G1322725


Basic Information

Item Value
gene id G1322725
gene name NA
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048579.1
NCBI id CM023233.2
chromosome length 81569517
location 70843945 ~ 70847944 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1509919
GCTGTCGACGCCtcatgacatcacagaggaagtGAGTCATCATGAGAAGACGAGCAGACCACCCTGCTGCGCCCTCATGGCGGTACGATGTCGATGACACATCCCACAGCGTCAGACAGTGAGCTAACTATATAATAAACGGTTTATCTCTATGGAGCTAACTAGCCAACAGtcacaacaacatggaggaatgTGTCACACAAACAAGATGTCTGCTGTATCAAATTTAATCACTTGAATGAGCCGTAATGGACGGGCATAACATAGAAGGAACGAACAGGAACTATggtaccaggaacagagttatgggccgatgggaacagtaacTATGGTACCAGGAAaagagttatgggccgatgggaacagtaattatggtaccaggagcagagttatgggctgataggaacagtaattatggtaccaggaacagagttatgggccgatgggaacagtaattatgggaccaggagcagagttatgggctgataggaacagtaattatggtaccaggaacagaggtatgggccgatgggaacagtaattatgggaccaggagcagagttatgggccaatgggaacagtaattatggtaccaggaacagagttatgggctgatgggaacagtaattatgggaccaggaacagagttatgggctgattggaacagtaattatggtaccaggagcagagttatgggctgatgggaacagtaattatggtaccaggaacagagttatgggctgatgggaacagtaattatggtaccaggaacagagttatgggctgataggaacagtaattatggtaccaggaacagagttatgggcTGATGGGACCAGTAATTATGggaccaggaacagagttatgggctgatgggaacagtaattatggtaccaggagcagagttatggtccgatgggaacagtaattatggtaccaggagcagagttatggtccgatgggaacagtaattatggtaccaggagcagagttatgggccgatgggaacagtaattatggtaccaggagcAGAGTTATGGtccgatgggaacagtaattatggtaccaggagcagagttatgggccgatgggaacagtaattatggtaccaggaacagagttatgggccgatgggaacagtaattatgggaccaagagcagagttatgggccgatgggaacagtaattatggtaccaggaaAATAGTTATGGGCTGATGGGAACAGTAACTATgggaccaggagcagagttatgggccgatgggaacagtaattatggtaccaggaacagagttatgggctgatgggaacagtaattatggtaccaggagcagagttatgggccgatgggaacagtaattatgggaccaggagcagagttatgggccgatgggaacagtaattatggtaccaggaacagagttatggtccgatgggaacagtaattatgggaccaggaacagagttatgggccgatgggaacagtaattatgggaccaggagcagagttatgggccgatgggaacagtaattatggtaccaggaacAAGAGTTATGGtccgatgggaacagtaattatgggaccaggaacagagttatgggccgatgggaacagtaattatgggaccaggaacagagttatgggccgatgggaacaATAATTACACACCACACTCCCTTCCTTGACGGGCTTTTTGTTGAGATGTTCGACGATGCCATAGATGCAGAGCGGCCCGGCGAAGCCCAGCAGATCCGCCAGGTAACGGAAGGTACTGCTGAGGAGGATGGGTCGGCCAAACGCCCGGTACATAGAGCGCCAGATGGATGGAGCCTTCTCTGGGTCCTCGGCATTCTGCTAGGAGGGGGAGGGGACAGGGATGGAAGGGTTACAACTACACAGGAGAGTTCCACTACAATGAACCTTCATCTCAGAGTGAAGATGAGACTACCTGATTACAGAGTCTGGTTCGCCAGactacattatttatttatttaacctttatttaactaggcaagtcagttaagaacaaattcttattttca

Function

NR:

description
PREDICTED: ATP-binding cassette sub-family C member 9-like isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1509919 True 2042 TUCP 0.47 2 70843945 70847944

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118938837 LOC106576594 coding upstream 190062 70649032 ~ 70653883 (+)
LOC110490670 NA coding upstream 274221 70565742 ~ 70569724 (+)
LOC110490651 apex1 coding upstream 293416 70547485 ~ 70550529 (+)
LOC110490654 LOC106576592 coding upstream 301111 70538862 ~ 70542834 (+)
LOC110490656 LOC106576586 coding upstream 304983 70528555 ~ 70538962 (+)
LOC110490812 LOC106576598 coding downstream 29200 70877144 ~ 71062055 (+)
LOC110490701 LOC106609709 coding downstream 309097 71157041 ~ 71158063 (+)
LOC110490712 nel coding downstream 447481 71295425 ~ 71400412 (+)
LOC110499746 LOC106609793 coding downstream 610863 71458807 ~ 71475849 (+)
LOC110499745 LOC106576507 coding downstream 630525 71478469 ~ 71488470 (+)
G1322722 NA non-coding upstream 5846 70837614 ~ 70838099 (+)
G1322717 NA non-coding upstream 15282 70828374 ~ 70828663 (+)
G1322713 NA non-coding upstream 20454 70822489 ~ 70823491 (+)
G1322694 NA non-coding upstream 60047 70783530 ~ 70783898 (+)
G1322676 NA non-coding upstream 80571 70734169 ~ 70763374 (+)
G1322728 NA non-coding downstream 1867 70849811 ~ 70850022 (+)
G1322729 NA non-coding downstream 2710 70850654 ~ 70851036 (+)
G1322730 NA non-coding downstream 4024 70851968 ~ 70852198 (+)
G1322731 NA non-coding downstream 4602 70852546 ~ 70852850 (+)
G1322738 NA non-coding downstream 12708 70860652 ~ 70860862 (+)
G1322161 NA other upstream 940287 69900944 ~ 69903658 (+)
G1322119 NA other upstream 1044083 69798196 ~ 69799862 (+)
G1321053 NA other upstream 2047964 68794598 ~ 68795981 (+)
G1320834 NA other upstream 2556677 68285896 ~ 68287268 (+)
G1320366 NA other upstream 3299464 67544041 ~ 67544481 (+)
G1322763 NA other downstream 88281 70936225 ~ 70937145 (+)
G1323962 NA other downstream 1342479 72190423 ~ 72191163 (+)
LOC110531894 LOC106598741 other downstream 1608273 72416050 ~ 72481441 (+)
LOC110490361 LOC106609821 other downstream 1894269 72742193 ~ 72850175 (+)
G1324156 LOC106576365 other downstream 2005622 72853566 ~ 72856022 (+)

Expression


Co-expression Network