G1324464 (typh)


Basic Information

Item Value
gene id G1324464
gene name typh
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048579.1
NCBI id CM023233.2
chromosome length 81569517
location 72240548 ~ 72260352 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU1512126 False 3382 lncRNA 0.43 5 72240548 72260352
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TU1512137 False 2686 lncRNA 0.40 4 72241279 72260352
TU1512128 False 3181 lncRNA 0.42 3 72246171 72260352
TU1512135 False 1729 lncRNA 0.42 3 72247782 72260352
TU1512125 False 611 lncRNA 0.40 2 72248673 72260352
TU1512131 False 796 lncRNA 0.41 2 72248673 72260352
TU1512133 False 736 lncRNA 0.41 2 72248673 72260352
TU1512134 False 734 lncRNA 0.41 2 72248673 72260352
TU1512136 False 713 lncRNA 0.42 2 72248673 72260352
TU1512138 True 613 lncRNA 0.41 2 72248673 72260352

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC110500989 LOC106576674 coding downstream 89552 72022817 ~ 72150996 (-)
LOC110490787 LOC106593403 coding downstream 223500 71984728 ~ 72017048 (-)
LOC118938840 LOC106576579 coding downstream 317285 71841725 ~ 71923263 (-)
LOC110499807 lsm8 coding upstream 5338 72265690 ~ 72269495 (-)
LOC110490622 LOC106595912 coding upstream 10826 72271178 ~ 72281002 (-)
LOC110490625 LOC106596128 coding upstream 46514 72306866 ~ 72315261 (-)
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LOC110531910 gsap other upstream 254318 72500414 ~ 72533138 (-)

Expression


Co-expression Network