XLOC_032860 (BX927081.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_032860
gene name BX927081.1
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 24296039 ~ 24301324 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00063868
gcgcgacactgaGTGACACAGCTCACTACGCATGCCACTAGTaccgagtgacacatgacagtgaaAACCGGGAGGGTTGGCGCAAGATGGCGACCTAGACGGTTGTGCTGGTTTGAGCTCTGAGCCATCTGGAGGAGTTTACATTGTTTGGACGAATATGTATCACTGAAATCAAGGTGGGGACTTTTATAAGTAGTAACTCAGCTAATTTCGATGTCTAAACCCCAGTTATAGACTGAACTATACGCAGATTCAAGAGTTCAGTGCACGTGCCGTCTGCAAAAATGCCAAAGAGTAAAGACCGAAAGTTGTTCTCTTCGCTTTTCGAACCTTCTGGAGACCACGATTCGTTGTCAAATACACCATCAAGCAGTCCTCTCTCAAAAAAACTTTGTCAGGATGAAGATGATCCTAAAGTGTCTAATGTTGACATACTGCGTGCTGTTAATTCCCTCAGTGATCGATTTGCGTCGATGGAACAACAACTTGCCCAGAATTCGATTACGATTGCTAATCTTTCAAAGGCTGTTGATTTTGTCGGAGAGGAGTTTAAATCGATGTCCACACGAGTTAAGGCAAATGAAAATAAGGTCACGCAAATTCAGCAGGTGGTTCAAGTGGTTCAAAGCAAATGCGATCAAGCCGAGATCTACAGCAGAAGGTGGAATTTAAGGATCATCAATCTCAAAGAAACCGATGGAGAAAATATCAGAAGCAAAGTGCTGGAAATCCTTAAAGTTCTCACTCCAGACGAAGCAGATGACATCCGTTTTTATGTTGACACCATTCACAGAATTGGTCGTCCCGGAGCAGGTGGAAATCGCCCTCGTCCGGTCATAATTCAGTTTGCGCTTCGAGTGTACAGGGAGAAAGTCTGGAAAGCGGCTAGGGATCATCCCGCTCTTAAGGAAAGAGGTGTTCGTCTGATGGAGGACTTGACGTTTGCAGAAAGACAACAGAGGAGGTTGCTATGGCCAAAAGTAAAAGAGGCAAGAGAACAGGGCAAGAGAGCTCACTTTCGTGGTGCAGATGCTTTTATTGATGGCAAAAAACTGTCCGTTGAGGAGTTTGAAGCTGAAAAGTGAACACTGACAGAAAACTACTATTTGGTCGCTGGCTCTTGTCAGTGTCAAAAGTTAACTCATTCGTTCAGTCTGATCGTCCGGGTAATGTGACTGTTCCAGGTTAACAACTGTTCAACACCGGCTGCTTTGTGAATTTATTTGTTTCAGGGTTCTTTATACATTTATACTAATTCTGACATccaaatttttgttttatgtctgattttattttcagtaattttaaaattgtttcaCTTAATGTTAGGGGTTTACGAGACAGCATTAAaagaaaatctatttttatttttgttagacATACTAACGCGAATATAATTTTCTTACAAGAGACACATTCATGTGAAAATGATGTTAGGTGGTGGCGATCTCAGTGGGGTGATCAAATTTTCTGTTGTCATGCTTCACATCATTCAGCAGGTGTCGCTGTTCTGTTAAATAAGTTCAAAGGTGATGTGTTAGAATCGGTTAATTCACCAGAAGGGAGATGGATACTGATAACTGTTAAGTTGGATAATTCAGTTTTTATCTTAGTAAATGTTTATGGTTATAATTCATCAGTCCAAGCCAAAAATATGTCCACAGAGTTATCTAACGCTATTTTAGTTTTACAGAGAAAATATAAAGACGCTTTTTTGTTAATTGGAGGCGATTTTAATGATGCCCCAGATGACTTCATAGATCGCTTTCCCCCTCATGCTTCATCCTCTTcaaaatttaaaattacaaatttctTGTCCTCTTATCTGTCTGTTGTGGATATTTggagatttttaaattttagtgaTAAATGTTACTCCTGGAGCAATTCCTCTAGATCGTTACAATCACGGATTGATTTATGGTTGATCAATCCTGAATGTATTCAATATGTAACAGAAATTTCATATACTTATGCTCCCCTTACAGATCATAAAATGATTGTTCTGTCTCTCTCTGgctctaaaattaataataaaagtctGCGGGGATATTGGAAGTTAAATAATAGTTTGCTGAATAATGAAAATTTTAATATGCAGGTTAAAGGTATCGCACAACACATTTTTGTCAATAATCAAATGTCACATTCTAGCAAATGGGAATTATTTAAGTTTAAAGTTAGACAGTCAGCCATATATTTTAGTAAACAAGTTAAAAACAATAACTTGAATAAGGAACGGTCATTGATGAAcgagttaaatatttatttaaaaaaagagaatctAACAGAGGATGAAAAAGTTAGATTAGAAACTATAAAATCTGAAATTGACCAAATTTACGTTGATACTGCAAAAGGTGCTTTTATTCGTTCAAGAGCCAAATGGTtagaaaaaggagaaaaaaatacaagTTACTTTTTTTCACTAGAAAAGCGGAATTATAAAAGGCAAATGATTTCCTCACTTAAAATTGATGATGTTATTACTTCAAATCCTAAGTTAATTTCTACATATGTAGAGTCCTTTTATTCCCAATTATATAAATCTGTATTTCAAAAGGataaatgttataatttttttgaatCTGTTAAATCTTCTGTCTCTCCTATTTCACCTCAATTTAAAGATACTTGCGAAGAAAATCTGAATAAGCTTGAGATGGAAATAGCATTACGTTCAATGAAACAAAATAAGTCTCCAGGCTCAGATGGTCTTTCAGTGGAGTTCTATCTGCATTTTTGGAATATAATTGAAAATCCTTTATTTGAAATGTATAAGGAATCTATTGAGCTAAAGGAGTTACCAACCTCTTTGAAACAAGGATTAATAACCTTGCTTCCTAAACCTAATAAAGACCTTATGATTTTAGACAACTGGCGCCCAATAACACTACTTAATGTAGATTATAAATTATTATCTTTGATTTATGCAAAACGCTTAAAGGAAGGTCTAAATGAAATTATTAGCGAGTATCAAACTGGTTTCATGGCTGGGCGACACATAAGTTGGAATATTAGATTGATTCTGGATTTGTTAGATTATTCTAATTTGATTGAGTCTGAAGCATTACTACTTTTTCTGGATTTTCATAAAGCTTTCGACACTATTGAGCACCAATTTATGTTTATGgcattaaaatattttggttttggggacAGGTTTATTTCTATTATGGAATTGTTTCATAGAGATATCAATAGCTCTATAAATTTATACCCAAATACTTCTAAAAGGTTCCCCATATGTAGAGGAGTCCGTCAAGGATGTCCTATTGCtccatttttatttcttcttGTTGTAGAGTTCCTGtccatttatgttttaaaatcatCAGCAATTCAAGGTATTaccatatttaataaagaaataaggatATCTCAACTTGCTGATGATACCGTTCTTTTTCTAAAAGATAAAGATCAGTTACCTGCAGCTTTGCAATTAGTAAATGATTTCTCTATTGCATCTGGATTAACCTTAAATGTGACAAAATGTGAAATTATATCACTTTATAATTCTGAAGTAAAAAGTTTATGTAATATACCTGTTAAAAAGACGGtaaaatatttaggaataagTATAACAAAAAATTTATCAGAGAGACAAGATTTAAATTTTtcccctaaaataaaaaaagctcaaGGTATATTTAATAACTGGCTTCAAAGGGATTTATCTATTATTGGAAGAGTTTTGTTGACTAAAGTAGAAGGAGTGTCTAGATTTGTTTACCCGGCTTTATCCCTTTTTGTTCAAGAtgctatttgtaaaaaaattaatgatttatttatacaatttgttTGGAGAAACAGACATCATCATTTAAGAAAGGAAGTAATTCAAGGGCCAAGAAAAGATGGGGGATTTgaacttttagatttttttgacttAAACTATACTTTTAAAGTTAAATGGCTTAGGAATTGTTTATTGAAAGCAGACTCAATTTGGTTTTTTATACCatataatattttcaaaaaggttGGAGGATTGCGTTTTTTACTAACATGTGATTATTCTGTTAAGAAACTACCAGTAACATTGTCCAATTTTTATCAACAAGCTCTTAAAGCATGGAAGCTGTGTTATGTGCACAATTTCTCACCCCATAAAGCAATTTTGTGGAATAATTCTTATATAACTGTTAATCGGAAATCTCTCTACCTACAAAATTGGACAGATAAAGGTATTTTTTTCTTATCTGATATTTTGGACCAATCAGCTAATTTACTTTCTTACAAAAATTTTATGGAAAGATGGTCATTCCCTATTAAATTTAAAGAATATAACTATGTAACAAAAGCCATCCCCTCTGGTTTGTTAATGCTAATGAGAAGTCATATGTCTTCATATAgtatcaatattaataaaaatgatccTGCTCTTTACTTAAATGGGGTAGACTTTTGTagtaaaaaatgtacaaacaaagttattagattaatattttgcAAAAATAGAGCATTACAACCTAGAGGAAAATTTTTTTGGAATGTATATTTCCATGATGTTGTGTGGAAAAAAGCTTGGATGCTTCCTTTTCGTTTTTGCTTAGGTAACAAGTACAgggaattacatttaaaaattttacataACATTTATGTTTGTAATCAAACATTAACTAAATTTACGCAGACGGATGGAAACTGTTCATTTTGTTTACATCTCCCAGAGACGTTGATTCATCTTTTTTATGAATGTGAATATTCAAAAAAATTTTGGGAAGATCTAtcattatatgtaaaaaaaaaatcaggttttagTTGCAATTTGACCCCCaaagacattattttttattttgtttcaaacaATTTATCTGTGGAATTTTTATTGAATCTTTTAATTTTGTTCGGTAAATTTCATATTCATAAATGCAGGTTAAATAACTCTAAACCTTGTTTAAAGGTTGCTATTGCAGACTTTCATTTGTATATAGAATCGCTCCAATATATTAAGAGcgaaaaatgtataaatacaattattgtggCAAAGGagc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Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000105300

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00063868 True 5286 mRNA 0.33 1 24296039 24301324

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_032859 NA coding downstream 76862 24217928 ~ 24219177 (-)
XLOC_032858 si:ch73-389b16.2 coding downstream 92059 24152816 ~ 24203980 (-)
XLOC_032857 si:ch73-389b16.1 coding downstream 152116 24140757 ~ 24143923 (-)
XLOC_032856 scinla coding downstream 192373 24090950 ~ 24103666 (-)
XLOC_032855 RDH8 coding downstream 208760 24076954 ~ 24087279 (-)
XLOC_032861 si:dkeyp-85h7.1 coding upstream 16707 24318031 ~ 24320268 (-)
XLOC_032862 ephx4 coding upstream 27951 24329275 ~ 24358732 (-)
XLOC_032863 brdt coding upstream 63354 24364678 ~ 24392915 (-)
XLOC_032864 BX004768.2 coding upstream 484503 24785827 ~ 24785943 (-)
XLOC_032865 BX005463.1 coding upstream 540846 24842170 ~ 24842286 (-)
XLOC_032850 NA non-coding downstream 874301 23420169 ~ 23421738 (-)
XLOC_032849 CR376761.1 non-coding downstream 901140 23394843 ~ 23394899 (-)
XLOC_032848 NA non-coding downstream 1081245 23210551 ~ 23214794 (-)
XLOC_032846 NA non-coding downstream 1277559 23018053 ~ 23018480 (-)
XLOC_032866 NA non-coding upstream 548769 24850093 ~ 24869146 (-)
XLOC_032870 CR790380.1 non-coding upstream 886699 25188023 ~ 25188783 (-)
XLOC_032872 NA non-coding upstream 966627 25267951 ~ 25268308 (-)

Expression


Co-expression Network