G1290620


Basic Information

Item Value
gene id G1290620
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048579.1
NCBI id CM023233.2
chromosome length 81569517
location 39188186 ~ 39279823 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1472885
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>TU1472886
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>TU1472890
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>TU1472882
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>TU1472887
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>TU1472894
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>TU1472884
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>TU1472888
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>TU1472901
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>TU1472898
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>TU1472893
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>TU1472889
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>TU1472895
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>TU1472897
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>TU1472900
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1472885 False 360 lncRNA 0.40 2 39188186 39234498
TU1472886 False 412 lncRNA 0.40 2 39188186 39220814
TU1472890 False 360 lncRNA 0.40 2 39188186 39233454
TU1472882 False 1290 lncRNA 0.41 2 39217851 39268830
TU1472887 False 774 lncRNA 0.41 3 39217851 39279823
TU1472894 False 471 lncRNA 0.42 2 39217851 39273305
TU1472884 False 1056 lncRNA 0.40 2 39231997 39238311
TU1472888 False 404 lncRNA 0.41 2 39231997 39234498
TU1472901 False 404 lncRNA 0.41 2 39231997 39233454
TU1472898 False 925 lncRNA 0.40 2 39252727 39261051
TU1472893 False 404 lncRNA 0.41 2 39259455 39279823
TU1472889 False 838 lncRNA 0.40 2 39261566 39269811
TU1472895 False 1047 lncRNA 0.40 2 39261566 39266844
TU1472897 False 404 lncRNA 0.41 2 39261566 39279823
TU1472900 True 582 lncRNA 0.40 2 39264148 39266844

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110490841 NA coding upstream 98550 39086859 ~ 39089636 (+)
LOC110490726 LOC106600248 coding upstream 103486 39082814 ~ 39084700 (+)
LOC110490723 LOC106612786 coding upstream 332078 38855250 ~ 38856108 (+)
LOC110490039 LOC106590018 coding upstream 607430 38576635 ~ 38580756 (+)
LOC110490038 LOC106590019 coding upstream 619707 38494289 ~ 38568479 (+)
brca2 NA coding downstream 267521 39547344 ~ 39589108 (+)
LOC110490049 LOC106612364 coding downstream 369547 39649370 ~ 39684044 (+)
LOC110490050 LOC106612350 coding downstream 632619 39845713 ~ 39929225 (+)
LOC110490053 fgf12 coding downstream 657063 39936886 ~ 40053076 (+)
LOC110490048 il-1racp coding downstream 809641 40089464 ~ 40132600 (+)
G1290623 NA non-coding upstream 3919 39181236 ~ 39184267 (+)
G1290619 NA non-coding upstream 21984 39136791 ~ 39166202 (+)
G1290613 NA non-coding upstream 65113 39122681 ~ 39123073 (+)
G1290549 LOC106590036 non-coding upstream 126938 39037005 ~ 39061248 (+)
G1290622 NA non-coding downstream 16470 39296293 ~ 39301777 (+)
G1290653 NA non-coding downstream 22622 39302445 ~ 39367387 (+)
G1290654 NA non-coding downstream 35307 39315130 ~ 39333444 (+)
G1290675 NA non-coding downstream 99325 39379148 ~ 39429457 (+)
G1290678 NA non-coding downstream 149703 39429526 ~ 39498152 (+)
G1290614 NA other upstream 61177 39126272 ~ 39127009 (+)
G1289710 NA other upstream 587945 38594880 ~ 38600241 (+)
G1289491 NA other upstream 1004183 38183436 ~ 38184003 (+)
G1287489 LOC106590045 other upstream 2677674 36509078 ~ 36510512 (+)
G1291464 NA other downstream 787735 40067558 ~ 40067907 (+)
G1293072 NA other downstream 2303550 41583216 ~ 41589030 (+)
G1293295 NA other downstream 2629211 41909034 ~ 41909611 (+)
G1294319 NA other downstream 3485030 42764853 ~ 42767937 (+)

Expression

G1290620 Expression in all Baseline Samples

Bar chart with 20 bars.
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying values. Range: 0 to 100.
End of interactive chart.

G1290620 Expression in each Bioproject

Bar chart with 12 bars.
G1290620 Expression in each Sample
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying Expression. Range: 0 to 3000.
End of interactive chart.

Co-expression Network