XLOC_032225


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_032225
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 40545858 ~ 40551992 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

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RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00064915 False 3956 lncRNA 0.38 6 40545858 40551992
TCONS_00064914 False 4471 lncRNA 0.38 8 40545858 40551992
TCONS_00062945 False 362 processed_transcript 0.39 2 40545865 40546975
TCONS_00064917 False 2920 lncRNA 0.40 8 40545865 40551992
TCONS_00064916 False 2474 lncRNA 0.40 7 40545865 40551992
TCONS_00064918 False 1758 lncRNA 0.40 4 40545884 40551992
TCONS_00064677 False 1501 lncRNA 0.40 2 40548976 40550550
TCONS_00064679 False 421 lncRNA 0.43 2 40550004 40550550
TCONS_00064678 True 328 lncRNA 0.46 3 40550004 40550550

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_032224 prkcda coding upstream 1651 40523370 ~ 40544207 (+)
XLOC_032223 fgd5b coding upstream 46059 40482330 ~ 40499799 (+)
XLOC_032222 CU463231.2 coding upstream 64081 40475711 ~ 40481777 (+)
XLOC_032221 zgc:152986 coding upstream 75337 40467562 ~ 40470521 (+)
XLOC_032220 BX936393.2 coding upstream 94018 40448634 ~ 40451840 (+)
XLOC_032226 ddi2 coding downstream 2559 40554551 ~ 40563509 (+)
XLOC_032227 si:ch73-15b2.5 coding downstream 11856 40563848 ~ 40572550 (+)
XLOC_032228 uqcc2 coding downstream 21373 40573365 ~ 40577109 (+)
XLOC_032229 frs3 coding downstream 35559 40587551 ~ 40606273 (+)
XLOC_032230 slc6a11a coding downstream 77074 40629066 ~ 40646203 (+)
XLOC_032217 CU467879.1 non-coding upstream 496413 40043615 ~ 40049445 (+)
XLOC_032216 NA non-coding upstream 528721 40004595 ~ 40017137 (+)
XLOC_032213 NA non-coding upstream 663631 39874524 ~ 39882227 (+)
XLOC_032231 NA non-coding downstream 100913 40652905 ~ 40656046 (+)
XLOC_032242 NA non-coding downstream 432605 40984597 ~ 40986135 (+)
XLOC_032245 NA non-coding downstream 528518 41080510 ~ 41082985 (+)
XLOC_032251 AL732567.2 non-coding downstream 642695 41194687 ~ 41194801 (+)
XLOC_032256 dre-let-7j non-coding downstream 902799 41454791 ~ 41454873 (+)

Expression


Co-expression Network