G1325999


Basic Information

Item Value
gene id G1325999
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048579.1
NCBI id CM023233.2
chromosome length 81569517
location 74361915 ~ 74366138 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1514274
gtggttactacagtagaggtggtttcaggtagtggttactatggtagaggtggtttcaggtagtggttactatggtagaggtggtttcaggtagtggttactacggtagaggtggtttcaggtagtggttactatgGTAGAGGTGGTTACTAcggtagaggtggtttcaggtagtggttactacagtagaggtggtttcaggtagtggttactacagtagaggtggtttctggtagtggttactacagtagaggtggtttcaggtagtggttactacagtagaggtggtttcaggtagtggttactacagtagaggtggtttcaggtagtggttactacagtagaggtggtttcaggtagtggttactacagtagaggtggttactacagtagaggtggtttcaggtagtggttactacggtagaggtggtttctggtagtggttactacggt
>TU1514276
ggtagtggttactacagtagaggtggtttcaggtagagttggtttcaggtagtggttactacagtagaggtggtttcaggtagtggttactacggcagaggtggtttcaggtagcggttactacagtagaggtggtttcaggtagtggttactacagtagaggtggtttcaggtagtggttactacagtagaggtggtttcaggtagtggttactacagtagaggtggtttcaggtagtggttactacagtagaggtggtttcaggtagtggttactacagtagaggtggttactacggtagaggtggtttcaggtagtggttactacagtagaggtggtttcaggtagtggttactacggtagaggtggtttctggtagtggttactacggt
>TU1514275
gtggttactacagtagaggtggtttcaggtagtggttactatggtagaggtggtttcaggtagtggttactatggtagaggtggtttcaggtagtggttactacagtagaggtggtttctggtagtggttactacagtagaggtggtttctggtagtggttactacagtagaggtggtttcaggtagtggttactacagtagaggtggtttcaggtagtggttactacagtagaggtggtttctggtagtggttactacagtagaggtggtttc

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1514274 False 453 lncRNA 0.46 3 74361915 74364349
TU1514276 False 393 lncRNA 0.47 3 74361915 74366138
TU1514275 True 274 lncRNA 0.45 2 74363960 74364349

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110511321 lemd3 coding downstream 105906 74218902 ~ 74256009 (-)
LOC110513406 LOC106576618 coding downstream 148787 74167198 ~ 74213128 (-)
LOC110527628 dera coding downstream 376414 73972321 ~ 73985501 (-)
LOC118938901 NA coding downstream 432115 73920453 ~ 73929800 (-)
LOC118938851 LOC106575061 coding downstream 459784 73890918 ~ 73902131 (-)
LOC110514977 NA coding upstream 53790 74419928 ~ 74421766 (-)
LOC118938856 LOC106576675 coding upstream 154961 74521099 ~ 74552198 (-)
LOC118938855 LOC106576675 coding upstream 236804 74602942 ~ 74607316 (-)
LOC110514334 mdm2 coding upstream 408309 74774447 ~ 74797613 (-)
LOC110516942 LOC106576641 coding upstream 434425 74800563 ~ 74805861 (-)
G1325935 NA non-coding downstream 6752 74354801 ~ 74355163 (-)
G1325996 NA non-coding downstream 23241 74338457 ~ 74338674 (-)
G1325985 NA non-coding downstream 60849 74298891 ~ 74301066 (-)
G1325981 NA non-coding downstream 84191 74275973 ~ 74277724 (-)
G1325980 NA non-coding downstream 86263 74274505 ~ 74275652 (-)
G1326001 NA non-coding upstream 3057 74369195 ~ 74369471 (-)
G1325915 b2m non-coding upstream 9163 74375301 ~ 74395568 (-)
G1326002 NA non-coding upstream 12463 74378601 ~ 74379215 (-)
G1325926 NA non-coding upstream 29632 74395770 ~ 74396463 (-)
G1326006 NA non-coding upstream 34878 74401016 ~ 74405343 (-)
G1325863 LOC106584099 other downstream 359166 74002447 ~ 74002749 (-)
G1325780 NA other downstream 626818 73734681 ~ 73735097 (-)
G1325752 NA other downstream 684262 73675338 ~ 73677653 (-)
G1326070 NA other upstream 356451 74722589 ~ 74723400 (-)
G1326095 NA other upstream 406161 74772299 ~ 74773953 (-)
G1326164 NA other upstream 686611 75052749 ~ 75053357 (-)

Expression


Co-expression Network