTCCAGACCCCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTAAGTACCATGTTCTGCCAGATTAGTCCTCCTATAGAACCATTTTCTACCAGATTAGTCCTCCTTTAGTTCCAGACCCCATGTTCTACCAGGTTAGTCCTCCTATAGTACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTTTAGTACCCTGTTCTACCAGACTAGTCCTCCTATCGTACCAGACCCCATGTTCGTCCAGATTAGTCCTCCTGTAGTACCATGTTCTACCAGGTTAGTCCTCCTATAGAACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTTTAGTTCCAGACCCCATGTTCTACCAGGTTAGTCCTCCTATAGTACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTTTAGTACCCTGTTCTACCAGACTAGTCCTCCTATCATACCAGACCCCATGTTCGTCCAGATTAGTCCTCCTGTAGTACCATGTTCTACCAGGTTAGTCCTCCTATAGAACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTTTAGTTCCAGACCCCATGTTCTACCAGACTAGTCCTCCTATCGTACCAGACCCCATGTTCGTCCAGATTAGTCCTCCTTTAGTACCCTGTTCTACCAGACTAGTCCTCCTATCGTACCAGACCCCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTTTACTACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGAACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGAACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTACTAGGTATTGGATGAAAGAAAAACCATATCTGGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACAGTGGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACAGTGGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACAGTGGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACAGTGGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACAGTGGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACAGTGGATTATCTGGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAATAGTGGATTATCTATGAGTGTGTATGGTGCTGGTATGGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACAGTAGATTAACTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACAGTGAGTCGTAGGAGCCTTTCAGTTGAAGAAATAATCCATAATGCCAGATCCAGATTTACCTAAATTGTCCTGCCAGattatgaatttatttaaaatgtttatCTTTGTTTAAATATTAACATCAGGGTACTCAGGCAGACGGGATAATTCTTCCTCTTCTATTTGATCATGTTTTTTAGAGTACAGTTGGCCAAAGCTCGAGACAGATCTGTACTTTTTAATAACTTGTAAAGCACCCAAACACCATTCAAGGGACCAaatgtagtgggggg

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XR_005036252.1 False 3258 mRNA 0.44 2 79609546 79612871
TU1519004 True 1927 lncRNA 0.43 4 79609180 79612441

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110536863 LOC105029310 coding downstream 120418 79487003 ~ 79489128 (-)
LOC118938873 LOC106590959 coding downstream 269541 79307180 ~ 79340005 (-)
LOC118938905 NA coding downstream 691413 78878740 ~ 78918133 (-)
LOC118936340 LOC106592244 coding downstream 913765 78677394 ~ 78695781 (-)
LOC118938904 LOC106592658 coding downstream 969772 78637911 ~ 78639774 (-)
LOC110513674 LOC106593057 coding upstream 5631 79618502 ~ 79623426 (-)
LOC118938876 NA coding upstream 59172 79667754 ~ 79691305 (-)
LOC118938877 LOC106594098 coding upstream 78747 79691618 ~ 79695469 (-)
LOC110510401 LOC106592932 coding upstream 297811 79910682 ~ 80084406 (-)
LOC110510850 NA coding upstream 522083 80133088 ~ 80139431 (-)
G1329494 NA non-coding downstream 1971 79605318 ~ 79607575 (-)
G1329484 NA non-coding downstream 4666 79604612 ~ 79604880 (-)
G1329492 NA non-coding downstream 14055 79595213 ~ 79595491 (-)
G1329490 NA non-coding downstream 19214 79588644 ~ 79590332 (-)
G1329486 NA non-coding downstream 34824 79574294 ~ 79574722 (-)
G1329514 NA non-coding upstream 62652 79675523 ~ 79679348 (-)
G1329527 NA non-coding upstream 106690 79719561 ~ 79721145 (-)
G1329495 NA non-coding upstream 108631 79721502 ~ 79751236 (-)
G1329528 NA non-coding upstream 111488 79724359 ~ 79725951 (-)
G1329481 NA other downstream 41574 79567334 ~ 79567972 (-)
G1329475 NA other downstream 66393 79542794 ~ 79543153 (-)
G1329004 NA other downstream 534010 79075290 ~ 79075536 (-)
G1328987 NA other downstream 578590 79029667 ~ 79030956 (-)
G1328892 NA other downstream 683409 78925914 ~ 78926137 (-)
G1329577 NA other upstream 266537 79879408 ~ 79880360 (-)
LOC110510397 LOC106596262 other upstream 552701 80151017 ~ 80231658 (-)

Expression


Co-expression Network