LOC110492786 (LOC105023799)



Basic Information


Item Value
gene id LOC110492786
gene name LOC105023799
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048580.1
NCBI id CM023234.2
chromosome length 78541548
location 70541550 ~ 70754162 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>XM_036947697.1
CAGTCGCACTTGCGTTCAGGCAGTAGCCTATGTGAAAGAATGCAGAAATGGGTGGAGTTGTTCGTTGTGAGATTTTACTTTTTCAAACGCTCGCCAGTAGATATCACTTACTCtgcctgaagacagagagagaagagcacaCTGTGACTTGGTTTGAACTGCACCATTATAAATCAATTGACCAAACAGTTACTTTGCGTTTCCATTAGATACGAGCTTTCTGTATAGTGGTGTATATATCGAATGGAGAGCACTTCACAGATTTGGCTGAACTTCGGATCTCCTGTTCTCATCTGCTCATCCACTGAAGGTTGGTCCCTCTTGTTCTCAGTGGAAAGGTCGCTGCGGACTCGCGCCTGGCTTAGGGACCGCGTGAGAATTGGTGAAACGCTCGAGAGTGATAGACTTGCACCCGGTCAGGCTGAGTGAACAGGGGAGTTGTCCCGGGTCTCCCGCGCGCATGGAGGGAGACGTAATGGACAAGCTGGATAGCATGGCTGCGGTGTGTGACTTCGATCCCATTGCGGGAAAAATCCCGGCAACCAAGGTGGAGATCACAGTGTCATGCAGGGATCTATTAGACAGAGACACATTCTCCAAATCTGATCCATTGGTGGTGTTGTACACTCAGGGGGTGGAGACCAAACAGTGGCGAGAGTTTGGGAGAACGGAGGTGATTGACAATACTCTGGATCCAGACTTTGTCAGGAAGTACATCTTGGACTACTTCTTTGAAGAGAAGCAGAATCTACGCTTTGACGTATATGACATTGATTCCAAAAGTCCAGATCTGGCAAAGCATCCCTCCGACATTGACGACTTCTTGGGGCAGGTGTTCTGTACCTTGGGAGAGATTGTAGGATCACCCGCCAGTCGACTGGAGAAACCTCTGGGTGGTATCCTTGGGAAGAAATGTGGCACCATCATCCTGTCAGCCGAGGAGTTGGGGAACTGCAGAgaAGTTGCCACCATGCAGTTCTGTGCCCACAAGTTGGACAAGAAGGACTTCTTTGGGAAGTCGGACCCCTTTATGGTGTTCTATAGGAGTAATGAAGATGGGACGTGTACTATTTGCCATAAGACAGAGGTTGTGAAGAACACTTTGAACCCAGTTTGGCAGGCCATCTCCATCCCTGTCAGAGCACTCTGCAATGGAGACTTCGATAGGACAATCAAGGCAGAGGTGTACGACTGGGACAGAGATGGAAGCCATGACTTCATCGGTGAATTCACCACCAGCTACCGAGACCTGTCCCGGGGCCAGAGCCAGTTCAATGTGTACGAGGTGGTGAACGCCAAGAAGAAGTTCAAGAAGAAGAGATACATCAACTCTGGGACGGTGACTTTGCTGTCTTTCACGGTGGAGTCAGAACACACCTTCCTGGACTACATCAAAGGAGGAACCCAGATTCACTTCACAGTGGCCATTGATTTCACTGCATCCAATGGTAACCCGTCCCAGTCCACCTCTCTACACTACATGAACCCGTACCAGATGAATGCATACGCCATGGCCCTGAAGGCTGTAGGAGAGATCATTCAGGACTATGACAGTGATAAGATGTTCCCTGCTCTGGGGTTCGGGGCCAAGCTGCCCCCTGATGGACAAGTCTCCCATGAGTTCCCCTTGAATGGCAACATAGAGAACCCCTACTGCAACGGAATGGAGGGGATTCTACAAGCATACCATCAGAGTCTAAAGACTGTACAACTCTACGGACCCACCAACTTCGCTCCGGTTGTCAACCACGTGGCAAAGTACGCAGCGGCCGTACAAGACGGTTCTCAGTACTTTGTCCTGCTCATCATCACAGACGGAGTCATATCAGACATGGCCCAGACCAAGGAGGCCATTGTCAACGCTGCTAAGCTTCCAATGTCTATCATCATTGTTGGAGTCGGCCAAGCTGAGTTTGATGCCATGGTGGAGCTTGACGGTGATGACATCAGAATCTCCTCGCGAGGGAAGCTGGCAGAGAGAGACATTGTACAGttTGTTCCGTTCAGAGACTACATGGACCGGACAGGAAACCACGTGTTGAGTATGGCCCGGCTAGCCAAGGACGTCCTGGCTGAGATTCCTGAACAGCTCATCCTCTACATGAAGAGTAGAGGCATCAAACCCTGCCTCCTGCCTCCACTCAATGAGGAACCAGGCCCTGAAGACCAGGACCACGCCCAGACCACCCCTGTCTGAGCCCCAGACCTACCCCCATCTGAGGCGCCTACCCTGGGGAAGGAGGTCGCGGTAGGATGGGTGGTAGACTGGATGGTGGACCCCCCTCATGGAGGGATGCAAAACGTAAATGTGAAAATGCTTACAAGgcacttttttttctttctcatgcTGAACAAATTGATAAGACTCCATTTTGTTTGGCGTCGAGACTGTTTTGAGGGAAAAAGATGAAGATCAGGGAGTTTTCCTTTTGAGTTTCATCTCCTGACGGAAGGGCAACGAGGGGGATGAGAATTGGAGagtcacagaggaggaggagtagacggGAGAAAAACAGAGCAGTGACGTAAACTAATGTTAGACGTTGGCAGTCAGAGCTGTCAAAGTGGCGACGTAACAGGTAGCATGTTTTAGACGGAGAGGGTGTTTTTGAGTACATTAATTATTAGAGCGTGCCAGTTTGCATCACGTTTGTGTATATGATACATTCTAGAGTGGTGGTGTATGTTGGACTAAGGCATCACCTGTATAATGTCCTATCTATTGTAAGAAACTACAGCATCTATTCATGTTGGGGATAATATTTGttcttttattattatttattaatatTTTACCATCACGCTTTtttggggggaggagggggatcaATGCTATAAATGATTGTTAATTTATACTTTGAAGAGTACTGTAATATAAAGCATGTGGTAGATAGAAACTATCCAACTGTTTAGGAATAGTTGTAAAAGATCCAGATGAATGCTTTTACCTTTTGGATTGTGACAGTTTGTTTACACAGATGATCGGATGTTTGTATGATCGTTTAACGTCAGGCACCCTGTACAAGACATACTTACCCTATATATTTACAATAGGCATCAACAAAATGCACTAACAGTCCAAATAAAAAGCACAAAGGTCATATTCAATACATATATTGATCAAGTGAAATATATACCACAATTATATACTAGCGACCAACAGTTACCCCTCAAAGACAATGGAAAGGATTGCACAGCAACAAAATGTCTTCCAGTTCTAGAACGTTGTCATGAATGAGAATGAATCTAGAATCTAGTTTACTTCACATTCTGCGTTATTATTGTTTACACATCCCCTCGTACAACGACCAGAGCCACATCTTCAAAAGGCATAGTATGTCCATAGTATTAGTATGCAGCGATGTATGTCgtctagctagctgcattcacaCATATATTGGTTGGTATAATCCTTCTCGTTGTATTTTGTATAATCCTTCTCGTATGATGTTGTTGATTCTGTTTGATTCTTTCTTTAACCTCTGCACACCGTGCCATGGAAATTCTTAGTGTATATAGAGCACAGAGAAGGCAACAGATGTTGATGAAACACCTTTtgattactagaaacaaacttGGTTTACCCTTTTATCAGTGGAtgaattgtcagagtagaggaccttgtgcatttcaggtaaaataacaatccaatgtttatatcccaggacaaattagttagcaacagcaagctagctagctaaattgctatgaatgtttaatgcttttcaaactgtccccaaattaatagaGTTGGTTCAAACTTCGTTTTGAATATTTCAAACTGCGTGTCATGATCGCTCGCGTCTGGTGTGGATAGACAAGATCAACATGCACGATGGCGTACTCGGACAAACGCGCGTgcccggtctagtcagcatgtaaGAAGTCATTAAAATGGAGTCGATAGAAACAGTAACTGCATAAAGAGCAGTTGATACAGTGTACAATCTATTTTACTCACTTCATCTGGACTACTGATACTGATTTCAAACTTGCTGCCAGGGATGTATTGCCATCTTTAATTTAAGTTGTTGATATATATGTGACCGACTGGGGTTCAAATCTGGGTTTCCTATAcaccacaagactgtgttagcccgctGAGATAAAGCAGTTAGCTCAAGTAGCCAACGCAAGTCTTCAAGTTTCGGACAAGGTTACTCATCGTGTGTGCGTTGTTCCAAAACACATTTGAcgttttttgtcatttagcagacgctcaaGAGCAATTATTGACAgctttttcacctagtcggcttggggattcgattCCAGCGTCATTTAGGTCTCTgccccaacgctcttaactgctaggctacctgccgccctgttATATCTAGTCACGTTTAAGTTGTTGATGTAGTTCCATGTTTAAGTTATTGATGTAGTTCCACGTTTAAGTTGTTGATGTAGTTCCACGTTTAAGTTATTGATGTAGTTCCATGTTTAAGTTATTGATGTAGTGCCACGTTTAAGTTGTTGATGTAGTTCCATGTTTAAGTTGTTGATGTAGTGCCACGTTTAAGTTGTTGATGTAGTTCCATGTTTAAGTTGTTGATGTAGTTCCATGTTTAAGTTGTTGATGTAGTTCCATGTTTAAGTTGTTGATGTAGTTCCATGTTTAAGTTGTTGATGTAGTTCCACGTTTAAGTTGTTGATGTAGTTCCATGTTTAAGTTATTGATGTAGTGCCACGTTTAAGTTGTTGATGTAGTTCCATGTTTAAGTTGTTGATGTAGTTCCATGTTTAAGTTGTTGATGTAGTTCCATCTTTAAGTTGTTGATGTAGTTCCATGTTTAAGTTGTTGATGTAGTTCCATGTTTAAGTTGTTGATGTAGTTCCATGTTTAAGTTGTTGATGTAGTTCCATGTTTAAGTTGTTGATGTAGTTCCATCTTTAAGTTGTTGATGTAGTTCCATGTTTAAGTTGTTGATGTAGTTCCATGTTTAAGTTGTTGATGTAGTTCCATGTTTAAGTTGTTGATGTAGTTCCATGTTTAA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>XM_036947698.1
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Function


NR:

description
PREDICTED: copine-5 isoform X2

GO: NA

KEGG:

id description
K24523 CPNE5_8_9; copine 5/8/9

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_036947698.1 True 6798 mRNA 0.42 20 70541550 70754162

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
LOC118939579 NA coding downstream 82991 70455694 ~ 70552795 (-)
tmed4 LOC106566412 coding downstream 115515 70422429 ~ 70426035 (-)
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LOC110492660 LOC106566428 coding downstream 319998 70216538 ~ 70221552 (-)
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G1405172 NA other downstream 1023437 69517755 ~ 69518113 (-)
G1405016 nsfl1c other downstream 1261191 69277827 ~ 69280359 (-)
G1404974 LOC106566438 other downstream 1334392 69203286 ~ 69207158 (-)
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Expression



Co-expression Network