LOC118939585



Basic Information


Item Value
gene id LOC118939585
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048580.1
NCBI id CM023234.2
chromosome length 78541548
location 71843147 ~ 71850380 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>XR_005036618.1
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>TU1607197
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>TU1607198
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>TU1607200
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Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU1607197 False 1741 lncRNA 0.42 2 71844789 71846619
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TU1607200 True 1801 lncRNA 0.42 2 71844789 71846619

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
LOC118939604 NA coding downstream 36823 71806270 ~ 71806324 (-)
LOC110492672 LOC106566404 coding downstream 78726 71741976 ~ 71764421 (-)
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LOC110492674 rbm15 coding upstream 2477 71852857 ~ 71858795 (-)
alx3 LOC106566393 coding upstream 15970 71866350 ~ 71881855 (-)
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trnat-agu-126 NA coding upstream 120678 71971058 ~ 71971131 (-)
G1406945 NA non-coding downstream 132412 71710480 ~ 71710735 (-)
G1406926 LOC106566399 non-coding downstream 137303 71700953 ~ 71705844 (-)
G1406943 NA non-coding downstream 143009 71698985 ~ 71700138 (-)
G1406938 NA non-coding downstream 149180 71693716 ~ 71693967 (-)
G1406936 NA non-coding downstream 150532 71692357 ~ 71692615 (-)
G1407029 NA non-coding upstream 44017 71894397 ~ 71894704 (-)
G1407031 NA non-coding upstream 45547 71895927 ~ 71896240 (-)
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G1407089 NA non-coding upstream 130785 71981165 ~ 72035462 (-)
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G1406228 NA other downstream 1100968 70735647 ~ 70742179 (-)
LOC110492660 LOC106566428 other downstream 1621891 70216538 ~ 70221552 (-)
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rps21 LOC106572905 other upstream 2322493 74172873 ~ 74182639 (-)

Expression



Co-expression Network