LOC110491796


Basic Information

Item Value
gene id LOC110491796
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048580.1
NCBI id CM023234.2
chromosome length 78541548
location 29503409 ~ 29511609 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XR_005036501.1
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>XR_002468904.2
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Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XR_005036501.1 False 768 mRNA 0.42 4 29503409 29511609
XR_002468904.2 True 5784 mRNA 0.38 3 29503710 29511609

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
irf3 irf-3 coding upstream 10507 29481644 ~ 29492902 (+)
LOC110491795 LOC106579416 coding upstream 23295 29424341 ~ 29480114 (+)
nrg3b LOC106579414 coding upstream 149949 28924817 ~ 29353460 (+)
si:ch211-214e3.5 LOC106579413 coding upstream 645608 28833364 ~ 28857801 (+)
LOC110492866 LOC106521360 coding upstream 895508 28579369 ~ 28607901 (+)
LOC110491797 LOC106579418 coding downstream 22433 29534042 ~ 29629011 (+)
LOC110491799 LOC106578370 coding downstream 202669 29714278 ~ 29727319 (+)
LOC110491800 LOC106579437 coding downstream 264831 29776440 ~ 29779141 (+)
LOC110491801 if3ei coding downstream 395683 29907292 ~ 29925164 (+)
LOC110491802 cssa19h10orf105 coding downstream 630820 30142429 ~ 30144341 (+)
G1360998 NA non-coding upstream 94603 29408548 ~ 29408806 (+)
G1360978 NA non-coding upstream 113811 29389311 ~ 29389598 (+)
G1360967 NA non-coding upstream 121567 29381638 ~ 29381842 (+)
G1360950 NA non-coding upstream 135326 29367836 ~ 29368083 (+)
G1360336 NA non-coding upstream 483813 29005353 ~ 29019596 (+)
G1361033 NA non-coding downstream 3843 29515452 ~ 29515694 (+)
G1361046 NA non-coding downstream 117539 29629148 ~ 29650224 (+)
G1361114 NA non-coding downstream 144852 29656461 ~ 29656668 (+)
G1361155 NA non-coding downstream 229142 29740751 ~ 29741079 (+)
G1361517 NA non-coding downstream 313904 29825513 ~ 29825718 (+)
G1358698 kif22 other upstream 1456019 28046682 ~ 28047390 (+)
LOC110491776 LOC106579398 other upstream 1557568 27902972 ~ 27986259 (+)
LOC110491768 LOC106579066 other upstream 1926317 27561141 ~ 27595350 (+)
G1358292 NA other upstream 2171134 27329311 ~ 27332275 (+)
mpp3b LOC106579097 other upstream 3188608 26283071 ~ 26314809 (+)
G1361207 NA other downstream 291045 29802654 ~ 29804368 (+)
G1361671 NA other downstream 431832 29943441 ~ 29943756 (+)
LOC110492869 LOC106599969 other downstream 1192038 30700999 ~ 30704172 (+)
G1362902 fgfr2 other downstream 1443000 30954609 ~ 30955975 (+)
G1363401 NA other downstream 1722884 31234493 ~ 31235386 (+)

Expression


Co-expression Network