G1329538


Basic Information

Item Value
gene id G1329538
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048579.1
NCBI id CM023233.2
chromosome length 81569517
location 79769801 ~ 79838810 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1519090
ctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagtctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagtctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcatgtagcctatatatacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtaGTCTATAGATA
>TU1519102
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>TU1519097
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>TU1519100
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>TU1519111
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>TU1519103
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>TU1519101
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>TU1519106
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>TU1519107
agcctatataaacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagctggtcctgtagtctatatatacatactggtcctgtagtctatatatacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagctggtcctgtagccggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagctggtcctgtagtctatatatacatactggtcctgtag
>TU1519093
actggcctacctggttaaataaaggtgttctcaactggtctacctggttaaataaaggtgttctcaactggtctacctggttaaataaaggtgttctcaactggtctacctggttaaataaaggtgttctcaactggcctacctggttaaataaaggtgttctcaactggcctacctggttaaataaaggtgaaataaatgaatACAAATGACATGATGATCACTCAAGGAGATGGAGCCTCATTCAGCATATACCATTAATTgccctgtagcctatagatacatactggtcctgtagctggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggccctgtagcctatagatacatactggtcctgtagctggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagtctatagaaacatactggtcctgtagcctatatatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagcctatatatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagtctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagctggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatatatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtaacctatagaacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagtctatagaaacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagcctatattaacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagctggtcctgtagcctatattaacatactggtcctgtagtctatatatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagctggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagtctatagaaacatactggtcctgtagcctatatatacatactggtcctgtagcctatatatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagtctatagaaacatactggtcctgtagcctatagaacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagctggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagctggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggccctgtagcctatagatacatactggtcctgtagctggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatatatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagctggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatatatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagaacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagtctatagaaacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagcctatattaacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagctggtcctgtagcctatattaacatactggtcctgtagtctatatatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagctggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagtctatagaaacatactggtcctgtagcctatatatacatactggtcctgtagcctatatatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagtctatagaaacatactggtcctgtagcctatagaacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagctggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagctggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggccctgtagcctatagatacatactggtcctgtagctggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatatatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagtctatagaaacatactgATCCTGTAGcatatagatacatactggtcctgtggctggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagaacatactggtcctgtagcctatatatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagtctatataaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatataaacatactggtcctgtagcctatagaacatactggtcctgtagcctatataaacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatataaacatactggtcctgtagcctatatatacatactggtcctgtagtctatagaaacatactggtcctgtagtctatagaacatactggtcctgtagtctataggacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagcctatagaacatactggtcctgtagctggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagtctatagaacatactggtcctgtggtctatagaacatactggtcctgtagtctatagaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagtctatagaacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagcctatagaacatactggtcctgtagctggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagaacatactggtcctgtagctggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagcctatagaacatactggtcctgtagctggtcctgtagcctgtagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctata
>TU1519112
ctatatatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagtctatatatacatactggtcctgtagtctatagaaacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagctggtcctgtagtctatagaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagctggtcctgtagcctatagaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagctggtcctgtagcctatagaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagtctatagaacatactggtcatgtagcctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatac
>TU1519098
agcctatataaacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagctggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctttagtctatagatacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctttagtctatagatacatactggtcatgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagtctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatatatacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagaacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagcctacagaaacatactggtcctgtag
>TU1519096
actggcctacctggttaaataaaggtgttctcaactggtctacctggttaaataaaggtgttctcaactggtctacctggttaaataaaggtgttctcaactggtctacctggttaaataaaggtgttctcaactggcctacctggttaaataaaggtgttctcaactggcctacctggttaaataaaggtgaaataaatgaatACAAATGACATGATGATCACTCAAGGAGATGGAGCCTCATTCAGCATATACCATTAATTgccctgtagcctatagatacatactggtcctgtagctggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggccctgtagcctatagatacatactggtcctgtagctggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagtctatagaaacatactggtcctgtagcctatatatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagcctatatatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagtctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagctggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatatatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtaacctatagaacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagtctatagaaacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagcctatattaacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagctggtcctgtagcctatattaacatactggtcctgtagtctatatatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagctggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagtctatagaaacatactggtcctgtagcctatatatacatactggtcctgtagcctatatatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagtctatagaaacatactggtcctgtagcctatagaacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagctggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagctggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggccctgtagcctatagatacatactggtcctgtagctggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatatatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagctggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatatatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagaacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagtctatagaaacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagcctatattaacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagctggtcctgtagcctatattaacatactggtcctgtagtctatatatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagcctatatatacatactggtcctgtagcctatatatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagtctatagaaacatactggtcctgtagcctatagaacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagctggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagctggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggccctgtagcctatagatacatactggtcctgtagctggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatatatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagtctatagaaacatactgATCCTGTAGcatatagatacatactggtcctgtggctggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatagaacatactggtcctgtagcctatatatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagtctatataaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagcctatagaaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatataaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagtctatagaaacatactggtcctgtagtcaatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagcctatagaacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagcctatatatacatactggtcctgtagcctatatatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagtctatagaaacatactggtcctgtggtCTATAGATACAtgctggtcctgtagcctatatatacatactggtcctgtagcctatatatacatactggtcctgtagtctatagatacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatatatacatactggtcctgtagcctatagatacatactggtcctgtagcctatatatacatactggtcctgta

Function

NR:

description
PREDICTED: proline-rich extensin-like protein EPR1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1519090 False 399 lncRNA 0.40 2 79769801 79824166
TU1519102 False 370 lncRNA 0.41 2 79769801 79823689
TU1519097 False 978 lncRNA 0.40 3 79822851 79829964
TU1519100 False 577 lncRNA 0.40 2 79822851 79827627
TU1519111 False 339 lncRNA 0.40 2 79824213 79824887
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TU1519101 False 2427 lncRNA 0.41 2 79825798 79838810
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TU1519093 False 4415 lncRNA 0.41 3 79826474 79838810
TU1519112 False 618 lncRNA 0.41 2 79827693 79829964
TU1519098 False 922 lncRNA 0.41 2 79828682 79831389
TU1519096 True 3813 lncRNA 0.41 3 79830045 79838810

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118938877 LOC106594098 coding downstream 74332 79691618 ~ 79695469 (-)
LOC118938876 NA coding downstream 78496 79667754 ~ 79691305 (-)
LOC110513674 LOC106593057 coding downstream 146375 79618502 ~ 79623426 (-)
LOC118938874 NA coding downstream 156930 79609180 ~ 79612871 (-)
LOC110536863 LOC105029310 coding downstream 280673 79487003 ~ 79489128 (-)
LOC110510401 LOC106592932 coding upstream 71872 79910682 ~ 80084406 (-)
LOC110510850 NA coding upstream 296144 80133088 ~ 80139431 (-)
LOC110510397 LOC106596262 coding upstream 312207 80151017 ~ 80231658 (-)
LOC118938879 LOC106591974 coding upstream 313293 80152103 ~ 80153698 (-)
LOC118938880 NA coding upstream 384211 80223008 ~ 80224268 (-)
G1329495 NA non-coding downstream 18565 79721502 ~ 79751236 (-)
G1329534 NA non-coding downstream 20405 79746998 ~ 79749396 (-)
G1329528 NA non-coding downstream 43850 79724359 ~ 79725951 (-)
G1329527 NA non-coding downstream 48656 79719561 ~ 79721145 (-)
G1329562 NA non-coding upstream 2504 79841314 ~ 79842116 (-)
G1329565 NA non-coding upstream 7567 79846377 ~ 79847087 (-)
G1329570 NA non-coding upstream 20239 79859049 ~ 79859479 (-)
G1329577 NA non-coding upstream 40598 79879408 ~ 79880360 (-)
G1329555 NA non-coding upstream 66618 79905428 ~ 79905749 (-)
G1329481 NA other downstream 201829 79567334 ~ 79567972 (-)
G1329475 NA other downstream 226648 79542794 ~ 79543153 (-)
G1329004 NA other downstream 694265 79075290 ~ 79075536 (-)
G1328987 NA other downstream 738845 79029667 ~ 79030956 (-)
LOC110517959 LOC106593769 other upstream 418737 80242189 ~ 80268839 (-)

Expression

G1329538 Expression in all Baseline Samples

Bar chart with 20 bars.
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying values. Range: 0 to 60.
End of interactive chart.

G1329538 Expression in each Bioproject

Bar chart with 17 bars.
G1329538 Expression in each Sample
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying Expression. Range: 0 to 1500.
End of interactive chart.

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