G1324604


Basic Information

Item Value
gene id G1324604
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048579.1
NCBI id CM023233.2
chromosome length 81569517
location 72480405 ~ 72481169 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1512319
TTCAAATATACCTGCTGTTTAATGAGCTTGTGTTGAGAATCTAAAGGCCCTGTGATGATTGGCTGCTACACTACTAGATTATAAATATTGTCCTGTCACTGGTAACCTGAGTATCTCATATGGAGTGCTATTAGTGCCAACAGAAATTTAACTGAATTAAATGTTGATTAAATGTATGTTGTCACTCTATAGTCCCAGATAGATCTAGGTGGGTTAGACGTAGTACTAGAGGGTTTGgtccaggtctacagtatatctcaATGGGTTTGGTCCAAGTCTACAGTATATCTCAATGGGTTTGgtccaggtctacagtatatctcaATGGGTTTGGTCCAGGTCTATATCTCAATGGGTTTGgtccaggtctacagtatatctcaATGGGTTTGgtccaggtctacagtatatctcaATGGGTTTGgtccaggtctacagtatatctcaATGGGTTTGgtccaggtctacagtatatctcaATGGGTTTGGTCCAGgtctacagtatatctcaATGGGTTTGGTCCAGGTCTATATCTCAATGGGTTTTGGTTCAGGCTTGCGAATGTGTCTGATGTTGGTGCCGGGCTCGGAGGGTTTGAAGGGGGCCAGGGCTCCGTAGGGCTTGGGCAGGGGCAGGGTGTCCCCCAGGGGGATGTAGGCGTTGGGTCGGGCCTCGGCCGTGGTGTACACCCCACTAGGGAGCTgg
>TU1512320
TTCAAATATACCTGCTGTTTAATGAGCTTGTGTTGAGAATCTAAAGGCCCTGTGATGATTGGCTGCTACACTACTAGATTATAAATATTGTCCTGTCACTGGTAACCTGAGTATCTCATATGGAGTGCTATTAGTGCCAACAGAAATTTAACTGAATTAAATGTTGATTAAATGTATGTTGTCACTCTATAGTCCCAGATAGATCTAGGTGGGTTAGACGTAGTACTAGAGGGTTTGgtccaggtctacagtatatctcaATGGGTTTGgtccaggtctacagtatatctcaATGGGTTTGgtccaggtctacagtatatctcaATGGGTTTGGTCCAGgtctacagtatatctcaATGGGTTTGGTCCAGGTCTATATCTCAATGGGTTTTGGTTCAGGCTTGCGAATGTGTCTGATGTTGGTGCCGGGCTCGGAGGGTTTGAAGGGGGCCAGGGCTCCGTAGGGCTTGGGCAGGGGCAGGGTGTCCCCCAGGGGGATGTAGGCGTTGGGTCGGGCCTCGGCCGTGGTGTACACCCCACTAGGGAGCTgg
>TU1512325
TTCAAATATACCTGCTGTTTAATGAGCTTGTGTTGAGAATCTAAAGGCCCTGTGATGATTGGCTGCTACACTACTAGATTATAAATATTGTCCTGTCACTGGTAACCTGAGTATCTCATATGGAGTGCTATTAGTGCCAACAGAAATTTAACTGAATTAAATGTTGATTAAATGTATGTTGTCACTCTATAGTCCCAGATAGATCTAGGTGGGTTAGACGTAGTACTAGAGGGTTTGgtccaggtctacagtatatctcaATGGGTTTGgtccaggtctacagtatatctcaATGGGTTTGgtccaggtctacagtatatctcaATGGGTTTGgtccagGTCTATATCTCAATGGGTTTGgtccaggtctacagtatatctcaATGGGTTTGgtccaggtctacagtatatctcaATGGGTTTGGTCCAGGTCTATATCTCAATGGGTTTTGGTTCAGGCTTGCGAATGTGTCTGATGTTGGTGCCGGGCTCGGAGGGTTTGAAGGGGGCCAGGGCTCCGTAGGGCTTGGGCAGGGGCAGGGTGTCCCCCAGGGGGATGTAGGCGTTGGGTCGGGCCTCGGCCGTGGTGTACACCCCACTAGGGAGCTgg
>TU1512326
TTCAAATATACCTGCTGTTTAATGAGCTTGTGTTGAGAATCTAAAGGCCCTGTGATGATTGGCTGCTACACTACTAGATTATAAATATTGTCCTGTCACTGGTAACCTGAGTATCTCATATGGAGTGCTATTAGTGCCAACAGAAATTTAACTGAATTAAATGTTGATTAAATGTATGTTGTCACTCTATAGTCCCAGATAGATCTAGGTGGGTTAGACGTAGTACTAGAGGGTTTGgtccaggtctacagtatatctcaATGGGTTTGGTCCAAGTCTACAGTATATCTCAATGGGTTTGgtccaggtctacagtatatctcaATGGGTTTGGTCCAGGTCTATATCTCAATGGGTTTGgtccagGTCTATATCTCAATGGGTTTGgtccaggtctacagtatatctcaATGGGTTTGgtccaggtctacagtatatctcaATGGGTTTGGTCCAGGTCTATATCTCAATGGGTTTTGGTTCAGGCTTGCGAATGTGTCTGATGTTGGTGCCGGGCTCGGAGGGTTTGAAGGGGGCCAGGGCTCCGTAGGGCTTGGGCAGGGGCAGGGTGTCCCCCAGGGGGATGTAGGCGTTGGGTCGGGCCTCGGCCGTGGTGTACACCCCACTAGGGAGCTgg
>TU1512327
TTCAAATATACCTGCTGTTTAATGAGCTTGTGTTGAGAATCTAAAGGCCCTGTGATGATTGGCTGCTACACTACTAGATTATAAATATTGTCCTGTCACTGGTAACCTGAGTATCTCATATGGAGTGCTATTAGTGCCAACAGAAATTTAACTGAATTAAATGTTGATTAAATGTATGTTGTCACTCTATAGTCCCAGATAGATCTAGGTGGGTTAGACGTAGTACTAGAGGGTTTGgtccaggtctacagtatatctcaATGGGTTTGGTCCAAgtctacagtatatctcaATGGGTTTGGTCCAGgtctacagtatatctcaATGGGTTTGgtccaggtctacagtatatctcaATGGGTTTGgtccaggtctacagtatatctcaATGGGTTTGGTCCAGgtctacagtatatctcaATGGGTTTGGTCCAGGTCTATATCTCAATGGGTTTTGGTTCAGGCTTGCGAATGTGTCTGATGTTGGTGCCGGGCTCGGAGGGTTTGAAGGGGGCCAGGGCTCCGTAGGGCTTGGGCAGGGGCAGGGTGTCCCCCAGGGGGATGTAGGCGTTGGGTCGGGCCTCGGCCGTGGTGTACACCCCACTAGGGAGCTgg
>TU1512330
TTCAAATATACCTGCTGTTTAATGAGCTTGTGTTGAGAATCTAAAGGCCCTGTGATGATTGGCTGCTACACTACTAGATTATAAATATTGTCCTGTCACTGGTAACCTGAGTATCTCATATGGAGTGCTATTAGTGCCAACAGAAATTTAACTGAATTAAATGTTGATTAAATGTATGTTGTCACTCTATAGTCCCAGATAGATCTAGGTGGGTTAGACGTAGTACTAGAGGGTTTGgtccaggtctacagtatatctcaATGGGTTTGgtccaggtctacagtatatctcaATGGGTTTGGTCCAGgtctacagtatatctcaATGGGTTTGgtccaggtctacagtatatctcaATGGGTTTGGTCCAGGTCTATATCTCAATGGGTTTTGGTTCAGGCTTGCGAATGTGTCTGATGTTGGTGCCGGGCTCGGAGGGTTTGAAGGGGGCCAGGGCTCCGTAGGGCTTGGGCAGGGGCAGGGTGTCCCCCAGGGGGATGTAGGCGTTGGGTCGGGCCTCGGCCGTGGTGTACACCCCACTAGGGAGCTgg

Function

NR:

description
coiled-coil domain-containing protein 146

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1512319 False 706 TUCP 0.47 2 72480405 72481169
TU1512320 False 551 lncRNA 0.48 3 72480405 72481169
TU1512325 False 610 lncRNA 0.47 3 72480405 72481169
TU1512326 False 637 TUCP 0.47 2 72480405 72481169
TU1512327 False 615 TUCP 0.47 4 72480405 72481169
TU1512330 True 551 lncRNA 0.48 3 72480405 72481169

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
fgl2a fgl2 coding downstream 53448 72421569 ~ 72426957 (-)
LOC110490625 LOC106596128 coding downstream 165144 72306866 ~ 72315261 (-)
LOC110490622 LOC106595912 coding downstream 199403 72271178 ~ 72281002 (-)
LOC110499807 lsm8 coding downstream 210910 72265690 ~ 72269495 (-)
LOC110499794 LOC106609728 coding downstream 255280 72210976 ~ 72225125 (-)
LOC110531900 LOC106576463 coding upstream 770 72481939 ~ 72493287 (-)
LOC110531910 gsap coding upstream 19245 72500414 ~ 72533138 (-)
LOC118938847 NA coding upstream 110493 72591662 ~ 72592173 (-)
LOC110499730 LOC106609820 coding upstream 253847 72735016 ~ 72737438 (-)
LOC110490677 LOC106576365 coding upstream 373853 72855022 ~ 72916247 (-)
G1324568 NA non-coding downstream 73246 72406895 ~ 72407159 (-)
G1324565 NA non-coding downstream 83715 72396365 ~ 72396690 (-)
G1324561 LOC106599346 non-coding downstream 89286 72390119 ~ 72391119 (-)
G1324560 NA non-coding downstream 90879 72389290 ~ 72389526 (-)
G1324558 NA non-coding downstream 98146 72381969 ~ 72382259 (-)
G1324605 NA non-coding upstream 42 72481211 ~ 72481462 (-)
G1324606 NA non-coding upstream 4203 72485372 ~ 72497281 (-)
G1324608 NA non-coding upstream 47156 72528325 ~ 72528635 (-)
G1324620 NA non-coding upstream 72737 72553906 ~ 72554360 (-)
G1324569 NA other downstream 72636 72407421 ~ 72407769 (-)
G1324512 NA other downstream 143421 72335360 ~ 72336984 (-)
G1324464 typh other downstream 220053 72240548 ~ 72260352 (-)
LOC110490626 LOC106576575 other downstream 312247 72162661 ~ 72192809 (-)
LOC110500989 LOC106576674 other downstream 329468 72022817 ~ 72150996 (-)
G1324805 NA other upstream 424280 72905449 ~ 72906351 (-)
G1325752 NA other upstream 1194169 73675338 ~ 73677653 (-)
G1325780 NA other upstream 1253512 73734681 ~ 73735097 (-)

Expression


Co-expression Network