LOC110492655 (LOC106566410)



Basic Information


Item Value
gene id LOC110492655
gene name LOC106566410
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048580.1
NCBI id CM023234.2
chromosome length 78541548
location 70380329 ~ 70394365 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>XM_021567090.2
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>XM_021567088.2
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Function


NR:

description
PREDICTED: TBC1 domain family member 22B-like isoform X2

GO: NA

KEGG:

id description
K20360 TBC1D22, GYP1; TBC1 domain family member 2

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021567090.2 False 6405 mRNA 0.40 12 70380329 70394365
XM_021567088.2 True 6449 mRNA 0.41 13 70380342 70394365

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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LOC110492657 hck coding upstream 285062 70078693 ~ 70095267 (+)
LOC118939577 LOC106566421 coding upstream 311003 70043248 ~ 70069326 (+)
si:ch211-148l7.4 LOC106566411 coding downstream 420 70394785 ~ 70402610 (+)
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LOC110492662 NA coding downstream 31735 70426100 ~ 70427552 (+)
si:ch211-207e14.4 LOC106566413 coding downstream 38533 70432898 ~ 70443987 (+)
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G1405719 NA non-coding upstream 18435 70361637 ~ 70361894 (+)
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G1405789 NA non-coding downstream 147223 70541588 ~ 70546404 (+)
G1405805 NA non-coding downstream 172927 70567292 ~ 70571205 (+)
G1405676 NA other upstream 122899 70256822 ~ 70257430 (+)
G1405605 LOC106566425 other upstream 248028 70129921 ~ 70132301 (+)
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G1405218 NA other upstream 793423 69585989 ~ 69586906 (+)
G1405216 NA other upstream 796703 69580729 ~ 69583626 (+)
G1406381 NA other downstream 575250 70969615 ~ 70972604 (+)
G1406424 NA other downstream 808077 71202442 ~ 71206092 (+)
G1406505 NA other downstream 815907 71210272 ~ 71210764 (+)
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G1406508 NA other downstream 851208 71245573 ~ 71246023 (+)

Expression



Co-expression Network