XLOC_032869 (lrrc8db)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_032869
gene name lrrc8db
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 25167250 ~ 25189739 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00063882
ATGGGAATGTTTACCCTCACAGAAGTTGCCTCTCTAAATGATATCCAGCCAACTTATAAGATACTGAAACCATGGTGGGACGTCTTTATGGATTACTTGGGTGTGGTCATGCTTATGCTGGCCATATTTGCCGGGACCATGCAGATAACCAAAGATCAGGTGGTTTGCCTTCCTGTTCTAGAATCATTGGAGGACCAAGCCCCTGTGCCCACAGAAAGGCCACCAGGCAAAGCTTTTGGCTCAGGGACAGGAGGAGGCCATGTGACACTggcagctgcacctttagcaagcAACGAACAAACCGACAGTGTTGTCCAACACTTCCCACAGTCGTCTGCTGTCAGGCAACCTCAGCCCACGGGTTTACGAACAAATCTGGATTTTCAGCAGTATGTCTTTGTAAATCAGATGTGCTACCATGTTGCCCTCCCATGGTATTCAAAGTACTTTCCATATCTAGCTCTCATTCACACAATTGTTCTTATGGTAAGCAGTAACTTTTGGTTCAAGTATCCAAAGACCAGTTccaaaattgagcattttgtgTCTATTTTGGGTAAGTGTTTTGAGTCTCCTTGGACAACCAAAGCATTGTCTGAGACGGCCTGTGAAGACTCAGAAGAGAATAAACAGAGATTGACTGGAGCCTCTACATTACCAAAGCATCTTTCAACCAGCAGTGAGGAGGGAAGTCCAAATCAGTCCACGCCAATGCTTGCAAAATCTAGCATTAAATTTTCTGCAGAGAAGCCTGTCATTGAAGTTCCAAGCATGACTATACTTGACAAGAAAGATGGAGAGCAAGCTAAAGCCCTTTTTGAGAAAGTGAGGAAATTTCGCACACATGTTGAAGACAGCGACACGATCTACAAACTCTATGTAGCTCAAACTATTATTAAAACTGTCAAATTTATTCTGATTCTGTGTTACACCATGACCTTTGTCACCTCCATTAAATTCGACCATGATTGTGAGCCAGAAATTAAGCATTTGACTGGATACAACAAATTTAAATGCACCCACAACATGGCTTTCATGTTGAAAAAGCTCCTTGTTAGCTACATTGTCCTCATTTTCGTTTATGGCCTGGTTTGCATTTACACTCTTTTTTGGCTGTTTAGACGGCCACTTAAGGAATACTCATTTGAAAAGGTTAGAGAAGAAAGCAGTTTTAGTGACATCCCAGATGTGAAAAATGACTTTGCTTTCCTCCTTCACATGGTCGACCAGTATGACCAGCTGTACTCGAAACGTTTTGGTGTCTTTCTCTCAGAGGTAAGCGAGAACAAACTGAGGGAAATCAGCTTAAATCATGAGTGGACCTTTGAGAAACTACGGCAACACGTGACTCGCAATGCACAGGATAAGCTTGAGCTGCATCTTTTCATGCTCTCGGGTGTTCCTGATGCAGTTTTTGACCTCACTGATATAGAGGTCCTAAAACTGGAACTCATCCCAGAGGCACGTATCACAGCAAAAATTTCCCAGATGATAAACCTCACCGAATTGCACTTTTACCACTGTCCCGCCAAAGTTGAACAGACTGCATTCAGTTTCCTCCGCGATCACCTCCGGTGCCTTCACGTCAAGTTTACGGATGTAGCAGAGATTCCCACTTGGGTTTACATGCTGAAGAACTTAAGAGAGCTCTACTTGGTGGGAAACTTGAACTCTGAGAATAACAAAATGATAGGATTAGAGTCCCTCAGGGACTTGAGGCATCTAAAGGTCCTACATCTGAAGAGCAACCTTACCAAGATCCCAACTAACATTACAGACTTATCACCCCACCTGATCAAACTTGTGGTTCACAACGATGGTACTAAACTCTTGGTGTTAAATAGCTTGAAAAAGATGATGAACCTTTCTGACCTGGAGCTGCACAATTGTGAACTGGAGAGGATACCGCATGCAATTTTTAGCTTGACCAACCTGCAGGAGTTGGACTTAAAATCGAACAACATCCGCACCATTGAAGAGGTCATTAGCTTCCAGCACCTCAAAAGACTTAACTGCCTCAAACTGTGGCACAATAAAATCATTTCCATTCCTTTGTCCATTAGTCACGTAAAAAACCTAGAGTTCCTTTATCTGTCACATAACAAACTAGAGTCCTTGCCTACTACtctgttcaatctacttaaactGAGATACCTGGATGTTAGTCACAACTCCATTGTGGTGATTCCTCCGGAGGTTGGGTTTCTCCAGAATCTACAGCACTTTGCCATCACTGGCAACAAGGTGGAAGTGGTGCCCAAGCAGCTGTTCAAATGCACAAAGTTGCGTACCTTGTCCCTTGGGCACAACTGCATCTCGTCGCTGCCAGAGAAAATTGGACAGTTGCTTCAGCTGACTCATCTTGAGCTGAAGGGGAACTGCCTGGATCGGCTGCCTGCACAGCTCGGCCAGTGCAGGCTCTTGCGTAGAAATGGCCTCACTGTGGAAGACCACCTTTTTGACTCGTTGCCCCTAGAGGTCAAAGAGAGCATAAGTCAGGAAATCACTGCAACTTATGCTAACGGAGTGTGATCAtgattcacataaaaaaaaaaaaacaatttgaaaGAACAGTCATGGTATTTCTATCAGTTTAACACAATTAAAAAGCGCAAGAGGCAATGTTTCAGAatcctgctgtttttttttaggttttgtcCACATGAAGACATTTTTAATCCAGGACTGCGGGCATGAATGGATGTTCCAGGTATGAAGAATGAGTCCAGTATCAAAGTTTATGTTAACAGTTGTTATCACTTTCTgcacaggccaaaacaaactgcCTGTAAGCCAATGTTAAAATCTTTTGGACCTTTTTGAGAATCATTATGCCTGTCTACATGgggattttgttctttttttaatttgaattgtTATTATTTTCCCATGTTACAGTACAATAATACAGTACAACCATTTTTCAGTAGCATTTTTGTTCATTCATGTTTTCACCTGCTGTTATGCGCACAGTCTGCATCGCATGCCATGTGCATTGTGGTGCcattaatgattgtattttttccTTTGCGAAAACCCAGAACAACTTACATTTATTACAAAGTCAATTACAAATACTGTATTTGACTAAGTGGTAAAAGAAAAAAGTGAAGGAAGGAATTCTCATTTGGGGTTAGTAAAACGTGCACTAAAGTATTAATAACTGAATGTTTCCGTCAAAACAAAGTTACCATGTCCACCCAGGATCGATCAAACTGTTATTGTATATGTTATTCTTCGGTTAATGTCCATCTTTCTTTAATGATATTGTCCACCTATTCAGTTTCTAATAACCAAAATATTTTGAACTAAAAAACAATGTTCTGTGTTGAAAATGTACCAGTGTGTTTGCATTCAATTTGGGTTTGAAGATGCACAAACTAAAGGTAATCATTTGCACTGCACTGCAAGTCCTGGCAATAAATTAACTTTTCCTTCTAACATAATCTTCAATGTGGGTTACAGAAGTACTGATTAAGTTATGGCGACTTGCATGTTTTGTATATAACACTATATTATGACGGGACAGACCAGTAATGTGTATACATGTCCTTGCTGATCAAAACCTCTGATAGACATGTATAGTAAACTTGCCCTGATATTTAGTCTAACATCATATCTTTGTCTGTAAACGTGTATGACATCTGCTTAACTGTTAGCCATTGATGGCTAGTTAAAGTAATGGAAATGCTTGCATTGTGTGATTGTTTCAAGTTACCTTGCTGTTGACATACTGTGCATGGCCATGCAGTCGGCTTTTGAGGCAAATGCACAAAAAGGTGACTTGCCAAATGTTAGTAATCAATTTTCAACCAAGTGATGGGATTAAGTGTTAGATTATCCTAacctaaacttttattttgtttgattttcttagtgaaataaaaaaaaaatctgttgtcaAGATTTGAAGGAAAAGTTCAGCCAAAACCTATTTGTAACTTTGTATACTCCGCTTAATGTCATTCCAGACATATTCTTCTTTATATATTCTTTCTTTTATAGACAGCCAAACCTGACATTATTCATACCACTGGCAAATTCTGACATAaagttaaagttacttttattcgaccagcttttattttattcatttaattttttttttcgagaagaaatgacacaggcttcctCCAGAGTTACATGAGGCAtcaatggtaaaaaaataaataaataaataaaaattgccagtggtatgaataatttcaggcttgacaaTGTATTTTACAATAGTTGAATACCCAATCccacatagaaatctgatatatgtcaatatattttcaaattacatacagtatgtgacatACAAGTTCttatttaaatttgacatttttacatttatatgtcatgtgtgcaacatattattcaaaatattgcaaaaaatgctgctttcatatatatatgtatatatatatatatgtatatatatacatatatgtatatatatgtatatatacatatatgtgtatatatatatatatgtatatatatatatatatatatatatatatatatatatgtgtgtgtgtgtgtatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatattattgccatacgaacacacacaaataatgaATTTGAACAATATGTTATTAGCTGCAATATTgaaatatttgcatatattttcatGTATACAATTTCTATATGGGTTCAGAATGACACGAGGATGAGTAAATGTGACAAATTTTTAATTGTAGAAACTTTACACTTTCTACAAGTTATCAGGCTATAATAACTAAAACGCTTTCACTTTTGCACCctaataacattttataatttttttatttgatttgtatgAAGAGTAAGTGCATATGTTTGCTAGATCTCTTGAAATTTAAAAGATATTCATAATATTTGTCTTATTTATTGAAGCACTTGATGTTAACATGACGGATTAAGCGTTGTTTGCTTTTAAACCATTAATTTGTTTATGAAAGATTTGTAAAGATTGGATGACATTTCGACTCTGATGTGTGTGGACTGCAGGGTTtatagtaattaaataatttgaataatgtcCTGTTTACTTTAAAAGCATAACATTTCAGACCAAACCAAAATGAGTTCAAAAggacaaacatatttttttgtcttattcaCATTTCACAGGAGAGTTGTGTTGTCATTTTGTGGAATTGCTTTTCCCACAGTTATATTTGTCCCCCTGAAATGCTGCTGGGTCTGACCTGTAATTGGTATCTTTGTGACCCCTCAAGAATCTCAAAACATGTTGATGTCTTGCCAGCTGAGGCATGAAAATCATTTGTGGTTCATGTgtgactaataataattataaccaCATATGAATCTAAAGATGAGTTTCAGTGTTTTAGGTGATTTGAAATTATATTACTGGGTTTTGTTAAATGTAATTTCATGTTGCACTGTCAAAAATTGTTCTGTTTGATGTTTTcaatggaagttttttttttatgtagagaattattaatttgttcacTTTTTTGTCTATTAATAGTTTAACTGCGATgtacctatttaaaatgattcCACCAAAAAAATACATTGTGTCCTTTCAGGTACACTGAACACAAATTCATTCCAGCAAAGTATGTTTGTGTTTAAGAATGAAGgcaactttttgttttatttatctgcaAATGTTTTGAGGTAAATTGCTCTTCAGCCCTGAATGTAGCCTTATTTGCGTCCCTTCATTTAGACTACATTTTTGATGGAAAGGAGAATGAAGTTAGTCTGCTTTGCTCCTAATCACGTTTCGTTTGAAGATATGTTGAATTTGCAATTTTAGTACAATaaacacatcaaaaacaaatACCTCAGTTTGTGCTGTTTTAATTGTCGCTAATGGTTTCGACTTGCAATATCTAGACCAGAGACGCCTTAAgtagggcccgtgggccaaatTTGgaccattgtaacctttgatttgacccacTATCCTATCTTAGAAGAGAGTGAGAATAGTGGGGAGGGTTGGTGTGTTTTAtttctgagctacaaaaaaagcgcATTGAATTTAAATgcttcaattaaatgtaaatgaatctgattttctaaaaatgtaaatactgtctctCAACGAACAGAGGAATACATagggaaattacccatggcaattaTACGTATATCCAGCCCACTAGCATCAATCAAGTTGGGTTTTTGGCACTtcttaagaaaaagtttgggctcTGGTCTAGGATATGTTGTTCAGTCTTATTCAGTCGAATTCTTGTCTTTTAGCGCCCTCTAGAGGTGACAGACAATAACCTTTCCTGCTATGCGTGAATAGTGAAGGTGAATAGTATTTGACCATGATGTAGTTCAGCACTGAATTGGGCAGAAATTTGTTGGCATGAAAGTGTCTTATTTTATGATTCACGTAGAATAAAACAGTAGTTCTCATATTTACAaatccagtgtttttttttttttttatatgaaaccAATTGTATTGTCTGTGACAGGTATACATTACTGCTAAACTGAAGCTTTAATGTGAGGTGCTGCAGTGAAAACACTATGTTCAAACACCATTTTGGTCTTTTTGGTTTCCCTCCTTTTTTGTCTAGTGTAAAGACAGCATTAAAAACACACTTAAATGTTGCTTTTGTCacagtttattaatttgttaaatttaaattataatatattcaaaaaattaaaaagtttactcatttttttatctttaaattcTTCAGCACTTACAtcccattaattatatttttacaatactCCCCAATcagtattatatattgtttacattcatagatatttatatatttacatttcataGTTATACCTTCGTCACTTCTGTGtacatatgtgtatttatatgtcaTGTGTATGCTATGTGTATGACTTCACTttggacggcaaagtaagaatttctgtgcacatgacaataaacaaatttaattgaattgaatattaagaAGCA
>TCONS_00063883
ACACATTTCTCTCACTCGTCATTTCGCACGCATGGATGTCGGTGATGCTTTGAGGTTTTTAAAATGACAGCTCTGTTTTGAGGAATGTTTACCCTCACAGAAGTTGCCTCTCTAAATGATATCCAGCCAACTTATAAGATACTGAAACCATGGTGGGACGTCTTTATGGATTACTTGGGTGTGGTCATGCTTATGCTGGCCATATTTGCCGGGACCATGCAGATAACCAAAGATCAGGTGGTTTGCCTTCCTGTTCTAGAATCATTGGAGGACCAAGCCCCTGTGCCCACAGAAAGGCCACCAGGCAAAGCTTTTGGCTCAGGGACAGGAGGAGGCCATGTGACACTggcagctgcacctttagcaagcAACGAACAAACCGACAGTGTTGTCCAACACTTCCCACAGTCGTCTGCTGTCAGGCAACCTCAGCCCACGGGTTTACGAACAAATCTGGATTTTCAGCAGTATGTCTTTGTAAATCAGATGTGCTACCATGTTGCCCTCCCATGGTATTCAAAGTACTTTCCATATCTAGCTCTCATTCACACAATTGTTCTTATGGTAAGCAGTAACTTTTGGTTCAAGTATCCAAAGACCAGTTccaaaattgagcattttgtgTCTATTTTGGGTAAGTGTTTTGAGTCTCCTTGGACAACCAAAGCATTGTCTGAGACGGCCTGTGAAGACTCAGAAGAGAATAAACAGAGATTGACTGGAGCCTCTACATTACCAAAGCATCTTTCAACCAGCAGTGAGGAGGGAAGTCCAAATCAGTCCACGCCAATGCTTGCAAAATCTAGCATTAAATTTTCTGCAGAGAAGCCTGTCATTGAAGTTCCAAGCATGACTATACTTGACAAGAAAGATGGAGAGCAAGCTAAAGCCCTTTTTGAGAAAGTGAGGAAATTTCGCACACATGTTGAAGACAGCGACACGATCTACAAACTCTATGTAGCTCAAACTATTATTAAAACTGTCAAATTTATTCTGATTCTGTGTTACACCATGACCTTTGTCACCTCCATTAAATTCGACCATGATTGTGAGCCAGAAATTAAGCATTTGACTGGATACAACAAATTTAAATGCACCCACAACATGGCTTTCATGTTGAAAAAGCTCCTTGTTAGCTACATTGTCCTCATTTTCGTTTATGGCCTGGTTTGCATTTACACTCTTTTTTGGCTGTTTAGACGGCCACTTAAGGAATACTCATTTGAAAAGGTTAGAGAAGAAAGCAGTTTTAGTGACATCCCAGATGTGAAAAATGACTTTGCTTTCCTCCTTCACATGGTCGACCAGTATGACCAGCTGTACTCGAAACGTTTTGGTGTCTTTCTCTCAGAGGTAAGCGAGAACAAACTGAGGGAAATCAGCTTAAATCATGAGTGGACCTTTGAGAAACTACGGCAACACGTGACTCGCAATGCACAGGATAAGCTTGAGCTGCATCTTTTCATGCTCTCGGGTGTTCCTGATGCAGTTTTTGACCTCACTGATATAGAGGTCCTAAAACTGGAACTCATCCCAGAGGCACGTATCACAGCAAAAATTTCCCAGATGATAAACCTCACCGAATTGCACTTTTACCACTGTCCCGCCAAAGTTGAACAGACTGCATTCAGTTTCCTCCGCGATCACCTCCGGTGCCTTCACGTCAAGTTTACGGATGTAGCAGAGATTCCCACTTGGGTTTACATGCTGAAGAACTTAAGAGAGCTCTACTTGGTGGGAAACTTGAACTCTGAGAATAACAAAATGATAGGATTAGAGTCCCTCAGGGACTTGAGGCATCTAAAGGTCCTACATCTGAAGAGCAACCTTACCAAGATCCCAACTAACATTACAGACTTATCACCCCACCTGATCAAACTTGTGGTTCACAACGATGGTACTAAACTCTTGGTGTTAAATAGCTTGAAAAAGATGATGAACCTTTCTGACCTGGAGCTGCACAATTGTGAACTGGAGAGGATACCGCATGCAATTTTTAGCTTGACCAACCTGCAGGAGTTGGACTTAAAATCGAACAACATCCGCACCATTGAAGAGGTCATTAGCTTCCAGCACCTCAAAAGACTTAACTGCCTCAAACTGTGGCACAATAAAATCATTTCCATTCCTTTGTCCATTAGTCACGTAAAAAACCTAGAGTTCCTTTATCTGTCACATAACAAACTAGAGTCCTTGCCTACTACtctgttcaatctacttaaactGAGATACCTGGATGTTAGTCACAACTCCATTGTGGTGATTCCTCCGGAGGTTGGGTTTCTCCAGAATCTACAGCACTTTGCCATCACTGGCAACAAGGTGGAAGTGGTGCCCAAGCAGCTGTTCAAATGCACAAAGTTGCGTACCTTGTCCCTTGGGCACAACTGCATCTCGTCGCTGCCAGAGAAAATTGGACAGTTGCTTCAGCTGACTCATCTTGAGCTGAAGGGGAACTGCCTGGATCGGCTGCCTGCACAGCTCGGCCAGTGCAGGCTCTTGCGTAGAAATGGCCTCACTGTGGAAGACCACCTTTTTGACTCGTTGCCCCTAGAGGTCAAAGAGAGCATAAGTCAGGAAATCACTGCAACTTATGCTAACGGAGTGTGATCAtgattcacataaaaaaaaaaaaacaatttgaaaGAACAGTCATGGTATTTCTATCAGTTTAACACAATTAAAAAGCGCAAGAGGCAATGTTTCAGAatcctgctgtttttttttaggttttgtcCACATGAAGACATTTTTAATCCAGGACTGCGGGCATGAATGGATGTTCCAGGTATGAAGAATGAGTCCAGTATCAAAGTTTATGTTAACAGTTGTTATCACTTTCTgcacaggccaaaacaaactgcCTGTAAGCCAATGTTAAAATCTTTTGGACCTTTTTGAGAATCATTATGCCTGTCTACATGgggattttgttctttttttaatttgaattgtTATTATTTTCCCATGTTACAGTACAATAATACAGTACAACCATT
>TCONS_00063884
ATGAAATGTGTTTCTCAGGAATTAAATTGGTGCATGGATGACGTTTGATGACGTTGATTTGAGACAGAATGTTTACCCTCACAGAAGTTGCCTCTCTAAATGATATCCAGCCAACTTATAAGATACTGAAACCATGGTGGGACGTCTTTATGGATTACTTGGGTGTGGTCATGCTTATGCTGGCCATATTTGCCGGGACCATGCAGATAACCAAAGATCAGGTGGTTTGCCTTCCTGTTCTAGAATCATTGGAGGACCAAGCCCCTGTGCCCACAGAAAGGCCACCAGGCAAAGCTTTTGGCTCAGGGACAGGAGGAGGCCATGTGACACTggcagctgcacctttagcaagcAACGAACAAACCGACAGTGTTGTCCAACACTTCCCACAGTCGTCTGCTGTCAGGCAACCTCAGCCCACGGGTTTACGAACAAATCTGGATTTTCAGCAGTATGTCTTTGTAAATCAGATGTGCTACCATGTTGCCCTCCCATGGTATTCAAAGTACTTTCCATATCTAGCTCTCATTCACACAATTGTTCTTATGGTAAGCAGTAACTTTTGGTTCAAGTATCCAAAGACCAGTTccaaaattgagcattttgtgTCTATTTTGGGT

Function

symbol description
lrrc8db Predicted to act upstream of or within ion transport. Predicted to be located in plasma membrane. Predicted to be integral component of membrane. Orthologous to human LRRC8D (leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit D).

GO:

id name namespace
GO:0016020 membrane cellular_component
GO:0016021 integral component of membrane cellular_component

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-061013-487 Predicted to act upstream of or within ion transport. Predicted to be located in plasma membrane. Predicted to be integral component of membrane. Orthologous to human LRRC8D (leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit D).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000103840

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00063882 False 6979 mRNA 0.36 2 25167250 25189739
TCONS_00063883 False 2999 mRNA 0.43 2 25171308 25181012
TCONS_00063884 True 620 mRNA 0.45 2 25173671 25180438

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_032868 znf326 coding downstream 1557 25157331 ~ 25165693 (-)
XLOC_032867 si:dkey-238n5.3 coding downstream 12164 25145265 ~ 25155086 (-)
XLOC_032866 NA coding downstream 298104 24850093 ~ 24869146 (-)
XLOC_032865 BX005463.1 coding downstream 324964 24842170 ~ 24842286 (-)
XLOC_032864 BX004768.2 coding downstream 381307 24785827 ~ 24785943 (-)
XLOC_032871 lrrc8c coding upstream 98 25189837 ~ 25201810 (-)
XLOC_032872 NA coding upstream 78212 25267951 ~ 25268308 (-)
XLOC_032873 PKN2 coding upstream 122648 25312387 ~ 25384792 (-)
XLOC_032874 lmo4b coding upstream 743997 25933736 ~ 25952870 (-)
XLOC_032875 hs2st1b coding upstream 874223 26063962 ~ 26225814 (-)
XLOC_032859 NA non-coding downstream 948073 24217928 ~ 24219177 (-)
XLOC_032850 NA non-coding downstream 1745512 23420169 ~ 23421738 (-)
XLOC_032876 NA non-coding upstream 1101044 26290783 ~ 26309847 (-)
XLOC_032878 NA non-coding upstream 1372242 26561981 ~ 26674943 (-)
XLOC_032879 NA non-coding upstream 1635211 26824950 ~ 26825924 (-)
XLOC_032881 NA non-coding upstream 1845913 27035652 ~ 27038371 (-)

Expression


Co-expression Network