XLOC_032162 (BX950188.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_032162
gene name BX950188.1
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 36465347 ~ 36618498 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00062848
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>TCONS_00064887
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>TCONS_00064888
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>TCONS_00064889
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>TCONS_00064891
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>TCONS_00064893
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>TCONS_00062849
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Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000044326

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00062848 False 5648 processed_transcript 0.33 2 36465347 36472948
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TCONS_00064890 False 627 lncRNA 0.41 5 36472629 36573471
TCONS_00064891 False 562 lncRNA 0.40 5 36472660 36580278
TCONS_00064892 False 1372 lncRNA 0.48 6 36472672 36592208
TCONS_00064893 False 1317 lncRNA 0.49 7 36472672 36618498
TCONS_00062849 True 638 processed_transcript 0.44 4 36472721 36542102

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_032161 lrrc15 coding upstream 1652 36459897 ~ 36463695 (+)
XLOC_032160 NA coding upstream 50261 36414723 ~ 36415086 (+)
XLOC_032159 rhcgl1 coding upstream 73660 36381709 ~ 36391687 (+)
XLOC_032158 BX936433.1 coding upstream 180236 36281005 ~ 36285111 (+)
XLOC_032156 NA coding upstream 206193 35916253 ~ 36259154 (+)
XLOC_032164 NA coding downstream 95861 36714359 ~ 36714622 (+)
XLOC_032165 si:ch73-29l19.1 coding downstream 176727 36795225 ~ 36819369 (+)
XLOC_032166 tmem45a coding downstream 203123 36821621 ~ 36837536 (+)
XLOC_032167 sft2d2a coding downstream 221011 36839509 ~ 36844020 (+)
XLOC_032168 chd1l coding downstream 225629 36844127 ~ 36877587 (+)
XLOC_032157 NA non-coding upstream 345457 36116704 ~ 36119890 (+)
XLOC_032155 NA non-coding upstream 640971 35794657 ~ 35824376 (+)
XLOC_032171 BX950870.1 non-coding downstream 372072 36990570 ~ 36990684 (+)
XLOC_032172 NA non-coding downstream 565695 37184193 ~ 37250364 (+)
XLOC_032175 NA non-coding downstream 695839 37314337 ~ 37315909 (+)
XLOC_032176 BX324166.1 non-coding downstream 716061 37334559 ~ 37334963 (+)

Expression


Co-expression Network