XLOC_031795 (STRADB)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_031795
gene name STRADB
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 4229360 ~ 4250154 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00062286
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>TCONS_00062285
ggtttaaaaactgtaatgatttaaatatttttcgtGCATATCAACTGTACGAAAAATTAGTAATTTCTATCTTTTTTGTTAGAAAAACCAATTTTACCTATAAACGTCTCTGTCAGATCAGAAAGGTATGCTTTTTAGGGAGGGAGATGATTGCTATTTTTAAAGAGCATAGTAATTCCTGATGTTATAGCTTCCATAACAATCGCGAATTTATTTTGGACTTATTGGTATGTTATatggaaaaataaattcaaagtaattaataaaaaaaactaatacgtTATTCGCGCCATGTCTTAGAGACTTTTATTATGTAAACGTTTCAGACGTCAGGCGTGACGCGTGATCAGCTGGGACTGTGAAGAAAAGCTTTGGCAAGTCAACttacaaatgttattaaatatgagAGGCGCTGCATATGATTTGTCTTTAATAGTACAGCTGTGATTTGACCAAAGTGACTGTAACTGCCCAGAACTGACGCTCGGCGGCAAAAACGCGGCGGCAAAATCAATTTACAGATGACCCTCCATCAGCATGCAGAACAATGGACTCTAATGGAGCTGCATGAGCTGAGATCGAGCCGGTGCCTTTTATGGAATGAAATCCAAGCAAAGCCAGAATCGGATAAATGAACTCCAGTGAAGCTTCAGCTCAGCCAAAAGCCCCTCATGTCGTTTCTGGACTGCACCTGTATCTCCTCCCACTCACAAGTCCAGTCCATCAGCATAGAGGAGCAGTATGAAGACATCAGCCATCAGTGCTCGAGCACAGATGTCTCTCCGTGTTCGGTGTTGACGGATGCCGATGACATCACAGATCTGTCCACTGACTCCGCCCACTATCAGCTCCTGTCACCACTGGgccggGGCTTTAATAACCTCAGTCATGTGAGTGTGGCACGTCACACTCCGTCTGGCCGTCTGGTGGCCGTGAAAAACACAAACCTGGACGAGTGTACAGAAGACGAGCTCCTGCAGCTGATGAATGAGGTTCTTCTGTCCAGACGGTTCCGGCACCCGAATCTGCTGACGTCCAGACTGGTGTTCAGCTCCTGCTGTCAGCTCTGGGTTCTGGCTCCTCTTATGAGCTACGGTTCTGCAGACTCTCTGCTCAGGTCGTATTTTCCAGACGGGATGAGCGAGTCTCTAATGGCGTATCTGCTGTACGGTGTCCTGCGAGCGCTCGAGTACCTGCATCACATGGGATATGTGCACAGGGGTGTGAAGGCCAGTCATGTGCTGCTGTCGGCTGAAGGAAGAGTGTGTCTGTCGGGTCTTCAGAGTGTCTACAGTTTGATGAAGGACGGGAAGAGGATGAGAGCCGTGTTCGACATGCCTCAACACAGTCCATCTCTCCTGCCCTGGCTGAGCCCTGAGCTGCTGAGACAGGATCTTCATGGTTATGGGGTGAAGTCAGACATCTACAGTCTGGGGATCGTGGCATGTGAGCTGGTCAGTGGCAGAGTGCCATTTCAGGACATGCCGCCCACTCTGATGTTGCTTCAGAAGCTGCGGGGATCTCACTGTTGTCTCCTGGACGTGCCTCCGTACCCTCTGGGTGGAATGGGTGCGCTGAAGGTGTCCCGCTCGGGGGTGGATTCGGGGATTGGGGAGAGTGTGGCGACTGGCAGTCTGACCCGCACTGCTACTGCGGAGCGACCGCAGAGTCCCGCTCCCAAAAACCACTCAGCCACACTGCACAACCTGGTGCAactatgtttgcagcagcagccTGAGCGCAGGCCATCTGCGACAGCTCTCCTCAACCATCCCTTCTTCAGACAGGTGAAGAAGCACACGAGGGACTCTTTCCTCAGTCTGATGTATCCTGCTGTGCCAGTGTCCTGCCCTCCAGACACGCCTCCGTCCCAAACCCCAACCCAGACCTGCAACACGCCGTCTCCCACTGATCCTGAGCCAGAGGACGGTCTGTGGGACTTCTAACGTTCACTGTCTTCCTCACACAAACCTCTACATGAGCAACTAGCAATTAATCCTAACAACTGCTGCATTCTGctgtttatttgattagtatTTGTAGTGCTACGTTAGCCCCGCCCACAGTGAAATCTTATTGGTTTAAATCCTCTTGTTATGAACCGATATATTAATGATGACGTCATCCTGCACTTAAAGGGGTGTCTATGATTagtatttgttaaaaaatgtttaattgttcATTAATTGTAGTATTACATTTGCTCCGCCCACAGTGAAATCTCATTGGTTTAAATCCTCTTGTTATGGACCGATATATTAATGATGACGTCATCCTGCACTTATGGGCGTGTCTATGATTAgtatttgtaaaacaaaaaaaaaacattttatatttgtagtactatgttagccatgcccacggttaaatttaattagtttaaatccTCCTGGTATGGACTTATGAATTGATGATGATGTCATCCTGCACTTATGGGTGTGTCTatgatttttgtaaaaaaaaaattaattaatgtttagtaGTTGTAGCACTACGTTAGCCCCACCCACAGTAAAATCTCATTGGTTTAAATCCGTTTGGTATAGACCATTATATTGATGATGACATCATCCTGCACTTATGGGCGTGTCTATGATTagtatttgttaaaaaatgtttagtaGTTCATTAATCGTAGTACTACATTAGCCCCGCCCACAGTGAAATCTCATTGGCTTAAATCCTTTTGGTATGATCCAATAAATTGATGATGACGTCATCCTGCACTTATGGGCGTGTCTATCATTagtatttgttaaaaaatgttcAGTAGTTTATTAATCGTAGTACTACATTAGCCCCGCCCACAGTGAAATCTCATTGGCTTAAATCCTTTTGGTACGATCCAATACGTTATTGATGACATCATCCTGCACTTAGGGCATGTCTATGATtagtatttgttaaaaaaaaggatTAGTATTTGTAGTACTACATTAGCTCCGCCCACAGTGAAACCTCATTGGCTTAAATCTTCCCCTTATGGACCGATATATTGATGATGATATCATTCTGCACTTATGGGCGTGTCTATGATtagtatttgtaaaaaaaaagtttaatatttgtAGTACTATGTTAGCCCCGCCCACAGTTAAATTCATTAGTTTTAAATCCTATCGGTATGGACTTATAAATTGATGATGTCATCCTGGACTTATGGGTGTGTCTATGATTagtatttgttaaaaaatgtttagtagttaattaattgtattattagatTAGACCAGCCCACAGTAAAATTTAATTGGCTTAAATCTGTTTGGTATGGACCAATATATTGATGATGACGTCATCCTGTGCTTGTGGGCGTGTCTGTGATTAGTATTTCTGAAAAAAGAAAGTTTAGCATTTGTAGTACTATGTTAGCTCCGCCCACAGTGAAATCTCATTGGTTTGAATCCTCTTTCTATAGACCAATACACTGATGATGACGTCATCCTGTGCTTGTGGGCGTGTCTATGATtagtatttgtaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagataattaaaagtTTAGTATTTCTATAACACGTTAGCCCCGCCCACAATGAAATCTCATTAGTTTAAGTCGTCCTTGACCAAAATGTTGATAATGACATCATCCTGCGCTTATGGGCGTGTCTTTGTTTCTAGCCTATCATATGCTCTCTAGAATGAGCACAAATTAGCGAACGTTTCATGCATTAGCACATTAGCATCTGTATAGTCATTGTTAATGGCTGTGGCCTACACTAAAAGCTGTCAGCTAGGGCTGGAGGATTGGTCAAAATAAAGATGATCTTGGGATATAGTGTGATTATCAAATAACATTATCAAATAAGTGCAATTTTATTCATTAAGTATATGTGAAGCAGTTTATGATCCAGTGTGTTCTGCCTCTCTGAACGGCTCAGTTCccaaaaaagaataataataaaataaaactgggCTGTCTGAAAAATCAAGACATAATAATACCATAAATATTAGTGTTGTCGTTTTACACATGttctatttttattactttttaaaataaatctagtATTATAATTTTACAGTGAAGTATTGCAGCGCTAACATTTCTTATTGTGCTTAATTTTGAAGCAATCTTGAGGGAATAATTctcattattttaataactaataaatatttataatcttATTACAATGCCATTTCAAcacaaatctttattttttatattttaatttagtagCAATAATTAATGCATTAGGATTTTCTTAAATATAGTAattctgtaaaatattaatttcaatgcttcttattttgctcattttcataataatcataaaacattatataaatataaatttcacAGTGACACTATGgtactactttttatttttatattcttatttTGAATCTTTTTGTATCAATACtatgttattatgattattaatattatactgaATATTATACTGTTATTATactgaataaatatatgtaaatatttccCCTAAATCATGcatccttttttaatatttaattaatttcttttaataaaaGACAAGCTCCTTTGGTcatgtctcaacacaaatcgattaagttaatgtaataattttgaaatatttaagtagattgaacttaaaacaattaagttgtcccaaaacaatcaaagaattgtgttgtttcaactcattttaaataagtagtatactagaaaaagtcatttttagagtgtacagtTAAACCGTTCATAAATATCAACACTATATGCTCTGTCTgactgtaatatcatcactttatGCAACATTTGACTTTTCAATTGTTTTTTATGGGCAGAAAAATGCCATGATAAGTGATAGAAGCTGGTTGAGATGCACTGTGACTTGTGTCTTATTCCCTGCTGTGAGCTCTTCTTCTGTGTATACTGCACTCGTGTAGTAGTTACAATTCAGTAGTTTACCAAAGTATTCAACGCATACTGTGCTCATACTACCGTAATGGCTGTTTGTTTGCTCTAAACCCTGTCATAAATCATAAAATAGCTGCAGATCACTGGAT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Function

symbol description
stradb Predicted to enable ATP binding activity and protein kinase activity. Involved in activation of protein kinase activity and protein export from nucleus. Located in aggresome; cytosol; and nucleus.

GO: NA

KEGG:

id description
ko04152 AMPK signaling pathway
ko04150 mTOR signaling pathway
ko01001 Protein kinases

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-130826-1 No description available

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000088225

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00062286 False 5655 mRNA 0.39 12 4229360 4250154
TCONS_00062285 True 5520 mRNA 0.38 13 4229360 4250154

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_031794 trim25l coding upstream 52519 4160579 ~ 4176841 (+)
XLOC_031793 sema5bb coding upstream 83287 4033832 ~ 4146073 (+)
XLOC_031792 CU914157.1 coding upstream 224904 4001317 ~ 4004456 (+)
XLOC_031791 dync1i2b coding upstream 272780 3934738 ~ 3956580 (+)
XLOC_031790 NA coding upstream 350145 3877672 ~ 3879215 (+)
XLOC_031796 nbeal1 coding downstream 5165 4255319 ~ 4365331 (+)
XLOC_031797 rbm26 coding downstream 120781 4370935 ~ 4403253 (+)
XLOC_031798 NA coding downstream 268004 4518158 ~ 4520247 (+)
XLOC_031799 CABZ01046895.1 coding downstream 278477 4528631 ~ 4536338 (+)
XLOC_031800 pou4f1 coding downstream 289799 4539953 ~ 4543005 (+)
XLOC_031787 NA non-coding upstream 403235 3816049 ~ 3826125 (+)
XLOC_031780 NA non-coding upstream 648069 3575051 ~ 3581291 (+)
XLOC_031776 NA non-coding upstream 806627 3419776 ~ 3422733 (+)
XLOC_031802 NA non-coding downstream 948115 5198269 ~ 5399444 (+)
XLOC_031803 CU074421.2 non-coding downstream 1434027 5684181 ~ 5684295 (+)
XLOC_031804 NA non-coding downstream 1688311 5938465 ~ 5981858 (+)
XLOC_031805 NA non-coding downstream 1835082 6085236 ~ 6086132 (+)

Expression


Co-expression Network