G1259783


Basic Information

Item Value
gene id G1259783
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048579.1
NCBI id CM023233.2
chromosome length 81569517
location 13401651 ~ 13405169 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1439233
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>TU1439234
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>TU1439236
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>TU1439238
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Function

NR:

description
hypothetical protein cypCar_00042377

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU1439238 True 3483 lncRNA 0.45 2 13401651 13405169

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110489606 skida1 coding upstream 21294 13374081 ~ 13380357 (+)
LOC110489600 LOC106590541 coding upstream 257628 13140028 ~ 13144023 (+)
LOC110515947 LOC106578389 coding upstream 279100 12835920 ~ 13122551 (+)
sec61g NA coding upstream 680910 12718578 ~ 12720741 (+)
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armc3 armc3 coding downstream 54040 13459209 ~ 13480871 (+)
LOC100135934 LOC106590529 coding downstream 91166 13496335 ~ 13505165 (+)
LOC110489613 LOC106590529 coding downstream 109630 13514799 ~ 13517938 (+)
si:ch211-230g15.5 LOC106590521 coding downstream 127433 13532602 ~ 13551953 (+)
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G1259861 NA non-coding downstream 126205 13531374 ~ 13531617 (+)
G1259481 NA other upstream 217084 13184293 ~ 13184567 (+)
LOC110489591 LOC106592044 other upstream 762186 12562131 ~ 12639556 (+)
G1258375 NA other upstream 1496133 11905086 ~ 11905518 (+)
G1257945 NA other upstream 1938163 11461992 ~ 11463488 (+)
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G1260013 NA other downstream 464146 13869315 ~ 13870230 (+)
G1260074 NA other downstream 556332 13961501 ~ 13961816 (+)
LOC110489635 LOC106590481 other downstream 805196 14186442 ~ 14217437 (+)

Expression


Co-expression Network