XLOC_032216


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_032216
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 40004595 ~ 40017137 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00064913
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00064913 True 12543 lncRNA 0.36 1 40004595 40017137

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_032215 itpr1a coding upstream 13041 39923052 ~ 39991554 (+)
XLOC_032214 endou coding upstream 92155 39905021 ~ 39912440 (+)
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XLOC_032212 smarcc2 coding upstream 137925 39836474 ~ 39866670 (+)
XLOC_032211 c1ql4b coding upstream 173506 39812475 ~ 39831089 (+)
XLOC_032217 CU467879.1 coding downstream 26478 40043615 ~ 40049445 (+)
XLOC_032218 slc4a8 coding downstream 337287 40354424 ~ 40405934 (+)
XLOC_032219 ghrl coding downstream 420850 40437987 ~ 40439615 (+)
XLOC_032220 BX936393.2 coding downstream 431497 40448634 ~ 40451840 (+)
XLOC_032221 zgc:152986 coding downstream 450425 40467562 ~ 40470521 (+)
XLOC_032210 AL954698.1 non-coding upstream 287037 39700200 ~ 39717558 (+)
XLOC_032209 AL954698.2 non-coding upstream 337023 39666347 ~ 39667572 (+)
XLOC_032208 NA non-coding upstream 463147 39532478 ~ 39541448 (+)
XLOC_032204 NA non-coding upstream 625861 39370335 ~ 39378734 (+)
XLOC_032222 CU463231.2 non-coding downstream 458574 40475711 ~ 40481777 (+)
XLOC_032225 NA non-coding downstream 528721 40545858 ~ 40551992 (+)
XLOC_032231 NA non-coding downstream 635768 40652905 ~ 40656046 (+)

Expression


Co-expression Network