G1318458


Basic Information

Item Value
gene id G1318458
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048579.1
NCBI id CM023233.2
chromosome length 81569517
location 64939624 ~ 65013985 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1504359
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Function

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KEGG:

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RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1504359 False 2364 lncRNA 0.41 5 64939624 64961889
TU1504367 False 1822 lncRNA 0.38 5 64942036 65013499
TU1504371 False 3175 lncRNA 0.41 3 64942036 64965515
TU1504361 False 1681 lncRNA 0.39 4 64978451 65013985
TU1504362 False 1016 lncRNA 0.38 3 64978451 65013499
TU1504370 False 1196 lncRNA 0.38 3 64978451 65013499
TU1504378 False 953 lncRNA 0.38 3 64978451 65013499
TU1504357 False 1355 lncRNA 0.39 2 64996016 65013985
TU1504358 False 924 lncRNA 0.38 3 64996016 65013499
TU1504365 False 1355 lncRNA 0.39 2 64996016 65013985
TU1504376 False 977 lncRNA 0.38 3 64996016 65013499
TU1504360 False 1004 lncRNA 0.37 2 65012355 65013499
TU1504368 True 1004 lncRNA 0.37 3 65012355 65013499

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110517721 LOC106590767 coding downstream 230540 64706097 ~ 64709084 (-)
LOC110499867 LOC106576572 coding downstream 303122 64481916 ~ 64636502 (-)
hgfa LOC105020379 coding downstream 482494 64412045 ~ 64457130 (-)
LOC110490780 snd1 coding downstream 551655 64018813 ~ 64387969 (-)
LOC118938928 NA coding downstream 1396507 63542691 ~ 63543117 (-)
LOC118938827 LOC106576471 coding upstream 7420 65021405 ~ 65058643 (-)
LOC110513258 cacna2d4 coding upstream 139398 65153383 ~ 65231663 (-)
LOC110517393 LOC106576623 coding upstream 255005 65268990 ~ 65303134 (-)
LOC110512490 LOC106592130 coding upstream 864025 65878010 ~ 65892365 (-)
LOC110511373 LOC106592131 coding upstream 878463 65892448 ~ 65898819 (-)
G1318450 NA non-coding downstream 8675 64930543 ~ 64930949 (-)
G1318448 NA non-coding downstream 10031 64927343 ~ 64929593 (-)
G1318445 LOC106576468 non-coding downstream 18198 64919470 ~ 64921426 (-)
G1318438 NA non-coding downstream 32602 64904556 ~ 64907022 (-)
G1318427 NA non-coding downstream 68850 64870478 ~ 64870774 (-)
G1318488 NA non-coding upstream 70111 65084096 ~ 65084339 (-)
G1318491 NA non-coding upstream 76147 65090132 ~ 65091285 (-)
G1318498 NA non-coding upstream 85546 65099531 ~ 65103149 (-)
G1318499 NA non-coding upstream 86715 65100700 ~ 65102103 (-)
G1318515 NA non-coding upstream 119667 65133652 ~ 65134102 (-)
G1318164 LOC106576481 other downstream 711949 64216504 ~ 64227675 (-)
G1318092 NA other downstream 855736 64083037 ~ 64083888 (-)
G1316904 LOC106609576 other downstream 1651720 63256527 ~ 63287904 (-)
G1316451 NA other downstream 2034942 62902859 ~ 62904682 (-)
G1318477 NA other upstream 54292 65068277 ~ 65153287 (-)
G1318935 NA other upstream 455982 65469967 ~ 65473164 (-)
G1319357 LOC106593594 other upstream 1265060 66279045 ~ 66282108 (-)
LOC110490781 LOC106576552 other upstream 1794462 66808409 ~ 66920061 (-)
G1319781 LOC106576551 other upstream 1842194 66856179 ~ 66862281 (-)

Expression


Co-expression Network