G1329514


Basic Information

Item Value
gene id G1329514
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048579.1
NCBI id CM023233.2
chromosome length 81569517
location 79675523 ~ 79679348 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1519058
gcggtgttgctagatggcagtggtcttggttagcggtgttgctagatggcagtggtctttgttagcggtgttgctagatggcagtggtcttggttagcggtgttggtagatggcagtggtcttggttagcggtgttgctagatggcagtggtcttggttagcggtgttgctagatggcagtggtctttgttagcggtgttgctagatggcagtggtcttggttagcggtgttgctagatggcagtggtcttggttagcggtgttgctagatgccagtggtcttggttagcggtgttgctagatggcagtggtcttggttagcggtgttgctagatgCCAGTGGTCTTCATTAGCGATGTTGCTATatggcagtggtcttggttagcggtgttgctagatggcaATGGTCTTGGTCAGAGgtgttgctagatggcagtggtcttggttagcggtgttgctagatggcaATTGTCTTAGTTAGCAGTGTTGCTAGATGTAGtggttagcggtgttgctagatggcagtggtcttggttagcggtgttgctagatggcagtggtcttggtaagcggtgttgctagatggcagtggtcttggttagcggtgttgctaTATGGCAGGggttagcggtgttgctagatCCAGTGTTTAGCGGTGTTGCTAGATTGCAGGGGTCTTGGTtagcagtgttgctagatggcagtggttagtggtgttgctagatggcagtggtcttggttagcAGTGTTACTAGATGGCAGtggttagcggtgttgctagatggcagtggtctttgttagcggtgttgctagatggcagtggtcttggttagcggttttgctagatggcagtggtcttagttagcggtgttgctagatggcagtgttcttggttagcggtgttgctagatggcagtgTTCTTGGTTAGtggtgttgctagatggcagtggtcttggttagcggtgttgctagatggcagtgTTCTTGGTTAGtggtgttgctagatggcagtggtcttggttagcggtgttgctagatggcagtggtcttggttagcggtgttgctagatggcagtggtcttggttagcggtgttgctagatggcagtggtcttggttagcggtgttgctagatggcagtggtcttggttagtggtgttgctagatggcaggGGTCTTGGATAGCGGTGTTGCTAGATGCcagtggtcttggttagcgGTGTTGCTAGAAGGCAGTGGTCTTGGTTAGTGGTGTTGCTAGATGGTAGTAgtcttggttagcggtgttgctatatggcagtggtcttggttagTGGTGTTGCTAGATGGTTGTAGTCTTGGTTAGagGTGTTGCTAGTtggcagtggtcttggttagTGGTGTTGCTAGATGGTAGTAgtcttggttagcgGTGTTACTAGATGTCAGTGGTCTTTGTTAGAGGTGTTGCTATACGGCAATGCCAGTAGATGACCAGTAGACGGCAGAAAGTGCCTAGTAACAGCAAcagtctctcatctctctttgtGGAATAGGAAGCTGCTATAGTAAACAGGAAGTGACGGCTGCTTAGCTGTTCCCCCCCAATCCCTCCAATCGTCCTCCCTCCtctgctcttcctctcccctccctctgttctccagACTGAATATAGAACTGTGATGATGTTGATGGCCTGGAGTGTCGTGCAGACTGTGTTTTCGGTTTTCtttgaggatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgatggagataGCTGGGTAGACAGGCTGTATTGAGGCAGAGGGGCTATGAACAAAAGGTCTAGTGCTGCAGGaaggacagagcagagagagagatggagagagaagagagagatagtggagggagagagagagaggaggagaagagagagatagtggagggagagagagagatggagagagaagagagagatagtggagggagagagagagaggaggagaagagagaga

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1519058 True 2046 lncRNA 0.50 6 79675523 79679348

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110513674 LOC106593057 coding downstream 52097 79618502 ~ 79623426 (-)
LOC118938874 NA coding downstream 62652 79609180 ~ 79612871 (-)
LOC110536863 LOC105029310 coding downstream 186395 79487003 ~ 79489128 (-)
LOC118938873 LOC106590959 coding downstream 335518 79307180 ~ 79340005 (-)
LOC118938905 NA coding downstream 757390 78878740 ~ 78918133 (-)
LOC118938877 LOC106594098 coding upstream 12270 79691618 ~ 79695469 (-)
LOC110510401 LOC106592932 coding upstream 231334 79910682 ~ 80084406 (-)
LOC110510850 NA coding upstream 455606 80133088 ~ 80139431 (-)
LOC110510397 LOC106596262 coding upstream 471669 80151017 ~ 80231658 (-)
LOC118938879 LOC106591974 coding upstream 472755 80152103 ~ 80153698 (-)
G1329494 NA non-coding downstream 67948 79605318 ~ 79607575 (-)
G1329484 NA non-coding downstream 70643 79604612 ~ 79604880 (-)
G1329492 NA non-coding downstream 80032 79595213 ~ 79595491 (-)
G1329490 NA non-coding downstream 85191 79588644 ~ 79590332 (-)
G1329527 NA non-coding upstream 40213 79719561 ~ 79721145 (-)
G1329495 NA non-coding upstream 42154 79721502 ~ 79751236 (-)
G1329528 NA non-coding upstream 45011 79724359 ~ 79725951 (-)
G1329534 NA non-coding upstream 67650 79746998 ~ 79749396 (-)
G1329538 NA non-coding upstream 90453 79769801 ~ 79838810 (-)
LOC118938876 NA other downstream 4377 79667754 ~ 79691305 (-)
G1329481 NA other downstream 107551 79567334 ~ 79567972 (-)
G1329475 NA other downstream 132370 79542794 ~ 79543153 (-)
G1329004 NA other downstream 599987 79075290 ~ 79075536 (-)
G1328987 NA other downstream 644567 79029667 ~ 79030956 (-)
G1329577 NA other upstream 200060 79879408 ~ 79880360 (-)
LOC110517959 LOC106593769 other upstream 578199 80242189 ~ 80268839 (-)

Expression


Co-expression Network