G1330550


Basic Information

Item Value
gene id G1330550
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048580.1
NCBI id CM023234.2
chromosome length 78541548
location 59122 ~ 112394 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1520582
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>TU1520586
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1520582 False 10559 lncRNA 0.35 4 59122 112394
TU1520584 False 2826 lncRNA 0.35 4 95497 112394
TU1520580 False 2029 lncRNA 0.35 4 101683 112394
TU1520581 False 2140 lncRNA 0.35 3 101683 112394
TU1520586 True 4690 lncRNA 0.34 5 101683 112394

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110491242 LOC106578741 coding downstream 19888 132282 ~ 150267 (+)
LOC110491220 NA coding downstream 217770 330164 ~ 425574 (+)
LOC110517286 sipa1l2 coding downstream 345878 458272 ~ 775818 (+)
egln1a NA coding downstream 929544 1041938 ~ 1087375 (+)
nid1a LOC106578745 coding downstream 1046043 1158437 ~ 1239914 (+)
G1330548 LOC106591119 non-coding upstream 20997 24932 ~ 38125 (+)
G1330658 NA non-coding downstream 43857 156251 ~ 216307 (+)
G1330671 NA non-coding downstream 62933 175327 ~ 175911 (+)
G1330684 NA non-coding downstream 93249 205643 ~ 208826 (+)
G1330682 NA non-coding downstream 98562 210956 ~ 211950 (+)
G1330702 NA non-coding downstream 128957 241351 ~ 241896 (+)
G1330556 NA other upstream 23085 33661 ~ 36037 (+)
G1330676 NA other downstream 75323 187717 ~ 190795 (+)
G1330718 NA other downstream 207479 317523 ~ 328224 (+)
G1330834 NA other downstream 227682 340076 ~ 341076 (+)
G1331652 NA other downstream 1326393 1438787 ~ 1439125 (+)

Expression


Co-expression Network