G1319818


Basic Information

Item Value
gene id G1319818
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048579.1
NCBI id CM023233.2
chromosome length 81569517
location 66869294 ~ 66884898 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1506170
TGTTGTAGGTTTTTTTtgctattagtttggaggtgttgcttggtttcttactattagtttggaggtgttgtaGGTTTTTTTtgctattagtttagaggtgttgcagggtttcttactattagtttagaggtgttgcagggtttcttactattagtttggaggtgttgcagggtttcttactattagtttagaggtgttgcagggtttcttactattagtttggaggtgttgcagggtttcttactattagtttggaggtgttgcagggttcttactattagtttggaggtgttgctgggttttttactattagtttagaggtgttgcagggttttttactattagtttagaggtgttgcttggtttcttactattagtttagaggtgttgcttggttttttactattagtttggaggtgttgcttggtttcttactattagtttagaggtgttgcagggtttcttactattagtttagaggtgttgcagggtttcttactattagtttggaggtgttgcagggttttttactattagtttggaggtgttgcagggttttttactattagtttagaggtgttgcagggtttcttactattagtttggaggtgttgcagggttttttactattagtttagaggtgttgcttggttttttactattagtttggaggtgttgcagggttttttactattagtttggaggtgttgcagggttttttactattagtttggaggtgttgcagggttttttactattagtttagaggtgttgcttggtttcttactattagtttagaggtgttgcagggttttttactattagtttagaggtgttgcagggtttttatactattagtttggaggtgttgctgggtttcttactattagtttagaggtgttgcttggttttttactattagtttggaggtgttgcagggtttttatactattagtttggaggtgttgctgggtttcttactattagtttagaggtgttgcttggttttttactattagtttggaggtgttgcttggtttcttactattagtttggaggtgttgcttggttttttactattagtttggaggtgttgcagggttttttactattagtttggaggtgttgcagggttatttactattagtttggaggtgttgctgggtttcttactattagttttgaggtgttgcttggttttttactattagtttggaggtgttgcagggttattTACTAtgagtttggaggtgttgctgggtttcttactattagtttggaggtgttgctgggtttcttactattagtttggaggtgttgcagggttatttactattagtttggagg
>TU1506181
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>TU1506173
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>TU1506175
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>TU1506185
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>TU1506174
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>TU1506171
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1506170 False 1347 lncRNA 0.37 6 66869294 66884898
TU1506181 False 451 lncRNA 0.36 3 66869980 66878663
TU1506173 False 558 lncRNA 0.37 3 66871657 66882680
TU1506175 False 210 lncRNA 0.37 2 66875863 66882680
TU1506185 False 210 lncRNA 0.37 2 66875863 66880943
TU1506174 False 930 lncRNA 0.35 9 66881744 66884898
TU1506171 True 1096 lncRNA 0.35 4 66883319 66884898

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110501008 LOC105020375 coding downstream 156262 66655198 ~ 66713032 (-)
LOC110519130 LOC106609628 coding downstream 238693 66564918 ~ 66638625 (-)
LOC110515929 ptprr coding downstream 315709 66518773 ~ 66553585 (-)
LOC118938831 LOC106609809 coding downstream 355770 66417454 ~ 66513524 (-)
LOC110519161 NA coding downstream 453142 66413335 ~ 66416251 (-)
LOC110490597 LOC106609625 coding upstream 39144 66924042 ~ 66940668 (-)
LOC110490598 LOC106576550 coding upstream 55842 66940740 ~ 66942750 (-)
LOC118938832 LOC106609653 coding upstream 186416 67071314 ~ 67075634 (-)
LOC110511902 LOC106609654 coding upstream 194408 67079306 ~ 67084695 (-)
LOC110501001 LOC106609634 coding upstream 270526 67155424 ~ 67350716 (-)
G1319803 LOC106576551 non-coding downstream 39975 66820432 ~ 66829319 (-)
LOC110490781 LOC106576552 non-coding downstream 56170 66808409 ~ 66920061 (-)
G1319793 NA non-coding downstream 77293 66788845 ~ 66792001 (-)
G1319826 NA non-coding upstream 5235 66890133 ~ 66890818 (-)
G1319829 NA non-coding upstream 15999 66900897 ~ 66901482 (-)
G1319817 NA non-coding upstream 27302 66912200 ~ 66919402 (-)
G1319840 LOC106609624 non-coding upstream 59372 66944270 ~ 66944941 (-)
G1319841 NA non-coding upstream 60348 66945246 ~ 66945497 (-)
G1319781 LOC106576551 other downstream 7013 66856179 ~ 66862281 (-)
G1319357 LOC106593594 other downstream 587186 66279045 ~ 66282108 (-)
G1318935 NA other downstream 1396130 65469967 ~ 65473164 (-)
G1318477 NA other downstream 1717894 65068277 ~ 65153287 (-)
LOC110499867 LOC106576572 other downstream 2383976 64481916 ~ 64636502 (-)
G1319847 NA other upstream 76053 66960951 ~ 66961304 (-)
G1320139 NA other upstream 308218 67193116 ~ 67193493 (-)
LOC118938833 LOC106608919 other upstream 908127 67785217 ~ 67797863 (-)
LOC110513021 exoc4 other upstream 1187503 67998532 ~ 68239937 (-)

Expression


Co-expression Network